CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
IPO8	10526	Importin 8	12	RANBP8

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
22968445	2012	Cell line : - Source : Department of Pathology of Wrocaw Medical University. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 8 Stage : -	Laser capture microdissection,FFPE-FASP,SAX fractionation,LC-MSMS,Label-free quantitation.	Up-regulation	2.2	-

Gene Details

Chromosome: 12; NC_000012.11 (30781915..30848929, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Importins
Description	The importin-alpha/beta complex and the GTPase Ran mediate nuclear import of proteins with a classical nuclear localization signal. The protein encoded by this gene is a member of a class of approximately 20 potential Ran targets that share a sequence motif related to the Ran-binding site of importin-beta. This protein binds to the nuclear pore complex and, along with RanGTP and RANBP1, inhibits the GAP stimulation of the Ran GTPase. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]
Chromosome	12
Location	12p11.21
Start	30628981
End	30695995
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815586:c30695995-30628981 Homo sapiens chromosome 12, GRCh38.p2 Primary Assembly GTTTTCCGTACAGCAGCATGGCGGCCGCCGACGGGAGGCGGTCATAGCATCACGCCCGGGGGAAGAGGCC GCCGTAAAGGAAGCTCTGCTTCCTCTTCTTCCTTCTCCCGCCTCCCACCGGCTGTCGTAAAACGGTGAAT GGAGAGCGAGTTGTGGGGGGGAAAAAGGGAGGACAGGGGGCGCGGAGTCAGAGTGGCGCAGCAAGTGGCC GCAGGTGGCGACGGTGGCGGGGGGTGGGGTGTGAGGTAATCCAGGGGTCGCGGAAGAGGAGGCTGAGAGG GTCAAAAGAAAACTAAAGCTGCAGTCCGGCCTACTGTTCCGGGGGCCGCGGAGCCCCCACCCGGGGAGAT GGACCTCAACCGGATCATCCAGGCGCTGAAGGGCACCATCGACCCGAAGTTGCGGATTGCAGCCGAGAAC GAGCTCAACCAGGTGAGGAGAGGGTCTTCGGCGACCCTCTTCCGCCGAAGGGGCGCCCCTGCCGGCTGGC CGGGCTCCCTCTCCCCGGCGCCCCTCGTCCTCACCCCCACCGGGCTGGGGCTGACGCCTCACGGCTGGTC CCGCTCTCCGACCCCGCTGCCCCCCGGTCCAGTGGAGCAGGGCTCCCAGGATCTTTGCCGAACAGCTCGC GCACCTGTTGGCCACCTTTGCACCTTTTCGTGTCGTCTCCCTTCTCCAGGGCAGTTTGTTCTGCCTACTT GGTCCGCAAGAAGCAGTTTTTGCAACCTGTGCTAGTGTTTTCAGGGTGTGATTTATTTTCCTTAAGTGCG CGGACTTGGGGAGCAGGTGGGAATTTTACTTACAGTTCAAATCTGAGTTCAGCTTTTTTCCAAACCCAGC 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CDS Information

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Protein Information

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Molecular Wt. (Da)	95906
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Length	832
Uniprot ID	P07992
Ensembl Protein ID	ENSP00000013807

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	902
S	Phosphorylation	903
S	Phosphorylation	389
T	Phosphorylation	908

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
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Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
pfam03810	22-101	IBN_N
cl04271	22-101	IBN_N superfamily
smart00913	22-102	IBN_N
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cl20359	195-441	Cse1 superfamily
COG5656	15-996	SXM1
COG5657	1-678	CSE1

Ontology Information

HPRD ID	595
Molecular Class	Transport/cargo protein
Molecular Function	DNA repair protein (GO:0003685)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

No matching records could be found.

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
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TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
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Osteosarcoma Database GO
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