CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
HPSE	10855	heparanase	4	HPA, HSE1, HPSE1

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
21443112	2010	Cell line : - Source : - Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : TNM Stage I-IV	Immunohistochemistry and Western blotting	Up-regulation	-	HPA might be an important biomarker for malignant transformation and be involved in promoting colon carcinoma metastasis by increasing angiogenesis. Immunohistochemistry revealed that HPA was expressed at low level in normal colonic mucosa (4/78, 5.1%), but at higher level in tumor tissues (63/78, 80.7%) and closely correlated with tumor lymph node metastasis (p < 0.05).

Gene Details

Chromosome 4 - NC_000004.12 (83292461..83335153, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family
Description	Heparan sulfate proteoglycans are major components of the basement membrane and extracellular matrix. The protein encoded by this gene is an enzyme that cleaves heparan sulfate proteoglycans to permit cell movement through remodeling of the extracellular matrix. In addition, this cleavage can release bioactive molecules from the extracellular matrix. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.
Chromosome	4
Location	4q21.3
Start	83292461
End	83335153
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815594:c83335153-83292461 Homo sapiens chromosome 4, GRCh38.p2 Primary Assembly CCAGCGCTGCTCCCCGGGCGCTCCTCCCCGGGCGCTCCTCCCCAGGCCTCCCGGGCGCTTGGATCCCGGC CATCTCCGCACCCTTCAAGTGGGTGTGGGTGATTTCGTAAGTGAACGTGACCGCCACCGAGGGGAAAGCG AGCAAGGAAGTAGGAGAGAGCCGGGCAGGCGGGGCGGGGTTGGATTGGGAGCAGTGGGAGGGATGCAGAA GAGGAGTGGGAGGGATGGAGGGCGCAGTGGGAGGGGTGAGGAGGCGTAACGGGGCGGAGGAAAGGAGAAA AGGGCGCTGGGGCTCGGCGGGAGGAAGTGCTAGAGCTCTCGACTCTCCGCTGCGCGGCAGCTGGCGGGGG GAGCAGCCAGGTGAGCCCAAGATGCTGCTGCGCTCGAAGCCTGCGCTGCCGCCGCCGCTGATGCTGCTGC TCCTGGGGCCGCTGGGTCCCCTCTCCCCTGGCGCCCTGCCCCGACCTGCGCAAGCACAGGACGTCGTGGA CCTGGACTTCTTCACCCAGGAGCCGCTGCACCTGGTGAGCCCCTCGTTCCTGTCCGTCACCATTGACGCC AACCTGGCCACGGACCCGCGGTTCCTCATCCTCCTGGGGTAAGCGCCAGCCTCCTGGTCCTGTCCCCTTT CCTGTCCTCCTGACACCTATGTCTGCCCCGCCAGCCGCTCTCCTTCTTTTGCGCGGAAACAACTTCACAC CGGAACCTCCCCGCCTGTCTCTCCCCACCCCACTTCCCGCCTCTCATTCTCCCTCTCCCTCCCTTACTCT CAGACCCCAAACTGCTTTTTGGGGGGTATCATTTAAAAAATAGATTTAGGGGTTACAAGTGCAGTTCTGT 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Protein Information

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Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

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Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

No matching records from HPRD source could be found.

Pathway Information

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Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

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cl04201	171-370	Glyco_hydro_79n superfamily

Ontology Information

HPRD ID	948
Molecular Class	Enzyme: Glycosidase
Molecular Function	Receptor activity (GO:0004872)
Biological Process	Cell communication (GO:0007154); Signal transduction (GO:0007165)

SNP Information

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Drug Information

Uniprot ID DrugBank ID Name Type
Q9Y251 DB01109 Heparin SmallMoleculeDrug
Q9Y251 DB06779 Dalteparin SmallMoleculeDrug

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

Uniprot ID	DrugBank ID	Name	Type
Q9Y251	DB01109	Heparin	SmallMoleculeDrug
Q9Y251	DB06779	Dalteparin	SmallMoleculeDrug

ArrayExpress	GO
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