CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
IMMT	10989	Inner membrane protein, mitochondrial (mitofilin)	2	HMP; P87; P89; PIG4; PIG52; MINOS2; P87/89

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20089989	2010	Cell line : - Source : VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : TNM Stage II	Biochemical isolation to nano-LC-MS/MS analysis	Unknown	-	-

Gene Details

Chromosome: 2; NC_000002.11 (86371055..86422893, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	-
Chromosome	2
Location	2p11.2; 2
Start	86143932
End	86195770
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815596:c86195770-86143932 Homo sapiens chromosome 2, GRCh38.p2 Primary Assembly AATTCTCTTTAAGAGTCACAGCTGTCCATTTTCCACGTGCGGCTGAAGAATGGATTTCAGAGCGCTCTCC CTCCGGCAGTGTTCACCTAGTAACCCCTTCCGGATAAGGACCTGCAGCCCGGGCGCGACCCGGAAAGGGA ATCCGCCCTTTTCGCCTCCTTCGCGCCAATCGCCTGGAGTTGGCGTTTCCGCAGCCGGGACACAGCCCAC CCTCTAAGAGCCGCGGAGTCGGGGACGGTAGAAGGGGCCGCGCGTGCGCAGTGGCGTCCGCTGTGCTTCC GGTGCGCCGGGCGCGGACGCGGGCACGCACACACGCAAGCACGCCTCCACTTAACTCGCGCCGCCGCGGC AGCTCGAGTCCACCAGCAGCGCCGTCCGCTTGACCGAGATGCTGCGGGCCTGTCAGTTATCGGGTGTGAC CGCCGCCGCCCAGGTGAGCACTGGGGCTCCCGGAGGCGCGTGAGGAGGCTGAACTAGAACCGTCAGCGAA AAACGGGGGAGCCTTGGTCGCTGCCTAGCCTCCAGGACAAAGGCGAGCCTCAGGGCCACCCTCGTCGGGA GAGGCCCGGGCGGGCAGCTAGGCAGCCACCAGGGAGTTCGCCGGACTGGGATGACTTGAGGTTATTGCAG CAGCGGGGTGGGGTGTGGAGAGTAGCGGGAGGCGCGGCTTCGTGGGCATGTAGTCCAATCAGGGCCGCGC TGCCCCCGTCCAGGACCAATCCTGGCTGCTGGCGTCTGGGTCGCCGGTTGGGCGCGCGATAGGTTTTCAG TGCTGAAGGTCGACGGGCGAGAACTACAGTTCCCGTCAGGACGAGCGGAGCGGCGGCTTGTTGCATCCTT 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Length	2985

CDS Information

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CDS Sequence	>lcl\|NM_001100170.1_cds_NP_001093640.1_1 [gene=IMMT] [protein=MICOS complex subunit MIC60 isoform 3] [protein_id=NP_001093640.1] [location=389..2632] ATGCTGCGGGCCTGTCAGTTATCGGGTGTGACCGCCGCCGCCCAGAGTTGTCTCTGTGGGAAGTTTGTCC TCCGTCCATTGCGACCATGCCGCAGATACTCTACTTCAGGCAGCTCTGGGTTGACTACTGGCAAAATTGC TGGAGCTGGCCTTTTGTTTGTTGGTGGAGGTATTGGTGGCACTATCCTATATGCCAAATGGGATTCCCAT TTCCGGGAAAGTGTAGAGAAAACCATACCTTACTCAGACAAACTCTTCGAGATGGTTCTTGGTCCTGCAG CTTATAATGTTCCATTGCCAAAGAAATCGATTCAGTCGGGTCCACTAAAAATCTCTAGTGTATCAGAAGT AATGAAAGAATCTAAACAGCCTGCCTCACAACTCCAAAAACAAAAGGGAGATACTCCAGCTTCAGCAACA GCAGGTGATACCCTGTCGGTCCCAGCCCCTGCAGTTCAGCCTGAGGAATCTTTAAAAACTGATCACCCTG AAATTGGTGAAGGAAAACCCACACCTGCACTTTCAGAAGAAGCATCCTCATCTTCTATAAGGGAGCGACC ACCTGAAGAAGTTGCAGCTCGCCTTGCACAACAGGAAAAACAAGAACAAGTTAAAATTGAGTCTCTAGCC AAGAGCTTAGAAGATGCTCTGAGGCAAACTGCAAGTGTCACTCTGCAGGCTATTGCAGCTCAGAATGCTG CGGTCCAGGCTGTCAATGCACACTCCAACATATTGAAAGCCGCCATGGACAATTCTGAGATTGCAGGCGA GAAGAAATCTGCTCAGTGGCGCACAGTGGAGGGTGCATTGAAGGAACGCAGAAAGGCAGTAGATGAAGCT GCCGATGCCCTTCTCAAAGCCAAAGAAGAGTTAGAGAAGATGAAAAGTGTGATTGAAAATGCAAAGAAAA AAGAGGTTGCTGGGGCCAAGCCTCATATAACTGCTGCAGAGGGTAAACTTCACAACATGATAGTTGATCT GGATAATGTGGTCAAAAAGGTCCAAGCAGCTCAGTCTGAGGCTAAGGTTGTATCTCAGTATCATGAGCTG GTGGTCCAAGCTCGGGATGACTTTAAACGAGAGCTGGACAGTATTACTCCAGAAGTCCTTCCTGGGTGGA AAGGAATGAGTGTTTCAGACTTAGCTGACAAGCTCTCTACTGATGATCTGAACTCCCTCATTGCTCATGC ACATCGTCGTATTGATCAGCTGAACAGAGAGCTGGCAGAACAGAAGGCCACCGAAAAGCAGCACATCACG TTAGCCTTGGAGAAACAAAAGCTGGAAGAAAAGCGGGCATTTGACTCTGCAGTAGCAAAAGCATTAGAAC ATCACAGAAGTGAAATACAGGCTGAACAGGACAGAAAGATAGAAGAAGTCAGAGATGCCATGGAAAATGA AATGAGAACCCAGCTTCGCCGACAGGCAGCTGCCCACACTGATCACTTGCGAGATGTCCTTAGGGTACAA GAACAGGAATTGAAGTCTGAATTTGAGCAGAACCTGTCTGAGAAACTCTCTGAACAAGAATTACAATTTC GTCGTCTCAGTCAAGAGCAAGTTGACAACTTTACTCTGGATATAAATACTGCCTATGCCAGACTCAGAGG AATCGAACAGGCTGTTCAGAGCCATGCAGTTGCTGAAGAGGAAGCCAGAAAAGCCCACCAACTCTGGCTT TCAGTGGAGGCATTAAAGTACAGCATGAAGACCTCATCTGCAGAAACACCTACTATCCCGCTGGGTAGTG CAGTTGAGGCCATCAAAGCCAACTGTTCTGATAATGAATTCACCCAAGCTTTAACCGCAGCTATCCCTCC AGAGTCCCTGACCCGTGGGGTGTACAGTGAAGAGACCCTTAGAGCCCGTTTCTATGCTGTTCAAAAACTG GCCCGAAGGGTAGCAATGATTGATGAAACCAGAAATAGCTTGTACCAGTACTTCCTCTCCTACCTACAGT CCCTGCTCCTATTCCCACCTCAGCAACTGAAGCCGCCCCCAGAGCTCTGCCCTGAGGATATAAACACATT TAAATTACTGTCATATGCTTCCTATTGCATTGAGCATGGTGATCTGGAGCTAGCAGCAAAGTTTGTCAAT CAGCTGAAGGGGGAATCCAGACGAGTGGCACAGGACTGGCTGAAGGAAGCCCGAATGACCCTAGAAACGA AACAGATAGTGGAAATCCTGACAGCATATGCCAGCGCCGTAGGAATAGGAACCACTCAGGTGCAGCCAGA GTGA Download Select all
CCDS ID	-

Protein Information

Protein ID	NP_001093639.1
Protein Name	Inner membrane protein, mitochondrial (mitofilin)
Molecular Wt. (Da)	79898
Protein Sequence	>10989 MLRACQLSGVTAAAQSCLCGKFVLRPLRPCRRYSTSGSSGLTTGKIAGAGLLFVGGGIGGTILY AKWDSHFRESVEKTIPYSDKLFEMVLGPAAYNVPLPKKSIQSGPLKISSVSEVMKESKQPASQL QKQKGDTPASATAPTEAAQIISAAGDTLSVPAPAVQPEESLKTDHPEIGEGKPTPALSEASSSS IRERPPEEVAARLAQQEKQEQVKIESLAKSLEDALRQTASVTLQAIAAQNAAVQAVNAHSNILK AAMDNSEIAGEKKSAQWRTVEGALKERRKAVDEAADALLKAKEELEKMKSVIENAKKKEVAGAK PHITAAEGKLHNMIVDLDNVVKKVQAAQSEAKVVSQYHELVVQARDDFKRELDSITPEVLPGWK GMSVSDLADKLSTDDLNSLIAHAHRRIDQLNRELAEQKATEKQHITLALEKQKLEEKRAFDSAV AKALEHHRSEIQAEQDRKIEEVRDAMENEMRTQLRRQAAAHTDHLRDVLRVQEQELKSEFEQNL SEKLSEQELQFRRLSQEQVDNFTLDINTAYARLRGIEQAVQSHAVAEEEARKAHQLWLSVEALK YSMKTSSAETPTIPLGSAVEAIKANCSDNEFTQALTAAIPPESLTRGVYSEETLRARFYAVQKL ARRVAMIDETRNSLYQYFLSYLQSLLLFPPQQLKPPPELCPEDINTFKLLSYASYCIEHGDLEL AAKFVNQLKGESRRVAQDWLKEARMTLETKQIVEILTAYASAVGIGTTQVQPE Download Select all
Length	757
Uniprot ID	P11308
Ensembl Protein ID	ENSP00000288319

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
K	Acetylation	222
K	Acetylation	211
K	Acetylation	451
S	Phosphorylation	113

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
4715	NDUFB9	3264	NP_004996.1	yeast 2-hybrid	16169070
7916	BAT2	807	NP_542417.2	yeast 2-hybrid	14667819
10190	TXNDC9	15592	NP_005774.2	yeast 2-hybrid	16169070
11079	RER1	17967	NP_008964.3	yeast 2-hybrid	16169070
22948	CCT5	6468	NP_036205.1	yeast 2-hybrid	16169070
23028	KDM1A	9800	NP_001009999.1	yeast 2-hybrid	16169070
23557	SNAPIN	6111	NP_036569.1	yeast 2-hybrid	16169070
23659	PLA2G15	7128	NP_036452.1	yeast 2-hybrid	16169070
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65080	MRPL44	14763	NP_075066.1	yeast 2-hybrid	16169070
65990	FAM173A	14500	NP_076422.1	yeast 2-hybrid	16169070
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84164	ASCC2	16515	NP_115580.2	yeast 2-hybrid	16169070

Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
pfam09731	299-746	Mitofilin
PTZ00121	196-601	PTZ00121
TIGR02169	279-591	SMC_prok_A
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COG1196	254-532	Smc
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TIGR02169	263-535	SMC_prok_A
PTZ00121	200-569	PTZ00121
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COG1196	299-565	Smc
TIGR02168	264-618	SMC_prok_B
COG0419	200-565	SbcC
TIGR03185	262-530	DNA_S_dndD
pfam07227	296-498	DUF1423
PTZ00121	101-535	PTZ00121
pfam13514	195-578	AAA_27
COG1196	400-566	Smc
pfam15346	442-531	ARGLU
COG0419	205-530	SbcC
pfam00038	268-480	Filament
TIGR00618	413-531	sbcc
pfam12128	127-555	DUF3584
PRK02224	279-530	PRK02224

Ontology Information

HPRD ID	2833
Molecular Class	Motor protein
Molecular Function	Transcription factor activity (GO:0003700)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

ArrayExpress	GO
ICGC	GO
Cancer3D	GO
COSMIC	GO
NCG	GO
TSGene	GO
Tumor Gene Family of Databases	GO
CCDB	GO
G2SBC	GO
Osteosarcoma Database	GO
RCDB	GO

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