CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
SUZ12	23512	Suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila)	17	CHET9; JJAZ1

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
15231737	2004	Cell line : - Source : Medical Institute of Bioregulation Hospital, Kyushu University. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 100 CRC samples Stage : TNM Stage I-IV	Plasmid constructs and transient transfections, Immunoblotting, RT-PCR, RNA microarray	Unknown	-	Recruitment of Suz12, Ezh2 and Eed to target promoters coincides with methylation of histone H3 on Lys 27. Authors showed that HKMT-Ezh2 and Eed, two other components of the PRC2/3 complexes, colocalize to the target promoters with Suz12.
21862635	2011	Cell line : - Source : - Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	real time RT-PCR, Transfection, Matrigel invasion assay	Up-regulation	-	HOTAIR expression is associated with a genome-wide reprogramming of PRC2 function in CRC, where upregulation of this long ncRNA may be a critical element in metastatic progression. A close correlation between expression of HOTAIR and members of the PRC2 complex (SUZ12, EZH2, and H3K27me3) were found.
23001792	2012	Cell line : - Source : Cooperative Human Tissue Network (CHTN). Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	-	Up-regulation	-	-

Gene Details

Chromosome: 17; NC_000017.10 (30264044..30328057)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Zinc fingers, C2H2-type
Description	This zinc finger gene has been identified at the breakpoints of a recurrent chromosomal translocation reported in endometrial stromal sarcoma. Recombination of these breakpoints results in the fusion of this gene and JAZF1. The protein encoded by this gene contains a zinc finger domain in the C terminus of the coding region. [provided by RefSeq, Jul 2009]
Chromosome	17
Location	17q11.2
Start	31937025
End	32001045
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815581:31937025-32001045 Homo sapiens chromosome 17, GRCh38.p2 Primary Assembly GGTGAGCGGCCTCCGAAGCGGAGCGGGGCTCTGAGGAGACACTTTTTTTTTCCTCCCTCCTTCCCTCCTC TCCTCCTCCCTTCCCTTCCCCTCTCCTCCCCTCTCTCCTCCTTCCCCCCTCGGTCCGCCGGAGCCTGCTG GGGCGAGCGGTTGGTATTGCAGGCGCTTGCTCTCCGGGGCCGCCCGGCGGGTAGCTGGCGGGGGGAGGAG GCAGGAACCGCGATGGCGCCTCAGAAGCACGGCGGTGGGGGAGGGGGCGGCTCGGGGCCCAGCGCGGGGT CCGGGGGAGGCGGCTTCGGGGGTTCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGACGGCTTCGGGCGGCAAATCCGGCGG CGGGAGCTGTGGAGGGGGTGGCAGTTACTCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCGCGGCGGCAGCGGCGGGGGCT GCGGTGTTACCGGTGAAGAAGCCGAAAATGGAGCACGTCCAGGCTGACCACGAGCTTTTCCTCCAGGCCT TTGAGAGTGAGTGTGTGCGAGGCTTTGAGGGCAGGAAGACCCACTCTGCCAACACCGGGGATGGGACACT CTGCTGGGCCCCCTTCCTCCTCGGGAGTCCACTTGTGTGGTAGTGGAGGGAGGAATTGAGGGGATGTCCC CCTTTCGGAGATTACGTCTCCAGGGGATCCGGAGTCCAGGGCCTTGGGAGAGCTGGAAAAGAGGGTCCGG GCGGGTTCTTGACTCCCCCAAGATTGACGCAAGAGGCTCGGGACTGGGGCCCCACGTTCAGAGCAGGCGG CTTTTAGATGAGGAGGTAGCAGTTGAACTGAGCCGCAGTCACATCCCGAGACTGGTTCTTGTTTTCTTTC 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Length	4477

CDS Information

Location	join(223..496,3262..3308,3398..3462,10593..10661, 29123..29172,36122..36207,38458..38689,39497..39590, 45975..46080,51296..51473,56218..56309,56841..56984, 57540..57697,58540..58738,59774..59853,61634..61979)
CDS Sequence	>lcl\|NM_015355.2_cds_NP_056170.2_1 [gene=SUZ12] [protein=polycomb protein SUZ12] [protein_id=NP_056170.2] [location=223..2442] ATGGCGCCTCAGAAGCACGGCGGTGGGGGAGGGGGCGGCTCGGGGCCCAGCGCGGGGTCCGGGGGAGGCG GCTTCGGGGGTTCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGACGGCTTCGGGCGGCAAATCCGGCGGCGGGAGCTGTGG AGGGGGTGGCAGTTACTCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCGCGGCGGCAGCGGCGGGGGCTGCGGTGTTACCG GTGAAGAAGCCGAAAATGGAGCACGTCCAGGCTGACCACGAGCTTTTCCTCCAGGCCTTTGAGAAGCCAA CACAGATCTATAGATTTCTTCGAACTCGGAATCTCATAGCACCAATATTTTTGCACAGAACTCTTACTTA CATGTCTCATCGAAACTCCAGAACAAACATCAAAAGGAAAACATTTAAAGTTGATGATATGTTATCAAAA GTAGAGAAAATGAAAGGAGAGCAAGAATCTCATAGCTTGTCAGCTCATTTGCAGCTTACGTTTACTGGTT TCTTCCACAAAAATGATAAGCCATCACCAAACTCAGAAAATGAACAAAATTCTGTTACCCTGGAAGTCCT GCTTGTGAAAGTTTGCCACAAAAAAAGAAAGGATGTAAGTTGTCCAATAAGGCAAGTTCCCACAGGTAAA AAGCAGGTGCCTTTGAATCCTGACCTCAATCAAACAAAACCCGGAAATTTCCCGTCCCTTGCAGTTTCCA GTAATGAATTTGAACCTAGTAACAGCCATATGGTGAAGTCTTACTCGTTGCTATTTAGAGTGACTCGTCC AGGAAGAAGAGAGTTTAATGGAATGATTAATGGAGAAACCAATGAAAATATTGATGTCAATGAAGAGCTT CCAGCCAGAAGAAAACGAAATCGTGAGGATGGGGAAAAGACATTTGTTGCACAAATGACAGTATTTGATA AAAACAGGCGCTTACAGCTTTTAGATGGGGAATATGAAGTAGCCATGCAGGAAATGGAAGAATGTCCAAT AAGCAAGAAAAGAGCAACATGGGAGACTATTCTTGATGGGAAGAGGCTGCCTCCATTCGAAACATTTTCT CAGGGACCTACGTTGCAGTTCACTCTTCGTTGGACAGGAGAGACCAATGATAAATCTACGGCTCCTATTG CCAAACCTCTTGCCACTAGAAATTCAGAGAGTCTCCATCAGGAAAACAAGCCTGGTTCAGTTAAACCTAC TCAAACTATTGCTGTTAAAGAATCATTGACTACAGATCTACAAACAAGAAAAGAAAAGGATACTCCAAAT GAAAACCGACAAAAATTAAGAATATTTTATCAGTTTCTCTATAACAACAATACAAGGCAACAAACTGAAG CAAGAGATGACCTGCATTGCCCTTGGTGTACTCTGAACTGCCGCAAACTTTATAGTTTACTCAAGCATCT TAAACTCTGCCATAGCAGATTTATCTTCAACTATGTTTATCATCCAAAAGGTGCTAGGATAGATGTTTCT ATCAATGAGTGTTATGATGGCTCCTATGCAGGAAATCCTCAGGATATTCATCGCCAACCTGGATTTGCTT TTAGTCGCAACGGACCAGTTAAGAGAACACCTATCACACATATTCTTGTGTGCAGGCCAAAACGAACAAA AGCAAGCATGTCTGAATTTCTTGAATCTGAAGATGGGGAAGTAGAACAGCAAAGAACATATAGTAGTGGC CACAATCGTCTGTATTTCCATAGTGATACCTGCTTACCTCTCCGTCCACAAGAAATGGAAGTAGATAGTG AAGATGAAAAGGATCCTGAATGGCTAAGAGAAAAAACCATTACACAAATTGAAGAGTTTTCTGATGTTAA TGAAGGAGAGAAAGAAGTGATGAAACTCTGGAATCTCCATGTCATGAAGCATGGGTTTATTGCTGACAAT CAAATGAATCATGCCTGTATGCTGTTTGTAGAAAATTATGGACAGAAAATAATTAAGAAGAATTTATGTC GAAACTTCATGCTTCATCTAGTCAGCATGCATGACTTTAATCTTATTAGCATAATGTCAATAGATAAAGC TGTTACCAAGCTCCGTGAAATGCAGCAAAAATTAGAAAAGGGGGAATCTGCTTCCCCTGCAAACGAAGAA ATAACTGAAGAACAAAATGGGACAGCAAATGGATTTAGTGAAATTAACTCAAAAGAGAAAGCTTTGGAAA CAGATAGTGTCTCAGGGGTTTCAAAACAGAGCAAAAAACAAAAACTCTGA Download Select all
CCDS ID	CCDS11270.1

Protein Information

Protein ID	NP_056170.2
Protein Name	Suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila)
Molecular Wt. (Da)	82924
Protein Sequence	>23512 MAPQKHGGGGGGGSGPSAGSGGGGFGGSAAVAAATASGGKSGGGSCGGGGSYSASSSSSAAAAA GAAVLPVKKPKMEHVQADHELFLQAFEKPTQIYRFLRTRNLIAPIFLHRTLTYMSHRNSRTNIK RKTFKVDDMLSKVEKMKGEQESHSLSAHLQLTFTGFFHKNDKPSPNSENEQNSVTLEVLLVKVC HKKRKDVSCPIRQVPTGKKQVPLNPDLNQTKPGNFPSLAVSSNEFEPSNSHMVKSYSLLFRVTR PGRREFNGMINGETNENIDVNEELPARRKRNREDGEKTFVAQMTVFDKNRRLQLLDGEYEVAMQ EMEECPISKKRATWETILDGKRLPPFETFSQGPTLQFTLRWTGETNDKSTAPIAKPLATRNSES LHQENKPGSVKPTQTIAVKESLTTDLQTRKEKDTPNENRQKLRIFYQFLYNNNTRQQTEARDDL HCPWCTLNCRKLYSLLKHLKLCHSRFIFNYVYHPKGARIDVSINECYDGSYAGNPQDIHRQPGF AFSRNGPVKRTPITHILVCRPKRTKASMSEFLESEDGEVEQQRTYSSGHNRLYFHSDTCLPLRP QEMEVDSEDEKDPEWLREKTITQIEEFSDVNEGEKEVMKLWNLHVMKHGFIADNQMNHACMLFV ENYGQKIIKKNLCRNFMLHLVSMHDFNLISIMSIDKAVTKLREMQQKLEKGESASPANEEITEE QNGTANGFSEINSKEKALETDSVSGVSKQSKKQKL Download Select all
Length	739
Uniprot ID	Q15910
Ensembl Protein ID	ENSP00000320147

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	546
S	Phosphorylation	546;-
S	Phosphorylation	568;-
T	Phosphorylation	570;-
S	Phosphorylation	37
S	Phosphorylation	541
S	Phosphorylation	583
S	Phosphorylation	726
S	Phosphorylation	539
T	Phosphorylation	418
S	Phosphorylation	695
T	Phosphorylation	724

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

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Pathway Information

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Structure Information

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Domain Information

ID	Location	Description
pfam09733	544-681	VEFS-Box
cl10718	544-681	VEFS-Box superfamily

Ontology Information

HPRD ID	5524
Molecular Class	Unclassified
Molecular Function	Transporter activity (GO:0005215)
Biological Process	Transport (GO:0006810)

SNP Information

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Drug Information

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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