CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
PLSCR1	5359	phospholipid scramblase 1	3	MMTRA1B

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20927484	2011	Cell line : - Source : Department of Colorectal Surgery, Chang Gung Memorial Hospital, Taiwan Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 104 pairs of colorectal carcinoma and noncancerous colorectal tissue Stage : -	Immunohistochemistry, Western blotting	Up-regulation	-	The plasma levels of PLSCR1 were significantly elevated in patients with early stage CRC compared with healthy individuals, suggesting that PLSCR1 might be used as a noninvasive serological diagnostic and prognostic biomarker for CRC.

Gene Details

Chromosome 3 - NC_000003.12 (146515178..146544841, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family
Description	-
Chromosome	3
Location	3q23
Start	146515178
End	146544841
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815595:c146544841-146515178 Homo sapiens chromosome 3, GRCh38.p2 Primary Assembly CACCGGACAAACGTCTCTGGAGTCTCTCCAATGAGCAAGAAAGCAAGTCGGGGGTAGGGGAGGGGCCTCA CACCAGGGGGTGGGCGCAGTCCCTCCTCCAGCTCCTTCACCCTCCAGTAGTCTCGTGGGTCCCCGAGCGC CAGCGCGGGAACCGGGAAAAGGAAACCGTGTTGTGTACGTAAGATTCAGGAAACGAAACCAGGAGCCGCG GGTGTTGGCGCAAAGGTTACTCCCAGACCCTTTTCCGGCTGACTTCTGAGAAGGTTGCGCAGCAGCTGTG CCCGGCAGTCTAGAGGCGCAGAAGAGGAAGCCATCGCCTGGCCCCGGCTCTCTGGACCTTGTCTCGCTCG GGAGCGGAAACAGCGGCAGCCAGAGGTGCGCGGGCGGCTTTCTCTGCCGCCTCCTGGGGACTTGGGCGCG GGAACTGCGCGGAGCCTGCGCTGGGGCCAGGGCCGGGGTCAGGTGTGGAGGGCAACTTGTGGGGAACCGG CGCGAGGGCCCGCAGGTTGTGTTTGCTGCTCTGGGGGTGGAGGATGTGGGGTGAAGGTTGGGGCCAGAAA TGCAAGAGGCCTCTGAAAGGGACCCTGGAAGTGGAGCAGGTACACGGCAAGGGGCCCCAGGCGGCCCAGC GGCACCCGGGCTCACCCCAGAACCATTCGAATGACAAGGGGTGCCCTGCCTGAAAACGCCTTGCGGGGCT CAGCTTCCCCTTAGCTACACTGCTTTACAGGTAGAGAGCGGCCCTGAATCCTGGGTAGAGTCTGGGCTCA GGAGCATGTGCCAGCGTAGTGGGGCTATTAGAAGGAATGGTTAATACAGCCTGCAAGCTGTCATTTATCA 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Protein Information

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Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

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Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

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Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

PDB ID	1Y2A
Resolution	2.2
Method	X-RAY DIFFRACTION
Chains	P
Molecule	decamer fragment of Phospholipid scramblase
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
pfam03803	86-307	Scramblase
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cl09454	42-97	SWI-SNF_Ssr4 superfamily
pfam12273	May-79	RCR
cl13679	May-79	RCR superfamily
pfam11737	21-61	DUF3300
cl13223	21-61	DUF3300 superfamily
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pfam09770	17-113	PAT1
pfam12868	Dec-98	DUF3824
PHA03377	Oct-91	PHA03377
pfam09770	10-107	PAT1
PRK10263	13-97	PRK10263
PHA03378	22-97	PHA03378
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pfam07117	16-82	DUF1373
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PHA03247	13-97	PHA03247
pfam15240	13-98	Pro-rich
pfam09770	18-104	PAT1
pfam07415	18-87	Herpes_LMP2

Ontology Information

HPRD ID	812
Molecular Class	Integral membrane protein
Molecular Function	Binding (GO:0005488); Immunoglobulin binding (GO:0019865); Polysaccharide binding (GO:0030247); Protein binding (GO:0005515); Complement binding (GO:0001848); Metal ion binding (GO:0046872)
Biological Process	Apoptosis (GO:0006915)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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