CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
TFRC	7037	Transferrin receptor (p90, CD71)	3	T9; TR; TFR; p90; CD71; TFR1; TRFR

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
15668490	2005	Cell line : - Source : Department of Pathology of Wrocaw Medical University. Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	Genotyping	Polymorhpism	-	G142S polymorphism were identified in the transferrin receptor gene (TFRC).
22968445	2012	Cell line : - Source : - Sample Type : Prostate, Lung, Colorectal and Ovarian Cancer No. of Sample : 679 persons with advanced distal adenoma and 697 control Stage : -	Laser capture microdissection,FFPE-FASP,SAX fractionation,LC-MSMS,Label-free quantitation.	Up-regulation	3.5	-

Gene Details

Chromosome: 3; NC_000003.11 (195776155..195809032, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	CD molecules
Description	-
Chromosome	3
Location	3q29
Start	196049284
End	196082161
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815595:c196082161-196049284 Homo sapiens chromosome 3, GRCh38.p2 Primary Assembly ACGCACAGCCCCCCTGGGGGCCGGGGGCGGGGCCAGGCTATAAACCGCCGGTTAGGGGCCGCCATCCCCT CAGAGCGTCGGGATATCGGGTGGCGGCTCGGGACGGAGGACGCGCTAGTGTGAGTGCGGGCTTCTAGAAC TACACCGACCCTCGTGTCCTCCCTTCATCCTGCGGGGCTGGCTGGAGCGGCCGCTCCGGTGCTGTCCAGC AGCCATAGGGAGCCGCACGGGGAGCGGGAAAGCGGTCGCGGCCCCAGGCGGGGCGGCCGGGATGGAGCGG GGCCGCGAGCCTGTGGGGAAGGGGCTGTGGCGGCGCCTCGAGCGGCTGCAGGTACACGGGGTCGGCGGCT GTGCGCAGAGGCGTCCCTGCGCCTCTCGTCCCTTCGCCTCTCGTCCCTTCCCTTCTCTCTGCCTTCTTGC CCGCCTCCTCGGTCACAGAGCGACGAATGACGAGACCAGGTGTACCCCCACTGTCGCTCTCAGCCCCGGG GACTTCGGGTCCTCGCCCTTGAAGGCCGCAGGCCCTAGTGCGCCGGCTCCGGGCTGCGGGTCCGGGAGCG CGGGCGCAGCCAAGGTGCAGCTGCGCGGCGTGCGGCGCCGGGGGAACACGTGGCTGCTCCAGGAAGTCGC CCCAGGGAACGGCTGGGATTCGTGGGTGACCTTGGGCTCCTAAACCTTCGGTTCCCCGGGCTCCGGGCGG GCCCCGTTCTCACTGCGGAAAGGGACAAAGCTGTCCCCGATTCGGTTACTAGCGTGTTACAGGCATTAAT TAGATACGGGTTTCTGTAAACTTACCCTTCGGCTCTGGTACAACCTGATCTTGCCATGCTCTGCCTGTTC 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CTTAAATGCAATTGGTGTGTTGATATACATGGACCAGACTAAATTTCCCATTGTTAACGCAGAA CTTTCATTCTTTGGACATGCTCATCTGGGGACAGGTGACCCTTACACACCTGGATTCCCTTCCT TCAATCACACTCAGTTTCCACCATCTCGGTCATCAGGATTGCCTAATATACCTGTCCAGACAAT CTCCAGAGCTGCTGCAGAAAAGCTGTTTGGGAATATGGAAGGAGACTGTCCCTCTGACTGGAAA ACAGACTCTACATGTAGGATGGTAACCTCAGAAAGCAAGAATGTGAAGCTCACTGTGAGCAATG TGCTGAAAGAGATAAAAATTCTTAACATCTTTGGAGTTATTAAAGGCTTTGTAGAACCAGATCA CTATGTTGTAGTTGGGGCCCAGAGAGATGCATGGGGCCCTGGAGCTGCAAAATCCGGTGTAGGC ACAGCTCTCCTATTGAAACTTGCCCAGATGTTCTCAGATATGGTCTTAAAAGATGGGTTTCAGC CCAGCAGAAGCATTATCTTTGCCAGTTGGAGTGCTGGAGACTTTGGATCGGTTGGTGCCACTGA ATGGCTAGAGGGATACCTTTCGTCCCTGCATTTAAAGGCTTTCACTTATATTAATCTGGATAAA GCGGTTCTTGGTACCAGCAACTTCAAGGTTTCTGCCAGCCCACTGTTGTATACGCTTATTGAGA AAACAATGCAAAATGTGAAGCATCCGGTTACTGGGCAATTTCTATATCAGGACAGCAACTGGGC CAGCAAAGTTGAGAAACTCACTTTAGACAATGCTGCTTTCCCTTTCCTTGCATATTCTGGAATC CCAGCAGTTTCTTTCTGTTTTTGCGAGGACACAGATTATCCTTATTTGGGTACCACCATGGACA CCTATAAGGAACTGATTGAGAGGATTCCTGAGTTGAACAAAGTGGCACGAGCAGCTGCAGAGGT CGCTGGTCAGTTCGTGATTAAACTAACCCATGATGTTGAATTGAACCTGGACTATGAGAGGTAC AACAGCCAACTGCTTTCATTTGTGAGGGATCTGAACCAATACAGAGCAGACATAAAGGAAATGG GCCTGAGTTTACAGTGGCTGTATTCTGCTCGTGGAGACTTCTTCCGTGCTACTTCCAGACTAAC AACAGATTTCGGGAATGCTGAGAAAACAGACAGATTTGTCATGAAGAAACTCAATGATCGTGTC ATGAGAGTGGAGTATCACTTCCTCTCTCCCTACGTATCTCCAAAAGAGTCTCCTTTCCGACATG TCTTCTGGGGCTCCGGCTCTCACACGCTGCCAGCTTTACTGGAGAACTTGAAACTGCGTAAACA AAATAACGGTGCTTTTAATGAAACGCTGTTCAGAAACCAGTTGGCTCTAGCTACTTGGACTATT CAGGGAGCTGCAAATGCCCTCTCTGGTGACGTTTGGGACATTGACAATGAGTTTTAAATGTGAT ACCCATAGCTTCCATGAGAACAGCAGGGTAGTCTGGTTTCTAGACTTGTGCTGATCGTGCTAAA TTTTCAGTAGGGCTACAAAACCTGATGTTAAAATTCCATCCCATCATCTTGGTACTACTAGATG TCTTTAGGCAGCAGCTTTTAATACAGGGTAGATAACCTGTACTTCAAGTTAAAGTGAATAACCA CTTAAAAAATGTCCATGATGGAATATTCCCCTATCTCTAGAATTTTAAGTGCTTTGTAATGGGA ACTGCCTCTTTCCTGTTGTTGTTAATGAAAATGTCAGAAACCAGTTATGTGAATGATCTCTCTG AATCCTAAGGGCTGGTCTCTGCTGAAGGTTGTAAGTGGTCGCTTACTTTGAGTGATCCTCCAAC TTCATTTGATGCTAAATAGGAGATACCAGGTTGAAAGACCTTCTCCAAATGAGATCTAAGCCTT TCCATAAGGAATGTAGCTGGTTTCCTCATTCCTGAAAGAAACAGTTAACTTTCAGAAGAGATGG GCTTGTTTTCTTGCCAATGAGGTCTGAAATGGAGGTCCTTCTGCTGGATAAAATGAGGTTCAAC TGTTGATTGCAGGAATAAGGCCTTAATATGTTAACCTCAGTGTCATTTATGAAAAGAGGGGACC AGAAGCCAAAGACTTAGTATATTTTCTTTTCCTCTGTCCCTTCCCCCATAAGCCTCCATTTAGT TCTTTGTTATTTTTGTTTCTTCCAAAGCACATTGAAAGAGAACCAGTTTCAGGTGTTTAGTTGC AGACTCAGTTTGTCAGACTTTAAAGAATAATATGCTGCCAAATTTTGGCCAAAGTGTTAATCTT AGGGGAGAGCTTTCTGTCCTTTTGGCACTGAGATATTTATTGTTTATTTATCAGTGACAGAGTT CACTATAAATGGTGTTTTTTTAATAGAATATAATTATCGGAAGCAGTGCCTTCCATAATTATGA CAGTTATACTGTCGGTTTTTTTTAAATAAAAGCAGCATCTGCTAATAAAACCCAACAGATACTG GAAGTTTTGCATTTATGGTCAACACTTAAGGGTTTTAGAAAACAGCCGTCAGCCAAATGTAATT GAATAAAGTTGAAGCTAAGATTTAGAGATGAATTAAATTTAATTAGGGGTTGCTAAGAAGCGAG CACTGACCAGATAAGAATGCTGGTTTTCCTAAATGCAGTGAATTGTGACCAAGTTATAAATCAA TGTCACTTAAAGGCTGTGGTAGTACTCCTGCAAAATTTTATAGCTCAGTTTATCCAAGGTGTAA CTCTAATTCCCATTTTGCAAAATTTCCAGTACCTTTGTCACAATCCTAACACATTATCGGGAGC AGTGTCTTCCATAATGTATAAAGAACAAGGTAGTTTTTACCTACCACAGTGTCTGTATCGGAGA CAGTGATCTCCATATGTTACACTAAGGGTGTAAGTAATTATCGGGAACAGTGTTTCCCATAATT TTCTTCATGCAATGACATCTTCAAAGCTTGAAGATCGTTAGTATCTAACATGTATCCCAACTCC TATAATTCCCTATCTTTTAGTTTTAGTTGCAGAAACATTTTGTGGTCATTAAGCATTGGGTGGG TAAATTCAACCACTGTAAAATGAAATTACTACAAAATTTGAAATTTAGCTTGGGTTTTTGTTAC CTTTATGGTTTCTCCAGGTCCTCTACTTAATGAGATAGTAGCATACATTTATAATGTTTGCTAT TGACAAGTCATTTTAACTTTATCACATTATTTGCATGTTACCTCCTATAAACTTAGTGCGGACA AGTTTTAATCCAGAATTGACCTTTTGACTTAAAGCAGAGGGACTTTGTATAGAAGGTTTGGGGG CTGTGGGGAAGGAGAGTCCCCTGAAGGTCTGACACGTCTGCCTACCCATTCGTGGTGATCAATT AAATGTAGGTATGAATAAGTTCGAAGCTCCGTGAGTGAACCATCATTATAAACGTGATGATCAG CTGTTTGTCATAGGGCAGTTGGAAACGGCCTCCTAGGGAAAAGTTCATAGGGTCTCTTCAGGTT CTTAGTGTCACTTACCTAGATTTACAGCCTCACTTGAATGTGTCACTACTCACAGTCTCTTTAA TCTTCAGTTTTATCTTTAATCTCCTCTTTTATCTTGGACTGACATTTAGCGTAGCTAAGTGAAA AGGTCATAGCTGAGATTCCTGGTTCGGGTGTTACGCACACGTACTTAAATGAAAGCATGTGGCA TGTTCATCGTATAACACAATATGAATACAGGGCATGCATTTTGCAGCAGTGAGTCTCTTCAGAA AACCCTTTTCTACAGTTAGGGTTGAGTTACTTCCTATCAAGCCAGTACGTGCTAACAGGCTCAA TATTCCTGAATGAAATATCAGACTAGTGACAAGCTCCTGGTCTTGAGATGTCTTCTCGTTAAGG AGATGGGCCTTTTGGAGGTAAAGGATAAAATGAATGAGTTCTGTCATGATTCACTATTCTAGAA CTTGCATGACCTTTACTGTGTTAGCTCTTTGAATGTTCTTGAAATTTTAGACTTTCTTTGTAAA CAAATGATATGTCCTTATCATTGTATAAAAGCTGTTATGTGCAACAGTGTGGAGATTCCTTGTC TGATTTAATAAAATACTTAAACACTGAAAAAAAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length	5100

CDS Information

Location	join(5063..5098,6802..7003,8037..8232,10010..10159, 10664..10766,12594..12707,14032..14130,14505..14644, 16562..16719,17734..17853,19223..19308,19517..19580, 21915..21982,23530..23588,23797..23878,26861..27082, 28604..28744,29978..30220)
CDS Sequence	>lcl\|NM_001128148.1_cds_NP_001121620.1_1 [gene=TFRC] [protein=transferrin receptor protein 1] [protein_id=NP_001121620.1] [location=143..2425] ATGATGGATCAAGCTAGATCAGCATTCTCTAACTTGTTTGGTGGAGAACCATTGTCATATACCCGGTTCA GCCTGGCTCGGCAAGTAGATGGCGATAACAGTCATGTGGAGATGAAACTTGCTGTAGATGAAGAAGAAAA TGCTGACAATAACACAAAGGCCAATGTCACAAAACCAAAAAGGTGTAGTGGAAGTATCTGCTATGGGACT ATTGCTGTGATCGTCTTTTTCTTGATTGGATTTATGATTGGCTACTTGGGCTATTGTAAAGGGGTAGAAC CAAAAACTGAGTGTGAGAGACTGGCAGGAACCGAGTCTCCAGTGAGGGAGGAGCCAGGAGAGGACTTCCC TGCAGCACGTCGCTTATATTGGGATGACCTGAAGAGAAAGTTGTCGGAGAAACTGGACAGCACAGACTTC ACCGGCACCATCAAGCTGCTGAATGAAAATTCATATGTCCCTCGTGAGGCTGGATCTCAAAAAGATGAAA ATCTTGCGTTGTATGTTGAAAATCAATTTCGTGAATTTAAACTCAGCAAAGTCTGGCGTGATCAACATTT TGTTAAGATTCAGGTCAAAGACAGCGCTCAAAACTCGGTGATCATAGTTGATAAGAACGGTAGACTTGTT TACCTGGTGGAGAATCCTGGGGGTTATGTGGCGTATAGTAAGGCTGCAACAGTTACTGGTAAACTGGTCC ATGCTAATTTTGGTACTAAAAAAGATTTTGAGGATTTATACACTCCTGTGAATGGATCTATAGTGATTGT CAGAGCAGGGAAAATCACCTTTGCAGAAAAGGTTGCAAATGCTGAAAGCTTAAATGCAATTGGTGTGTTG ATATACATGGACCAGACTAAATTTCCCATTGTTAACGCAGAACTTTCATTCTTTGGACATGCTCATCTGG GGACAGGTGACCCTTACACACCTGGATTCCCTTCCTTCAATCACACTCAGTTTCCACCATCTCGGTCATC AGGATTGCCTAATATACCTGTCCAGACAATCTCCAGAGCTGCTGCAGAAAAGCTGTTTGGGAATATGGAA GGAGACTGTCCCTCTGACTGGAAAACAGACTCTACATGTAGGATGGTAACCTCAGAAAGCAAGAATGTGA AGCTCACTGTGAGCAATGTGCTGAAAGAGATAAAAATTCTTAACATCTTTGGAGTTATTAAAGGCTTTGT AGAACCAGATCACTATGTTGTAGTTGGGGCCCAGAGAGATGCATGGGGCCCTGGAGCTGCAAAATCCGGT GTAGGCACAGCTCTCCTATTGAAACTTGCCCAGATGTTCTCAGATATGGTCTTAAAAGATGGGTTTCAGC CCAGCAGAAGCATTATCTTTGCCAGTTGGAGTGCTGGAGACTTTGGATCGGTTGGTGCCACTGAATGGCT AGAGGGATACCTTTCGTCCCTGCATTTAAAGGCTTTCACTTATATTAATCTGGATAAAGCGGTTCTTGGT ACCAGCAACTTCAAGGTTTCTGCCAGCCCACTGTTGTATACGCTTATTGAGAAAACAATGCAAAATGTGA AGCATCCGGTTACTGGGCAATTTCTATATCAGGACAGCAACTGGGCCAGCAAAGTTGAGAAACTCACTTT AGACAATGCTGCTTTCCCTTTCCTTGCATATTCTGGAATCCCAGCAGTTTCTTTCTGTTTTTGCGAGGAC ACAGATTATCCTTATTTGGGTACCACCATGGACACCTATAAGGAACTGATTGAGAGGATTCCTGAGTTGA ACAAAGTGGCACGAGCAGCTGCAGAGGTCGCTGGTCAGTTCGTGATTAAACTAACCCATGATGTTGAATT GAACCTGGACTATGAGAGGTACAACAGCCAACTGCTTTCATTTGTGAGGGATCTGAACCAATACAGAGCA GACATAAAGGAAATGGGCCTGAGTTTACAGTGGCTGTATTCTGCTCGTGGAGACTTCTTCCGTGCTACTT CCAGACTAACAACAGATTTCGGGAATGCTGAGAAAACAGACAGATTTGTCATGAAGAAACTCAATGATCG TGTCATGAGAGTGGAGTATCACTTCCTCTCTCCCTACGTATCTCCAAAAGAGTCTCCTTTCCGACATGTC TTCTGGGGCTCCGGCTCTCACACGCTGCCAGCTTTACTGGAGAACTTGAAACTGCGTAAACAAAATAACG GTGCTTTTAATGAAACGCTGTTCAGAAACCAGTTGGCTCTAGCTACTTGGACTATTCAGGGAGCTGCAAA TGCCCTCTCTGGTGACGTTTGGGACATTGACAATGAGTTTTAA Download Select all
CCDS ID	CCDS3312.1

Protein Information

Protein ID	NP_003225.2
Protein Name	Transferrin receptor (p90, CD71)
Molecular Wt. (Da)	84741
Protein Sequence	>7037 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSG SICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLK RKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQV KDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVI VRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQ FPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEI KILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSI IFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQN VKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKEL IERIPELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQ WLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGS GSHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF Download Select all
Length	760
Uniprot ID	O60610
Ensembl Protein ID	ENSP00000373706

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
T	Glycosylation	104
N	Glycosylation	251
N	Glycosylation	317
C	Disulfide Bridge	556;558
C	Palmitoylation	62
C	Palmitoylation	67
N	Glycosylation	727
C	Disulfide Bridge	89;98
S	Phosphorylation	24
Y	Phosphorylation	20
T	Phosphorylation	658;-
S	Phosphorylation	19
T	Phosphorylation	21
N	Glycosylation	250
N	Glycosylation	722
N	Glycosylation	726
Y	Phosphorylation	19
S	Phosphorylation	34
S	Phosphorylation	499
Y	Phosphorylation	503

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
919	CD247	1729	NP_932170.1	in vitro;in vivo	9448136
5869	RAB5B	1544	NP_002859.1	in vivo	7789520
7018	TF	1811	NP_001054.1	in vivo	12 210 842 626 863 200 000 000

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Endocytosis	hsa04144
Hematopoietic cell lineage	hsa04640
HIF-1 signaling pathway	hsa04066
Phagosome	hsa04145

Structure Information

PDB ID	1CX8
Resolution	3.2
Method	X-RAY DIFFRACTION
Chains	A,B,C
Molecule	TRANSFERRIN RECEPTOR PROTEIN
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
cd09848	385-610	M28_TfR
cl14876	385-610	Zinc_peptidase_like superfamily
cd02128	201-377	PA_TfR
cl10459	201-377	Peptidases_S8_S53 superfamily
cd03874	365-607	M28_PMSA_TfR_like
cd08022	385-609	M28_PSMA_like
cd02690	339-601	M28
pfam04253	636-752	TFR_dimer
cl07854	636-752	TFR_dimer superfamily
cd02121	197-358	PA_GCPII_like
pfam04389	401-576	Peptidase_M28
cd00538	207-352	PA
cd03877	383-563	M28_like_PA
cd02133	232-282	PA_C5a_like
cd08015	387-595	M28_like_4
pfam02225	223-284	PA
cd02131	219-353	PA_hNAALADL2_like
cd02130	216-352	PA_ScAPY_like
cd05660	373-455	M28_like_PA_1
cd08021	382-576	M28_like_5
cd05663	388-485	M28_like_PA_PDZ_associated
cd03883	388-463	M28_Pgcp_like
cd05662	388-551	M28_like_2
cd05642	380-460	M28_AAP_like
cd04818	250-282	PA_subtilisin_1
cd02122	254-307	PA_GRAIL_like
cd04819	214-285	PA_2
cd03876	399-494	M28_SGAP_like
cd02124	252-299	PA_PoS1_like
cd05661	388-464	M28_like_PA_2
COG2234	153-576	Iap

Ontology Information

HPRD ID	532
Molecular Class	Membrane transport protein
Molecular Function	DNA-methyltransferase activity (GO:0009008)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

View SNP Geneview Report

Drug Information

Uniprot ID DrugBank ID Name Type
P02786 DB05260 Gallium nitrate SmallMoleculeDrug

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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