CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
C9	735	complement component 9	5

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
21199170	2011	Cell line : - Source : - Sample Type : CRC tumor and Normal tissue No. of Sample : 31 Stage : TNM Stage II, III	2D image-converted analysis of liquid chromatography and mass spectrometry, high-density reverse-phase protein microarrays	Up-regulation	-	The increment of plasma C9 may be applicable to the early detection of colorectal cancer. C9 was elevated in patients with colorectal cancer, including those with stage-I and -II diseases

Gene Details

Chromosome 5 - NC_000005.10 (39284275..39364553, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Complement system
Description	This gene encodes the final component of the complement system. It participates in the formation of the Membrane Attack Complex (MAC). The MAC assembles on bacterial membranes to form a pore, permitting disruption of bacterial membrane organization. Mutations in this gene cause component C9 deficiency.
Chromosome	5
Location	5p14-p12
Start	39284275
End	39364553
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815593:c39364553-39284275 Homo sapiens chromosome 5, GRCh38.p2 Primary Assembly GCTTGTTCCCTGTCCTCTGGCCCTTTGCAAATAAATGCCTTACCAGACCTGCCCTGCCACCCCACTCGCA GCCACCCAGCAAGAGCAGCATGTCAGCCTGCCGGAGCTTTGCAGTTGCAATCTGCATTTTAGAAATAAGC ATCCTCACAGCACAGTACACGACCAGGTGAGTCAGTTACTTTTCTGCTTGTCTCTGGAAGTTTCCTGTAG GATTAGCATCTCAAGGTCTTCTTAGCAGCAAAGTACATGACAATGTTAATCCACATGGCAATATACAGAG CCCTAGAATCTAAACTTCGAAAAGAGATAAGAAAATACATAGGGTGCATCTTTATGAGTTTTCTGTGGAA ATGTGCTGCTGTTTCTGGGGATTTATTTTCAACAAGGCACTCAAATGTTAAGATTGAGGTATTCTTTAAA TATCTGGAATTATAAAATAAAGCTTGTTTTCACCAGTGTATGATGAACCTGGGTTTATTAGTGCCTGATG TCTGAGAAGTTTAAAATTAAGGAAATTAATCTTTCCCTCACTCTGCTTCAATGCCTGACACCTTTAACAT TTGGATACATCACCCTTTTGCCTCCACATTAGGCAAAGGTTAACTATTTTGTTTCTTTCCCTTGACATCC TGAGTTGTGTTCAGAGGCATGCATTTTGTTTAGGGCCATTTGGGATTTAGGTCATATTTCTTCCATTCCA GAATTGCAGTGATGCAGACCTGTCACTCATGCTTCTACCAAAGATACTTTTTCTCCTTTTTCTCTGATCC TAATCGGAATTGCAAAGCCCATGGCAAGTCATCCAGGAAACAAATCACCCATATAATAAGTTTTTATTGA 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CDS Sequence	>lcl\|NM_001737.3_cds_NP_001728.1_1 [gene=C9] [protein=complement component C9 precursor] [protein_id=NP_001728.1] [location=90..1769] ATGTCAGCCTGCCGGAGCTTTGCAGTTGCAATCTGCATTTTAGAAATAAGCATCCTCACAGCACAGTACA CGACCAGTTATGACCCAGAGCTAACAGAAAGCAGTGGCTCTGCATCACACATAGACTGCAGAATGAGCCC CTGGAGTGAATGGTCACAATGCGATCCTTGTCTCAGACAAATGTTTCGTTCAAGAAGCATTGAGGTCTTT GGACAATTTAATGGGAAAAGATGCACCGACGCTGTGGGAGACAGACGACAGTGTGTGCCCACAGAGCCCT GTGAGGATGCTGAGGATGACTGCGGAAATGACTTTCAATGCAGTACAGGCAGATGCATAAAGATGCGACT TCGGTGTAATGGTGACAATGACTGCGGAGACTTTTCAGATGAGGATGATTGTGAAAGTGAGCCCCGTCCC CCCTGCAGAGACAGAGTGGTAGAAGAGTCTGAGCTGGCACGAACAGCAGGCTATGGGATCAACATTTTAG GGATGGATCCCCTAAGCACACCTTTTGACAATGAGTTCTACAATGGACTCTGTAACCGGGATCGGGATGG AAACACTCTGACATACTACCGAAGACCTTGGAACGTGGCTTCTTTGATCTATGAAACCAAAGGCGAGAAA AATTTCAGAACCGAACATTACGAAGAACAAATTGAAGCATTTAAAAGTATCATCCAAGAGAAGACATCAA ATTTTAATGCAGCTATATCTCTAAAATTTACACCCACTGAAACAAATAAAGCTGAACAATGTTGTGAGGA AACAGCCTCCTCAATTTCTTTACATGGCAAGGGTAGTTTTCGGTTTTCATATTCCAAAAATGAAACTTAC CAACTATTTTTGTCATATTCTTCAAAGAAGGAAAAAATGTTTCTGCATGTGAAAGGAGAAATTCATCTGG GAAGATTTGTAATGAGAAATCGCGATGTTGTGCTCACAACAACTTTTGTGGATGATATAAAAGCTTTGCC AACTACCTATGAAAAGGGAGAATATTTTGCCTTTTTGGAAACCTATGGAACTCACTACAGTAGCTCTGGG TCTCTAGGAGGACTCTATGAACTAATATATGTTTTGGATAAAGCTTCCATGAAGCGGAAAGGTGTTGAAC TAAAAGACATAAAGAGATGCCTTGGGTATCATCTGGATGTATCTCTGGCTTTCTCTGAAATCTCTGTTGG AGCTGAATTTAATAAAGATGATTGTGTAAAGAGGGGAGAGGGTAGAGCTGTAAACATCACCAGTGAAAAC CTCATAGATGATGTTGTTTCACTCATAAGAGGTGGAACCAGAAAATATGCATTTGAACTGAAAGAAAAGC TTCTCCGAGGAACCGTGATTGATGTGACTGACTTTGTCAACTGGGCCTCTTCCATAAATGATGCTCCTGT TCTCATTAGTCAAAAACTGTCTCCTATATATAATCTGGTTCCAGTGAAAATGAAAAATGCACACCTAAAG AAACAAAACTTGGAAAGAGCCATTGAAGACTATATCAATGAATTTAGTGTAAGAAAATGCCACACATGCC AAAATGGAGGTACAGTGATTCTAATGGATGGAAAGTGTTTGTGTGCCTGCCCATTCAAATTTGAGGGAAT TGCCTGTGAAATCAGTAAACAAAAAATTTCTGAAGGATTGCCAGCCCTAGAGTTCCCCAATGAAAAATAG Download Select all
CCDS ID	CCDS3929.1"

Protein Information

Protein ID	NP_001728.1
Protein Name	complement component 9
Molecular Wt. (Da)	60979
Protein Sequence	>735 MSACRSFAVAICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQMFRS RSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCSTGRCIKMRLRCNGDNDCGDF SDEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFYNGLCNRDRDGNTLTY YRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNAAISLKFTPTETNKAEQCCE ETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGEIHLGRFVMRNRDVVLTTTFV DDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGLYELIYVLDKASMKRKGVELKDIKRCLGYH LDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRGEGRAVNITSENLIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGT VIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKLSPIYNLVPVKMKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHT CQNGGTVILMDGKCLCACPFKFEGIACEISKQKISEGLPALEFPNEK Download Select all
Length	559
Uniprot ID	Q03113
Ensembl Protein ID	ENSP00000275364

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
C	Disulfide Bridge	142;181
C	Disulfide Bridge	254;255
C	Disulfide Bridge	380;405
N	Glycosylation	415
C	Disulfide Bridge	43;78
W	Glycosylation	48
C	Disulfide Bridge	510;526
C	Disulfide Bridge	513;528
W	Glycosylation	51
C	Disulfide Bridge	530;539
C	Disulfide Bridge	54;57
C	Disulfide Bridge	88;94
S	Phosphorylation	261
T	Phosphorylation	316

Enzyme Information

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PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
966	CD59	117	NP_000602.1	in vitro	75 234 061 377 690

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Amoebiasis	hsa05146
Complement and coagulation cascades	hsa04610
Prion diseases	hsa05020
Systemic lupus erythematosus	hsa05322

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd00112	103-134	LDLa
cl00104	103-134	LDLa superfamily
smart00457	294-503	MACPF
cl02616	294-503	MACPF superfamily
pfam01823	272-501	MACPF
pfam00057	99-134	Ldl_recept_a
smart00192	103-131	LDLa
smart00209	45-95	TSP1
cl15278	45-95	TSP_1 superfamily
pfam00090	46-94	TSP_1
PTZ00482	273-490	PTZ00482

Ontology Information

HPRD ID	2926
Molecular Class	Complement protein
Molecular Function	Protein serine/threonine kinase activity (GO:0004674)
Biological Process	Cell communication (GO:0007154); Signal transduction (GO:0007165)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
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