CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
NUF2	83540	NUF2, NDC80 kinetochore complex component	1	NUF2R, CT106

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
24247253	2014	Cell line : - Source : - Sample Type : CRC tissue and blood sample No. of Sample : 434 CRC patients. Stage : -	Immunohistochemistry using tissue microarrays	Up-regulation	-	CDCA1 could be a prognostic biomarker and a potential therapeutic target for CRCs.

Gene Details

Chromosome 1 - NC_000001.11 (163321933..163355764)
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Gene Type	protein coding
Gene Family
Description	This gene encodes a protein that is highly similar to yeast Nuf2, a component of a conserved protein complex associated with the centromere. Yeast Nuf2 disappears from the centromere during meiotic prophase when centromeres lose their connection to the spindle pole body, and plays a regulatory role in chromosome segregation. The encoded protein is found to be associated with centromeres of mitotic HeLa cells, which suggests that this protein is a functional homolog of yeast Nuf2. Alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been described.
Chromosome	1
Location	1q23.3
Start	163321933
End	163355764
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815597:163321933-163355764 Homo sapiens chromosome 1, GRCh38.p2 Primary Assembly GCGGAATGGGGCGGGACTTCCAGTAGGAGGCGGCAAGTTTGAAAAGTGATGACGGTTGACGTTTGCTGAT TTTTGACTTTGCTTGTAGCTGCTCCCCGAACTCGCCGTCTTCCTGTCGGCGGCCGGCACTGTAGGTGAGC GCGAGAGGACGGAGGAAGGAAGCCTGCAGACAGACGCCTTCTCCATCCCAAGGCGCGGGCAGGTGCCGGG ACGCTGGGCCTGGCGGTGTTTTCGTCGTGCTCAGCGGTGGGAGGAGGCGGAAGAAACCAGAGCCTGGGAG GTGAGGGGCGGGCCCGTCGTTACTTTTTATTTGATGTTAGTCCCAGAAACAACCAGAGCTCAGTTCCTAC TAAACTAACGGGTGTTTTCTGGTGCAGCATAGACCGAAGAAGACGAGCTTGAGCTGAAATTGTTCAAGTT AGGCATACATTTATGTGTGATTTTTGGAAAGGCGGTGGTAATGTGGTTTATTTGGCTGCAGATGCTTGTC AGCTTTTTACACATCTCCGTTGCCAAACGTTTCTTAACCAAATCCAAAACCATGAATGAAAAGGTAAAAA TATCACACCTAATCCAAAATTCAAAGGAAAAGAGCAGCGCATATATAGCACTACGCATGCATAACGCCAT CATTGTTCCTTTTAAAAGTTCAAGGAACGTTTTACTTAATTCATTGAAGTTGGGAGCCATTTCTGTTTAT TTTTGTTTAATCTCTGCCTCGTGGAACTGTGATGTCCACAAATAGTTTATTTTAACAAAACGAAGTGTGT AAAATTTAACAGAGTACTTTTAGTACCTACTCACTCTGCTCAGCATCGTGGTGCTGCAAATAAATGAGAA 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Length	1843

CDS Information

Location	join(4120..4242,5556..5630,6296..6372,6914..6975, 14819..14916,16088..16161,17449..17545,18432..18494, 21801..21938,23746..23886,25831..26006,27013..27148, 33403..33537)
CDS Sequence	>lcl\|NM_031423.3_cds_NP_113611.2_1 [gene=NUF2] [protein=kinetochore protein Nuf2] [protein_id=NP_113611.2] [location=155..1549] ATGGAAACTTTGTCTTTCCCCAGATATAATGTAGCTGAGATTGTGATTCATATTCGCAATAAGATCTTAA CAGGAGCTGATGGTAAAAACCTCACCAAGAATGATCTTTATCCAAATCCAAAGCCTGAAGTCTTGCACAT GATCTACATGAGAGCCTTACAAATAGTATATGGAATTCGACTGGAACATTTTTACATGATGCCAGTGAAC TCTGAAGTCATGTATCCACATTTAATGGAAGGCTTCTTACCATTCAGCAATTTAGTTACTCATCTGGACT CATTTTTGCCTATCTGCCGGGTGAATGACTTTGAGACTGCTGATATTCTATGTCCAAAAGCAAAACGGAC AAGTCGGTTTTTAAGTGGCATTATCAACTTTATTCACTTCAGAGAAGCATGCCGTGAAACGTATATGGAA TTTCTTTGGCAATATAAATCCTCTGCGGACAAAATGCAACAGTTAAACGCCGCACACCAGGAGGCATTAA TGAAACTGGAGAGACTTGATTCTGTTCCAGTTGAAGAGCAAGAAGAGTTCAAGCAGCTTTCAGATGGAAT TCAGGAGCTACAACAATCACTAAATCAGGATTTTCATCAAAAAACGATAGTGCTGCAAGAGGGAAATTCC CAAAAGAAGTCAAATATTTCAGAGAAAACCAAGCGTTTGAATGAACTAAAATTGTCGGTGGTTTCTTTGA AAGAAATACAAGAGAGTTTGAAAACAAAAATTGTGGATTCTCCAGAGAAGTTAAAGAATTATAAAGAAAA AATGAAAGATACGGTCCAGAAGCTTAAAAATGCCAGACAAGAAGTGGTGGAGAAATATGAAATCTATGGA GACTCAGTTGACTGCCTGCCTTCATGTCAGTTGGAAGTGCAGTTATATCAAAAGAAAATACAGGACCTTT CAGATAATAGGGAAAAATTAGCCAGTATCTTAAAGGAGAGCCTGAACTTGGAGGACCAAATTGAGAGTGA TGAGTCAGAACTGAAGAAATTGAAGACTGAAGAAAATTCGTTCAAAAGACTGATGATTGTGAAGAAGGAA AAACTTGCCACAGCACAATTCAAAATAAATAAGAAGCATGAAGATGTTAAGCAATACAAACGCACAGTAA TTGAGGATTGCAATAAAGTTCAAGAAAAAAGAGGTGCTGTCTATGAACGAGTAACCACAATTAATCAAGA AATCCAAAAAATTAAACTTGGAATTCAACAACTAAAAGATGCTGCTGAAAGGGAGAAACTGAAGTCCCAG GAAATATTTCTAAACTTGAAAACTGCTTTGGAGAAATACCACGACGGTATTGAAAAGGCAGCAGAGGACT CCTATGCTAAGATAGATGAGAAGACAGCTGAACTGAAGAGGAAGATGTTCAAAATGTCAACCTGA Download Select all
CCDS ID	CCDS1245.1

Protein Information

Protein ID	NP_113611.2
Protein Name	NUF2, NDC80 kinetochore complex component
Molecular Wt. (Da)	54173
Protein Sequence	>83540 METLSFPRYNVAEIVIHIRNKILTGADGKNLTKNDLYPNPKPEVLHMIYMRALQIVYGIRLEHF YMMPVNSEVMYPHLMEGFLPFSNLVTHLDSFLPICRVNDFETADILCPKAKRTSRFLSGIINFI HFREACRETYMEFLWQYKSSADKMQQLNAAHQEALMKLERLDSVPVEEQEEFKQLSDGIQELQQ SLNQDFHQKTIVLQEGNSQKKSNISEKTKRLNELKLSVVSLKEIQESLKTKIVDSPEKLKNYKE KMKDTVQKLKNARQEVVEKYEIYGDSVDCLPSCQLEVQLYQKKIQDLSDNREKLASILKESLNL EDQIESDESELKKLKTEENSFKRLMIVKKEKLATAQFKINKKHEDVKQYKRTVIEDCNKVQEKR GAVYERVTTINQEIQKIKLGIQQLKDAAEREKLKSQEIFLNLKTALEKYHDGIEKAAEDSYAKI DEKTAELKRKMFKMST Download Select all
Length	464
Uniprot ID	P42702
Ensembl Protein ID	ENSP00000263409

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	247
S	Phosphorylation	247
T	Phosphorylation	261
T	Phosphorylation	261

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

No matching records from HPRD source could be found.

Pathway Information

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Structure Information

PDB ID	2VE7
Resolution	2.88
Method	X-RAY DIFFRACTION
Chains	A,B
Molecule	KINETOCHORE PROTEIN HEC1, KINETOCHORE PROTEIN SPC25
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
pfam03800	1-148	Nuf2
cl04266	1-148	Nuf2 superfamily
TIGR02169	165-457	SMC_prok_A
TIGR02168	144-370	SMC_prok_B
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COG1196	150-456	Smc
COG1196	132-410	Smc
TIGR02168	160-457	SMC_prok_B
TIGR02168	140-460	SMC_prok_B
COG0419	177-443	SbcC
COG0419	150-459	SbcC
TIGR04523	175-450	Mplasa_alph_rch
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COG0497	131-342	RecN
TIGR02169	151-458	SMC_prok_A
pfam12128	145-337	DUF3584
COG1196	237-461	Smc
TIGR02168	254-456	SMC_prok_B
TIGR04523	179-427	Mplasa_alph_rch
TIGR04523	165-456	Mplasa_alph_rch
TIGR02169	157-334	SMC_prok_A
COG1196	131-392	Smc
COG1196	296-459	Smc
COG5185	152-460	HEC1
TIGR02169	179-375	SMC_prok_A
COG4942	210-416	EnvC
COG0419	144-371	SbcC
pfam05622	135-382	HOOK
TIGR04523	165-432	Mplasa_alph_rch
pfam13166	296-458	AAA_13
pfam07888	157-453	CALCOCO1
pfam05483	131-461	SCP-1

Ontology Information

HPRD ID	3500
Molecular Class	Cytoskeletal associated protein
Molecular Function	DNA binding (GO:0003677)
Biological Process	DNA repair (GO:0006281)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
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Cancer3D GO
COSMIC GO
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