CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
ATP2A2	488	ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2	12	SERCA2

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
22047082	2012	Cell line : - Source : - Sample Type : - No. of Sample : 105 Stage : -	Membrane array and direct sequencing	Up-regulation	-	�EVI2B,�ATP2A2, S100B, TM4SF3, and OLFM4 could be potential prognostic markers for CRC patients.

Gene Details

NC_000012.11 (110719032..110788898)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	ATPases / P-type
Description	This gene encodes one of the SERCA Ca(2+)-ATPases, which are intracellular pumps located in the sarcoplasmic or endoplasmic reticula of muscle cells. This enzyme catalyzes the hydrolysis of ATP coupled with the translocation of calcium from the cytosol into the sarcoplasmic reticulum lumen, and is involved in regulation of the contraction/relaxation cycle. Mutations in this gene cause Darier-White disease, also known as keratosis follicularis, an autosomal dominant skin disorder characterized by loss of adhesion between epidermal cells and abnormal keratinization. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2008]
Chromosome	12
Location	12q24.11
Start	110719032
End	110788898
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815586:110281227-110351093 Homo sapiens chromosome 12, GRCh38.p2 Primary Assembly GGCAGCGGCCGATAAATGCTATTAGAGCAGCCGCCGCGGAGCCGTCCCCGACGCCACCTCCTTTTCCTTC GCCGCAGTTTCCTCCGCCGCTGTCGGGCGTGCGGCGCTGAGGGACCCGGGCGAGCGCGCCGCGCACCGCC CCGCCGGCTCGCCTCCCTCGCCGCGTTCCGCCCTCAGTGGTCTGCCGGGCGCCCCCTCCTCCGGCCCGGG CGGGGCCTCTGATCGCCTCAAGAGAGCGGGGAGGGGGCTCGGGGGCCGCGGCCTGCCCTCCCGGCGGGCG GCTGAGGGCGAGGGAGGCCCTCCCTTCTGGCGAGGGGAGGGAGGGTGGGTCAGGAGCCCCCAACCCGCCC TGCGGAGCTCGGGGCCGCGCGAGGGGCGGTTGTCTGGGGGAGGGGGCGCGGGGTGATTCAGCGCCCGGCG AGGCGGAAGCGGCCGCAAGAGGAGGAGGGGAGAGCCCGTCCGCGCCTGGGCTCCCGGGGTGGCACGAGCC CGCGGCCGGAGTGCGAGGCGGAGGCGAGGAGGCCGCGGGGACGGGAGGCGAGGCCGGCCGGGCCCCCGAA GCCATGGAGAACGCGCACACCAAGACGGTGGAGGAGGTGCTGGGCCACTTCGGCGTCAACGAGAGTACGG GGCTGAGCCTGGAACAGGTCAAGAAGCTTAAGGAGAGATGGGGCTCCAACGGTAGGTGCAGGGCGCTCCG CTGCAGGGGCCCGGCGCGGCCGGGAGAGCCAGGGAAGATGGCTGACCGGGCTCCACCTCGTGGGCTTCGG CTCCGCGCCCGCCGACAGCTGCGGGCGGAGGGTCGGGCCAGCGCGCCGGCCCCGCGGGAGAGAAAGGGGC 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AAAAGAAAAGTAAAAAACTTCCCAACTCACTTTGTGTTATGTGGAGGAAATGTGTATTACCAATGGGGTT GTTAGCTTTTAAATCAAAATACTGATTACAGATGTACAATTTAGCTTAATCAGAAAGCCTCTCCAGAGAA GTTTGGTTTCTTTGCTGCAAGAGGAATGAGGCTCTGTAACCTTATCTAAGAACTTGGAAGCCGTCAGCCA AGTCGCCACATTTCTCTGCAAAATGTCATAGCTTATATAAATGTACAGTATTCAATTGTAATGCATGCCT TCGGTTGTAAGTAGCCAGATCCCTCTCCAGTGACATTGGAACATGCTACTTTTTAATTGGCCCTGTACAG TTTGCTTATTTATAAATTCATTAAAAACACTACAGGTGTTGAATGGTTAAAATGTAGGCCTCCAGTTCAT TTTCAGTTATTTTCTGAGTGTGCAGACAGCTATTTCGCACTGTATTAAATGTAACTTATTTAATGAAATC AGAAGCAGTAGACAGATGTTGGTGCAATACAAATATTGTGATGCATTTATCTTAATAAAATGCTAAATGT CAATTTATCACTGCGCATGTTTGACTTTAGACTGTAAATAGAGATCAGTTTGTTTCTTTCTGTGCTGGTA ACAATGAGCGTCGCACAGACATGGTTTCAGGTAAATAAATCTATTCTATGATAAAAAAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length	8329

CDS Information

Location	564..3692
CDS Sequence	Download Select all
CCDS ID	CCDS9143.1

Protein Information

Protein ID	NP_733765.1
Protein Name	ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2
Molecular Wt. (Da)	114626
Protein Sequence	Download Select all
Length	1042
Uniprot ID	Q02779
Ensembl Protein ID	ENSP00000253055

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	663
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S	Phosphorylation	38
S	Phosphorylation	38
K	Acetylation	464
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S	Phosphorylation	178
S	Phosphorylation	184
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Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
3667	IRS1	943	NP_005535.1	in vitro;in vivo	9295312
8660	IRS2	2878	NP_003740.2	in vitro;in vivo	9295312

Pathway Information

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Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

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cl02929	783-986	Cation_ATPase_C superfamily
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cl16182	418-527	Hydrolase_like2 superfamily
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cl02930	Apr-72	Cation_ATPase_N superfamily
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cl21460	597-711	HAD_like superfamily
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Ontology Information

HPRD ID	1162
Molecular Class	Membrane transport protein
Molecular Function	Transcription factor activity (GO:0003700)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
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Tumor Gene Family of Databases GO
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Osteosarcoma Database GO
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