CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
CTNND1	1500	Catenin (cadherin-associated protein), delta 1	11	CAS; p120; CTNND; P120CAS; P120CTN; p120(CAS); p120(CTN)

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20089989	2010	Cell line : - Source : VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. Sample Type : CRC tumor and Normal tissue No. of Sample : - Stage : -	Biochemical isolation to nano-LC-MS/MS analysis.	Down-regulation	-	-

Gene Details

Chromosome: 11; NC_000011.9 (57529234..57586652)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Armadillo repeat containing
Description	This gene encodes a member of the Armadillo protein family, which function in adhesion between cells and signal transduction. Multiple translation initiation codons and alternative splicing result in many different isoforms being translated. Not all of the full-length natures of the described transcript variants have been determined. Read-through transcription also exists between this gene and the neighboring upstream thioredoxin-related transmembrane protein 2 (TMX2) gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]
Chromosome	11
Location	11q11
Start	57761762
End	57819180
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815587:57761762-57819180 Homo sapiens chromosome 11, GRCh38.p2 Primary Assembly GGCTGACATCACTTAGGAAAGCGAAGGGGGTAGGGCTGCCAGATCAGTTTGTCACCACCCAGGCTCCCTT GCCTTTGGCTGGGTGCAACTTCCATTTTAGGTGTTGGATCTGAGGGGGAAAAAAAAGAGAGAGGGAGAGA GAGAGAAAGAAGAGCAGGAAAGATCCCGAAAGGAGGAAGAGGTGGCGAAAAATCAACTGCCCTGCTGGAT TTGTCTTTCTCAGCACCTTGGCGAAGCCTTGGGTTTCTTTCTTAAAGGACTGATTTTTAGAACTCCACAT TTGAGGTGTGTGGCTTTTGAAGAAAATGTATGTACTGACGGGAAAAGGAGGATAAGCAAGTCGAATTTTT GTCTTACGGTAACCGGAGGGAATTAAAAAACGGGAGAGTCTGTTATGCTGATGAGTAACTTTTAAGCAAT TATTTTTCTTTTCTACTTTCAGTACTTTGGCGGGGGAGATTTTGGTATTTTATTATATTTAAAAAGGTAA AATATACAAGACCTAGAAACAAACTTCTAGGTCTCTTTAATACAGGAAGCTGAATAGATCCAGAGGGGTA AGAGCAGGTTTGAAAATTTACATTTTGGTGTGTTCTTTGATTTTATTTATTTATTTTTCTGGATTAAGCT AACATATTTCTGTTTTCAGAGCCCAAATCAAAAGTTGGTTTTTTGGCATGTTGCATGTGGGTTGGGAAAG AAATTTGTCCGTGTCGGAACCCAGTTATACCGATGGTTCTTCATATGTTTAAAACTTTTTTTTTCTTTTA TCATTGGATTTGTGGAAGTGGAAAGTTGCAGGGAGCTTTGCAGTGTAAATGGTATTGTTTTTCCCCCAGA 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CCDS ID	CCDS44604.1

Protein Information

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Protein Name	Catenin (cadherin-associated protein), delta 1
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Protein Sequence	>1500 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRH QNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVET SDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGP YVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDV YGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRS YEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIK NCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREP NEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLV ENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPA NDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRS ALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSW NFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGY KELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSN TKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQV SYPSMQKI Download Select all
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Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

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Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
58	ACTA1	30	NP_001091.1	in vitro	11969288
1001	CDH3	227	NP_001784.2	in vivo	8660921
1308	COL17A1	223	NP_000485.3	in vitro;yeast 2-hybrid	10321838
2017	CTTN	1268	NP_005222.2	in vitro	12835311
2241	FER	1491	NP_005237.2	in vivo	12640114
2898	GRIK2	692	NP_068775.1	in vitro;in vivo	12151522
3728	JUP	1414	NP_002221.1	in vivo	7876318
4582	MUC1	1152	P15941	in vitro;in vivo	11181067
5777	PTPN6	1475	NP_536859.1	in vitro;in vivo	10835420
5795	PTPRJ	2955	NP_002834.3	in vitro;in vivo	12370829
5797	PTPRM	1479	NP_001098714.1	in vitro;in vivo	1 075 393 615 588 980
10009	ZBTB33	2269	AAH42753.1	in vivo;yeast 2-hybrid	10207085

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Adherens junction	hsa04520
Leukocyte transendothelial migration	hsa04670
Rap1 signaling pathway	hsa04015

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd00020	363-481	ARM
cl22454	363-481	ARM superfamily
cd00020	657-759	ARM
cl22454	657-759	ARM superfamily
cd00020	524-588	ARM
cl22454	524-588	ARM superfamily
cd00020	403-539	ARM
smart00185	440-481	ARM
smart00185	397-437	ARM
pfam00514	440-481	Arm
smart00185	703-738	ARM
pfam00514	397-436	Arm
pfam00514	703-738	Arm
cd13394	672-740	Syo1_like
cl23709	672-740	Syo1_like superfamily

Ontology Information

HPRD ID	1322
Molecular Class	Adhesion molecule
Molecular Function	GTPase activity (GO:0003924)
Biological Process	Cell communication (GO:0007154); Signal transduction (GO:0007165)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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COSMIC	GO
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TSGene	GO
Tumor Gene Family of Databases	GO
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G2SBC	GO
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