CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
DCN	1634	Decorin	12	CSCD; PG40; PGII; PGS2; DSPG2; SLRR1B

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
18550571	2008	Cell line : - Source : - Sample Type : Mouse model No. of Sample : - Stage : -	Gene expression assay, western blotting and immunohistochemistry	Down-regulation	-	Decorin was highly expressed in the differentiated area of human normal colonic mucosa, but was dramatically reduced in paired colorectal cancer tissues. Decorin acts as a tumor suppressor gene and plays an important role in the maintenance of cell maturation and therefore homeostasis in the intestinal tract.
18830193	2008	Cell line : - Source : Department of Gastrointestinal and General Surgery of Wroclaw Medical University Sample Type : CRC tumor and Normal tissue No. of Sample : 60 Stage : TNM Stage I-IV	Immunohistochemistry	Down-regulation	-	The expression of decorin may be involved in the differentiation of colonic polyps and reduced expression of decorin may abrogate the defensive potential of stromal tissue and promote the development of common types of colon carcinoma.
22930170	2012	Cell line : KM12C, KM12SM, HT 29 Source : ATCC Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	Microarray analysis,Real time RT-PCR and Flow cytometry	Down-regulation	-	Gene differentially expressed and analysed bye by Microarray.

Gene Details

Chromosome: 12; NC_000012.11 (91539035..91576806, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Proteoglycans / Extracellular Matrix : Small leucine-rich repeats
Description	The protein encoded by this gene is a small cellular or pericellular matrix proteoglycan that is closely related in structure to biglycan protein. The encoded protein and biglycan are thought to be the result of a gene duplication. This protein is a component of connective tissue, binds to type I collagen fibrils, and plays a role in matrix assembly. It contains one attached glycosaminoglycan chain. This protein is capable of suppressing the growth of various tumor cell lines. There are multiple alternatively spliced transcript variants known for this gene. This gene is a candidate gene for Marfan syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	12
Location	12q21.33
Start	91145258
End	91183029
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815586:c91183029-91145258 Homo sapiens chromosome 12, GRCh38.p2 Primary Assembly GAATCTACAATAAGACAAATTTCAAATCAAGTTGCTCCACTATACTGCATAAGCAGTTTAGAATCTTAAG CAGATGCAAAAAGAATAAAGCAAATGGGAGGAAAAAAAAGGCCGATAAAGTTTCTGGCTACAATACAAGA GACATATCATTACCATATGATCTAATGTGGGTGTCAGCCGGATTGTGTTCATTGAGGGAAACCTTATTTT TTAACTGTGCTATGGAGTAGAAGCAGGAGGTTTTCAACCTAGTCACAGAGCAGCACCTACCCCCTCCTCC TTTCCACACCTGCAAACTCTTTTACTTGGGCTGAATATTTAGTGTAATTACATCTCAGCTTTGAGGGCTC CTGTGGCAAATTCCCGGATTAAAAGGTATGGTTTTCAATAATTGTCCTGAACTCTGCTACAGACTAATAA AACTTCGGTCAAGTTGCGAGCAAAAGGGATTATTTGGTGAGAAAAAGAAAAGGAAAAAAAAAACTGTTAA ACTTTTATAGTTTTTATGCAACATTTTAAACAAGTATTATTTGAAAACAGAAGTTAAATATTTGATAAAA TGATTGAATGCATTGTTTTATTTCTTTCTCTTCTGTTTTTGCAAAGATGCTTCTTAAAAAACTGTAACCT AACACCATGACTCTCTATATTAATGTTTTTGTGTTTGTATTAATGAATGTTTAGCTCTTCAAGAGATGGT AACCGAAAAGTATTCTGAAGTAGCATATCTGTAATTGACCTATATATTTAAAAAATGTATTTTTCTCCTG AATTTTTGATTGCTTTAAGGACTTTTAAAAGCCCAGAAGAACTGAACTCTGGTGATTAGCTGAAAATACC 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CDS Information

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CDS Sequence	>gi\|47419925:409-1488 Homo sapiens decorin (DCN), transcript variant A1, mRNA ATGAAGGCCACTATCATCCTCCTTCTGCTTGCACAAGTTTCCTGGGCTGGACCGTTTCAACAGAGAGGCT TATTTGACTTTATGCTAGAAGATGAGGCTTCTGGGATAGGCCCAGAAGTTCCTGATGACCGCGACTTCGA GCCCTCCCTAGGCCCAGTGTGCCCCTTCCGCTGTCAATGCCATCTTCGAGTGGTCCAGTGTTCTGATTTG GGTCTGGACAAAGTGCCAAAGGATCTTCCCCCTGACACAACTCTGCTAGACCTGCAAAACAACAAAATAA CCGAAATCAAAGATGGAGACTTTAAGAACCTGAAGAACCTTCACGCATTGATTCTTGTCAACAATAAAAT TAGCAAAGTTAGTCCTGGAGCATTTACACCTTTGGTGAAGTTGGAACGACTTTATCTGTCCAAGAATCAG CTGAAGGAATTGCCAGAAAAAATGCCCAAAACTCTTCAGGAGCTGCGTGCCCATGAGAATGAGATCACCA AAGTGCGAAAAGTTACTTTCAATGGACTGAACCAGATGATTGTCATAGAACTGGGCACCAATCCGCTGAA GAGCTCAGGAATTGAAAATGGGGCTTTCCAGGGAATGAAGAAGCTCTCCTACATCCGCATTGCTGATACC AATATCACCAGCATTCCTCAAGGTCTTCCTCCTTCCCTTACGGAATTACATCTTGATGGCAACAAAATCA GCAGAGTTGATGCAGCTAGCCTGAAAGGACTGAATAATTTGGCTAAGTTGGGATTGAGTTTCAACAGCAT CTCTGCTGTTGACAATGGCTCTCTGGCCAACACGCCTCATCTGAGGGAGCTTCACTTGGACAACAACAAG CTTACCAGAGTACCTGGTGGGCTGGCAGAGCATAAGTACATCCAGGTTGTCTACCTTCATAACAACAATA TCTCTGTAGTTGGATCAAGTGACTTCTGCCCACCTGGACACAACACCAAAAAGGCTTCTTATTCGGGTGT GAGTCTTTTCAGCAACCCGGTCCAGTACTGGGAGATACAGCCATCCACCTTCAGATGTGTCTACGTGCGC TCTGCCATTCAACTCGGAAACTATAAGTAA Download Select all
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Protein Information

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Protein Name	Decorin
Molecular Wt. (Da)	36327
Protein Sequence	>1634 MKATIILLLLAQVSWAGPFQQRGLFDFMLEDEASGIGPEVPDDRDFEPSLGPVCPFRCQCHLRV VQCSDLGLDKVPKDLPPDTTLLDLQNNKITEIKDGDFKNLKNLHALILVNNKISKVSPGAFTPL VKLERLYLSKNQLKELPEKMPKTLQELRAHENEITKVRKVTFNGLNQMIVIELGTNPLKSSGIE NGAFQGMKKLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNKISRVDAASLKGLNNLAKLGLSFNS ISAVDNGSLANTPHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYLHNNNISVVGSSDFCPPGHNTK KASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK Download Select all
Length	359
Uniprot ID	P18846
Ensembl Protein ID	ENSP00000262053

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

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Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
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Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
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Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

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Ontology Information

HPRD ID	440
Molecular Class	Extracellular matrix protein
Molecular Function	Transcription factor activity (GO:0003700)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

View SNP Geneview Report

Drug Information

Uniprot ID DrugBank ID Name Type
P07585 DB03754 Tris SmallMoleculeDrug

External Links

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ICGC GO
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Osteosarcoma Database GO
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