CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
EIF2AK4	440275	eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4	15	GCN2, KIAA1338

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
25892863	2015	Cell line : - Source : Department of Gastroenterology of the General Hospital of Beijing Military Region, Beijing, China. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 23 CRC Stage : -	whole-exome sequencing	Polymorhpism	-	EIF2AK4 (p.Glu738_Asp739insArgArg) was found to represent a local Chinese variant, which was significantly enriched in early-onset CRC patient cohort compared to a control cohort of 100 healthy Chinese individuals .

Gene Details

NC_000015.9 (40226331..40327797)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	This gene encodes a member of a family of kinases that phosphorylate the alpha subunit of eukaryotic translation initiation factor-2 (EIF2), resulting in the downregulaton of protein synthesis. The encoded protein responds to amino acid deprivation by binding uncharged transfer RNAs. It may also be activated by glucose deprivation and viral infection. Mutations in this gene have been found in individuals suffering from autosomal recessive pulmonary venoocclusive-disease-2. [provided by RefSeq, Mar 2014]
Chromosome	15
Location	15q13.3
Start	40226331
End	40327797
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815583:39934124-40035596 Homo sapiens chromosome 15, GRCh38.p2 Primary Assembly CCCCGCCCCGCAGGCTGCCGGGGGCCCACCGCCGCCCAGGCAAGGCCGCCCTGCCTTGGGCGCAGCGCTG CCATGGCTGGGGGCCGTGGGGCCCCCGGGCGCGGCCGGGACGAGCCTCCGGAGAGCTACCCGCAACGACA GGACCACGAGCTACAGGCCCTGGAGGCCATTTACGGCGCGGACTTCCAAGACCTGCGGCCGGACGCTTGC GGACCGGTAGGAACGTGGCTTGTCAGGCCCGGGCTGGCGTGCCCTGGCCTCCCCGGGCCCTGGGCCAAAG CCCGGACACTTCCAGATTGGGCCGCCGCTTTAGGATCCTGCAGTCTTTTCATCCCTTAGGTTCCACCCAT GCTCACTTTAGTCCTTGCACCTGCAGCTGGTCTGCAGAATCCCACCTAGGCCGAATTCTTCTACAGTCCT TTCCCCATGATTTCCCCAGAGGAATCCCCCTGGATTCCTCCCTCTTACCTGGCACTGCTTCTTATTCCTG CCTACATCCCATAACATAACTGCCTCCTTCCAACCTTGTCCTTTTTCCCCTCTGAAAGCCCTTGCGGATG ATACCACAGCAATTCATACGCGCCCCTTGCTACTTTGTTCTGAGAACGCTTTTTGGGCTCTCGCACAGGC CTTACGTCCTCAATCAGAATTCTCAAGTCTCATCCATGCATTCAAATCTGCACGCCACATAATTCCCTCT GTACTCCCCAGGCATCCTCACTGTGTTTTCCGGTATGGAGGAACTTTCCATACCTCTGCACCTTCCTCTA AGACATTTAGCTCAGAATAAAGCACACATTCATCTTAGCTGTAGTAGAGAGAGGGTTCTAGACTGAGTCT 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PharmGKB ID	PA134947616

mRNA Information

mRNA ID	?NM_001013703.3
Exon
mRNA Sequence	>gi\|590122052\|ref\|NM_001013703.3\| Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4 (EIF2AK4), mRNA CCCCGCCCCGCAGGCTGCCGGGGGCCCACCGCCGCCCAGGCAAGGCCGCCCTGCCTTGGGCGCAGCGCTG CCATGGCTGGGGGCCGTGGGGCCCCCGGGCGCGGCCGGGACGAGCCTCCGGAGAGCTACCCGCAACGACA GGACCACGAGCTACAGGCCCTGGAGGCCATTTACGGCGCGGACTTCCAAGACCTGCGGCCGGACGCTTGC GGACCGGTCAAAGAGCCCCCTGAAATCAATTTAGTTTTGTACCCTCAAGGCCTAACTGGTGAAGAAGTAT ATGTAAAAGTGGATTTGAGGGTTAAATGCCCACCTACCTATCCAGATGTAGTTCCTGAAATAGAGTTAAA AAATGCCAAAGGTCTATCAAATGAAAGTGTCAATTTGTTAAAATCTCGCCTAGAAGAACTGGCCAAGAAA CACTGTGGGGAGGTGATGATCTTTGAACTGGCTTACCACGTGCAGTCATTTCTCAGCGAGCATAACAAGC CCCCTCCCAAGTCTTTTCATGAAGAAATGCTGGAAAGGCGGGCTCAGGAGGAGCAGCAGAGGCTGTTGGA GGCCAAGCGGAAAGAAGAGCAGGAGCAACGTGAAATCCTGCATGAGATTCAGAGAAGGAAAGAAGAGATA AAAGAAGAGAAAAAAAGGAAAGAAATGGCTAAGCAGGAACGTTTGGAAATTGCTAGTTTGTCAAACCAAG ATCATACCTCTAAGAAGGACCCAGGAGGACACAGAACGGCTGCCATTCTACATGGAGGCTCTCCTGACTT TGTAGGAAATGGTAAACATCGGGCAAACTCCTCAGGAAGGTCTAGGCGAGAACGTCAGTATTCTGTATGT 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TTCCCGATACTTCATTGAGTTTGAAGAATTACAACTTCTTGGTAAAGGAGCTTTTGGAGCTGTCATCAAG GTGCAGAACAAGTTGGACGGCTGCTGCTACGCAGTGAAGCGCATCCCCATCAACCCGGCCAGCCGGCAGT TCCGCAGGATCAAGGGCGAAGTGACACTGCTGTCACGGCTGCACCATGAGAACATTGTGCGCTACTACAA CGCCTGGATCGAGCGGCACGAGCGGCCGGCGGGACCGGGGACGCCGCCCCCGGACTCCGGGCCCCTGGCC AAGGATGACCGAGCTGCACGCGGGCAGCCGGCGAGCGACACAGACGGCCTGGACAGCGTAGAGGCCGCCG CGCCGCCACCCATCCTCAGCAGCTCGGTGGAGTGGAGCACTTCGGGCGAGCGCTCGGCCAGTGCCCGTTT CCCCGCCACCGGCCCGGGCTCCAGCGATGACGAGGACGACGACGAGGACGAGCACGGTGGCGTCTTCTCC CAGTCCTTCCTGCCTGCTTCAGATTCTGAAAGTGATATTATCTTTGACAATGAAGATGAGAACAGTAAAA GTCAGAATCAGGATGAAGATTGCAATGAAAAGAATGGCTGCCATGAAAGTGAGCCATCAGTGACGACTGA GGCTGTGCACTACCTATACATCCAGATGGAGTACTGTGAGAAGAGCACTTTACGAGACACCATTGACCAG GGACTGTATCGAGACACCGTCAGACTCTGGAGGCTTTTTCGAGAGATTCTGGATGGATTAGCTTATATCC ATGAGAAAGGAATGATTCACCGGGATTTGAAGCCTGTCAACATTTTTTTGGATTCTGATGACCATGTGAA AATAGGTGATTTTGGTTTGGCGACAGACCATCTAGCCTTTTCTGCTGACAGCAAACAAGACGATCAGACA GGAGACTTGATTAAGTCAGACCCTTCAGGTCACTTAACTGGGATGGTTGGCACTGCTCTCTATGTAAGCC 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CAACTTACATCAGAAAAGCAGTGAAATTGAAATTCTGGCTGTGGATCTACCCAAAGAAACAATATTACAG TTTTTATCATTAGAGTGGGATGCTGATGAACAGGCATTTAACACAACTGTGAAGCAGCTGCTGTCACGCC TGCCAAAGCAAAGATACCTCAAATTAGTCTGTGATGAAATTTATAACATCAAAGTAGAAAAAAAGGTGTC TGTGCTATTTCTGTACAGCTATAGAGATGACTACTACAGAATCTTATTTTAACCCTAAAGAACTGTCGTT AACCTCATTCAAACAGACAGAGGCTTATACTGGAATAATGGAATGTTGTACATTCATCATAATTTAAAAT TAAATTCTAAGAAGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACACCTTTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCAG GAAGACTGCTTGAAACCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGAGCAACAAAGCAAGACCCCATCTCTATAAAAAC TAAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGATGGATCAT CTGAGCCTCAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCTGTGACTGCGCCACTGCACTCCAGTCTGGGACAACAGA GCAAGACCCTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTTTTTTCTAAGAAGCTGTCCTACAAAGTTGAG CTTTGTTAGTTTTTCATGTGTAATATATTATAAATTTATCTTTTGGGATATAATAAATGCTTTCATATAC CTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length

CDS Information

Location
CDS Sequence	>lcl\|NM_001013703.3_cds_NP_001013725.2_1 [gene=EIF2AK4] [protein=eIF-2-alpha kinase GCN2] [protein_id=NP_001013725.2] [location=73..5022] ATGGCTGGGGGCCGTGGGGCCCCCGGGCGCGGCCGGGACGAGCCTCCGGAGAGCTACCCGCAACGACAGG ACCACGAGCTACAGGCCCTGGAGGCCATTTACGGCGCGGACTTCCAAGACCTGCGGCCGGACGCTTGCGG ACCGGTCAAAGAGCCCCCTGAAATCAATTTAGTTTTGTACCCTCAAGGCCTAACTGGTGAAGAAGTATAT GTAAAAGTGGATTTGAGGGTTAAATGCCCACCTACCTATCCAGATGTAGTTCCTGAAATAGAGTTAAAAA ATGCCAAAGGTCTATCAAATGAAAGTGTCAATTTGTTAAAATCTCGCCTAGAAGAACTGGCCAAGAAACA CTGTGGGGAGGTGATGATCTTTGAACTGGCTTACCACGTGCAGTCATTTCTCAGCGAGCATAACAAGCCC CCTCCCAAGTCTTTTCATGAAGAAATGCTGGAAAGGCGGGCTCAGGAGGAGCAGCAGAGGCTGTTGGAGG CCAAGCGGAAAGAAGAGCAGGAGCAACGTGAAATCCTGCATGAGATTCAGAGAAGGAAAGAAGAGATAAA AGAAGAGAAAAAAAGGAAAGAAATGGCTAAGCAGGAACGTTTGGAAATTGCTAGTTTGTCAAACCAAGAT CATACCTCTAAGAAGGACCCAGGAGGACACAGAACGGCTGCCATTCTACATGGAGGCTCTCCTGACTTTG TAGGAAATGGTAAACATCGGGCAAACTCCTCAGGAAGGTCTAGGCGAGAACGTCAGTATTCTGTATGTAA 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CCDS ID	CCDS42016.1

Protein Information

Protein ID	NP_001013725.2
Protein Name	eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4
Molecular Wt. (Da)	0
Protein Sequence	Download Select all
Length	1649
Uniprot ID	A6NK89
Ensembl Protein ID	ENSP00000485526

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	230
S	Phosphorylation	205
K	Acetylation	1259
T	Phosphorylation	667
S	Phosphorylation	1040

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
4086	SMAD1	3356	NP_005891.1	in vivo	15761153
4089	SMAD4	2995	NP_005350.1	in vivo	15761153
7046	TGFBR1	1822	NP_004603.1	in vivo	15761153

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Epstein-Barr virus infection	hsa05169
Hepatitis C	hsa05160
Herpes simplex infection	hsa05168
Influenza A	hsa05164
Measles	hsa05162
Protein processing in endoplasmic reticulum	hsa04141

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd14046	583-999	STKc_EIF2AK4_GCN2_rpt2
cl21453	583-999	PKc_like superfamily
cd14012	299-538	PK_eIF2AK_GCN2_rpt1
cl21453	299-538	PKc_like superfamily
cd13996	584-999	STKc_EIF2AK
cd14048	584-999	STKc_EIF2AK3_PERK
cd14047	584-997	STKc_EIF2AK2_PKR
cd08215	590-1001	STKc_Nek
cd14049	584-999	STKc_EIF2AK1_HRI
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cd13999	798-997	STKc_MAP3K-like
cd08529	589-1001	STKc_FA2-like
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cd05117	797-999	STKc_CAMK
cd08217	589-1001	STKc_Nek2
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cd00180	332-537	PKc
cd14003	796-999	STKc_AMPK-like
cd14099	796-996	STKc_PLK
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cd06610	798-997	STKc_OSR1_SPAK
cd06609	798-997	STKc_MST3_like
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cd05123	797-993	STKc_AGC
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cd00773	1061-1385	HisRS-like_core
cl00268	1061-1385	class_II_aaRS-like_core superfamily
cd13994	802-999	STKc_HAL4_like
cd06612	798-997	STKc_MST1_2
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cl02687	26-137	RWD superfamily
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cd14007	797-997	STKc_Aurora
pfam05773	21-134	RWD
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cd06631	334-539	STKc_YSK4
cd06623	589-1001	PKc_MAPKK_plant_like
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Ontology Information

HPRD ID	19177
Molecular Class	Receptor tyrosine kinase
Molecular Function	Molecular function unknown (GO:0005554)
Biological Process	Biological_process unknown (GO:0000004)

SNP Information

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