CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
JHDM1D	80853	Jumonji C domain-containing histone demethylase 1 homolog D (S. cerevisiae)	7	KDM7A

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
22930170	2012	Cell line : KM 12C, KM 12SM, HT 29 Source : ATCC Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	Microarray analysis,Real time RT-PCR and Flow cytometry	Up-regulation	-	Gene differentially expressed and analysed bye by Microarray. KM12C, KM12SM (SM), HT-29 cell line were used for this study.

Gene Details

Chromosome: 7; NC_000007.13 (139784546..139876741, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Chromatin-modifying enzymes / K-demethylases, Zinc fingers, PHD-type
Description	-
Chromosome	7
Location	7q34
Start	140084746
End	140176956
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815591:c140176956-140084746 Homo sapiens chromosome 7, GRCh38.p2 Primary Assembly GTGTGTGTGTTTTTTAAAGATGGCCGGAGCGGCGGCGGCGGTGGCCGCGGGAGCAGCAGCTGGAGCCGCC GCGGCAGCCGTGTCGGTGGCGGCTCCCGGCCGGGCCTCGGCGCCTCCGCCGCCCCCGCCCGTGTACTGTG TGTGCCGGCAGCCGTACGACGTGAACCGCTTCATGATCGAGTGCGATATCTGCAAGGACTGGTTCCACGG CAGGTAAATAAACCCCCTCCAGCCCCGCAGCCGCCACCGCCGGCCACCGACCAACCGCCGCCGCCGCCGG CCGCCCGCGCCTCCCTCGGGCCGGGCCGCCGCGCCGCGCCCAGCTTTCAGGGGGCCCCGGTGCCTAGCCC CCCGGCCGGGCAGTGGGGCGCGCGGTGCCCCGGGTTCGCCGGGCGGGCTCCAGAGGGGAGCCGGTGGGCT CGCCTGGCCCGGGCGAAGAGTCGCCACAACAAACACGAACAAAGAGGGCCGGCGGATAAGTTGGCAGGGG GAGCCTGGGGCGAGGGGACGCGGCCGGGCGGGCGCGGCGGGGGCGTCGGGCGGAGCGCCGGCCGGGTCCG CAGCCCCTCGCCAGCCCGGGCCGCCGCCGCCCCGCCCCGCCCCGCCGCGCCCGGGGCTCCGGCCGGAGTC GCCGGCCGCCCCGCCGCTCTGCCCGGCCGGCCGACGCGCCTGCCTTCCTTCCGGGCGGCGATGGGGTCGC CCCGGCCCCGCGTCTCCTCCGCGCCGCGGGTCCCTGTCGCGCCCCCTTCCCCGTCTTTATCAAACTTCCT GGGCCAGTGGGACGGGGGCAGCGGCGGGCCGGAGAGGCGACCGCGCCAGCCAGCTCGGCGGGGCTCCGCG 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ATTCTTCCAAGTTTATCTGCTCTGCACTATTTCACTAATAAACCCTGGCTACCACGTAGCCCTT GATCTCCAAGTAGTTTACCTATGCAAGACCTGTGACACTCTGAATTCACTTCTCTTTCTTTCAG AAAGTAGTCATAAATGGAGCTTAATTATAAAGGTAAAACTTGTCTCCAACCAGTTTCATTTTGG CCATTTCTTTTTCAAAATGTCAGCTGTTTTCCTCCAAGATTTTTCACCAAAACAATGATCATAA GTGCTGGAATATATAATACTTTGCAGGCATAAAATAACCCAGACATACTCTCATATTTCTTTGG TGTATTTTGGTTGGTAAAACTTACCAGCATTAAATGTAAAATATAATGAGGAGTTAATTCCTTA CCTAGAACTATTTCTTCCTTTTAAGATTCATAAGTAACCTTTTATTTTTACAGAGCTACGTATA ACTTCCACATTACAGTCAGGGACCTGAGGTGTAACTTACTAAGTGAACCCCAAGGTTATTTTAT CTTGCAAAAGAAACCTAAACCAAACTAAGGGCCTTACAGTTTATGGTTAGACTGAATCAAAAGC TATAACCTCAATTTTTCCAAAAACAGCTTCTGACTGCAAAAGCAAGTCATACAGTTGTTAGGTA TGAAATAGCACTGATCAGGAAATGCATCTTCGCAGATGGTATTTCCTTCAGAAAAGACTTTTCT ACTTTTAATATAAATTAAGCCATAACAGTTTCATGCTGTGGAAAGAGGGTGAAAAGGTTCATTT TAAGAGATTATATAATATGAACTTTCACATTTACTGTGAAATGTCTAACTTTGCCAGTGCTTCA GCAAGTTTTTTTGGGGGGTGATGGGGAGGGGTAGTATTGGTTTTAGAGGTTTCAAATCTGTGAA CTTTGGAGAGGGGACAGTTGTTGGCTCTGGTATTTACTAGTTTTGTAGTAACGTTTTGCTAGCC TGACTGACTTTTCTTACTGGTTTTTATGCCCACGGTCCGAGGGGACTGTTCTTCTTGTTGGGGG TGTCTGCGGAATAGCGTCTCGTCTTGTTTGTATAGGCAGTCAATGTGTGTGACATGTGTGTCCT TTCAGTCCGGAAGCCCACTGTGTGACAATGGCGTGGGGTGTGGCTGGGAGGTGGGGTGCTGAAG CTTGAAGAGCATTTCTTTGCTGATTCATAACAGTATTTCCCATCTTTTGCCTGCAGGCAGGGAA AGTGTACAGTATTTATTTTGTTTCTGTTTTACTTTAAATTTGTAAGTCTTTAAGTAGCTTACAT TGATTATTATAGGGGAGGACAAGTGACTTGTTTAAAGTTGTATTTAGTATTCTTTCCAATTTCT GTATTTTAAAATATTGAAATTAAAATTGTATTACTTCTGTTTTGATTTTTTTAGCACTTAGTGT ATTTTTTGCTCATTTTGTTTGAAAGTATAAATGTTGAAAATTGTATAAAATGCGTCCTTGAAAG AAAAAGAATCTGAATTCTATATCCAA Download Select all
Length	9178

CDS Information

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CDS Sequence	>lcl\|NM_030647.1_cds_NP_085150.1_1 [gene=KDM7A] [protein=lysine-specific demethylase 7A] [protein_id=NP_085150.1] [location=5..2830] ATGGCCGGAGCGGCGGCGGCGGTGGCCGCGGGAGCAGCAGCTGGAGCCGCCGCGGCAGCCGTGTCGGTGG CGGCTCCCGGCCGGGCCTCGGCGCCTCCGCCGCCCCCGCCCGTGTACTGTGTGTGCCGGCAGCCGTACGA CGTGAACCGCTTCATGATCGAGTGCGATATCTGCAAGGACTGGTTCCACGGCAGCTGTGTTGGAGTAGAA GAACATCATGCTGTTGACATTGACCTGTATCACTGTCCCAACTGTGCAGTTTTACATGGTTCCTCCTTGA TGAAAAAAAGGAGGAACTGGCACAGACATGACTACACAGAAATTGATGATGGTTCCAAACCAGTGCAAGC TGGAACTAGAACTTTCATTAAGGAATTACGCTCTCGAGTCTTCCCAAGTGCCGATGAAATAATTATAAAG ATGCATGGCAGCCAGCTGACACAAAGATATCTGGAGAAACATGGATTTGATGTCCCTATTATGGTCCCAA AATTAGATGATCTAGGACTCAGGCTCCCTTCACCTACATTTTCTGTGATGGATGTGGAACGTTATGTAGG TGGTGACAAAGTGATAGATGTCATTGATGTGGCGAGGCAGGCAGACAGCAAAATGACACTTCACAATTAT GTTAAATACTTCATGAATCCTAACAGACCAAAAGTGTTAAATGTGATCAGCCTTGAATTTTCAGATACAA AGATGTCTGAATTGGTGGAGGTCCCTGATATAGCCAAAAAACTTTCCTGGGTGGAAAATTATTGGCCAGA TGATTCAGTCTTTCCCAAGCCATTTGTTCAGAAATATTGCTTAATGGGAGTTCAAGACAGCTATACAGAT TTCCACATTGACTTCGGTGGAACTTCAGTCTGGTACCATGTCCTCTGGGGTGAGAAGATTTTTTATTTAA TAAAGCCAACAGATGAAAATTTGGCACGTTATGAATCTTGGAGTTCATCTGTGACCCAGAGTGAGGTGTT CTTTGGAGATAAGGTGGATAAATGCTACAAATGTGTGGTAAAGCAGGGACATACCTTATTTGTTCCTACA GGGTGGATCCATGCTGTGCTCACTTCTCAGGACTGTATGGCTTTTGGGGGGAACTTCCTGCACAACCTTA ACATTGGCATGCAGCTCAGGTGTTATGAGATGGAGAAAAGGCTAAAAACACCAGATCTTTTCAAATTCCC TTTCTTTGAAGCCATATGTTGGTTTGTAGCCAAAAACTTGCTGGAAACCCTGAAAGAACTGAGAGAAGAT GGTTTCCAGCCTCAAACTTACCTAGTACAGGGAGTGAAAGCACTGCATACTGCTTTAAAATTATGGATGA AAAAAGAACTTGTATCTGAACATGCCTTTGAAATTCCAGACAATGTTAGACCTGGACACCTTATTAAAGA ACTTTCTAAAGTAATTCGAGCAATAGAGGAGGAAAACGGCAAACCAGTTAAATCTCAGGGAATTCCTATT GTGTGTCCAGTTTCACGATCCTCAAATGAAGCAACTTCCCCATACCATTCCCGAAGAAAGATGAGGAAAC TTCGAGATCATAATGTCCGAACTCCTTCTAACCTAGACATCCTAGAGCTCCACACAAGGGAGGTCCTCAA AAGATTAGAGATGTGTCCATGGGAAGAGGACATCTTGAGCTCTAAACTGAATGGAAAATTCAACAAACAT CTCCAACCATCCTCCACAGTACCTGAATGGAGAGCGAAAGATAATGATCTACGATTACTGCTGACAAATG GAAGAATAATTAAAGATGAAAGGCAGCCCTTTGCAGATCAAAGTCTTTATACAGCAGATAGTGAAAATGA AGAGGATAAAAGAAGGACAAAAAAGGCAAAAATGAAGATAGAAGAGAGTTCAGGAGTAGAGGGAGTGGAA CATGAAGAATCTCAAAAACCACTGAATGGGTTTTTTACACGTGTGAAATCAGAACTCAGGAGTAGATCAT CAGGATATTCTGATATTTCTGAGTCAGAAGACTCCGGACCCGAGTGCACTGCACTGAAAAGTATCTTTAC CACTGAAGAGTCTGAAAGTTCAGGTGATGAAAAGAAACAAGAAATAACATCCAACTTTAAGGAGGAATCT AATGTGATGAGGAACTTCCTTCAAAAGAGCCAGAAGCCATCTAGAAGTGAAATTCCAATTAAAAGGGAAT GTCCTACCTCGACGAGCACAGAGGAAGAAGCTATTCAGGGCATGCTGTCTATGGCAGGGTTGCACTATTC CACGTGTTTACAAAGGCAAATACAAAGCACAGACTGCAGTGGTGAAAGAAACTCTCTCCAGGATCCCAGC AGCTGCCATGGCAGTAACCATGAGGTTAGGCAGTTGTATCGCTATGATAAACCAGTGGAATGTGGATACC ATGTCAAGACTGAAGATCCAGACTTGAGGACTTCCTCCTGGATTAAACAGTTTGATACTTCCAGATTTCA TCCTCAGGATCTAAGTAGAAGCCAGAAATGCATCAGAAAGGAAGGTTCATCAGAAATTAGTCAGAGGGTA CAAAGTAGGAATTATGTGGACAGCAGCGGCTCAAGCCTTCAGAATGGAAAGTATATGCAGAATTCAAACC TGACTTCGGGGGCGTGCCAGATAAGTAATGGCAGTCTAAGCCCAGAAAGGCCAGTTGGTGAAACTTCCTT CTCGGTGCCCCTTCACCCCACCAAGAGACCGGCATCAAATCCACCACCTATCAGCAACCAGGCAACAAAA GGTAAACGTCCAAAAAAAGGAATGGCAACAGCCAAACAACGTCTTGGGAAGATCCTTAAGTTGAACAGAA ATGGCCATGCACGTTTCTTTGTGTGA Download Select all
CCDS ID	CCDS43658.1

Protein Information

Protein ID	NP_085150.1
Protein Name	Jumonji C domain-containing histone demethylase 1 homolog D (S. cerevisiae)
Molecular Wt. (Da)	106426
Protein Sequence	>80853 MAGAAAAVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHG SCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKELRS RVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERYVGGDKVI DVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIAKKLSWVENYWP DDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIKPTDENLARYESWSSS VTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAFGGNFLHNLNIGMQLRCYEM EKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQTYLVQGVKALHTALKLWMKKELV SEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMR KLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDND LRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNG FFTRVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMR NFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQIQSTDCSGERNSLQD PSSCHGSNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEG SSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSFSVPLHPTKR PASNPPPISNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV Download Select all
Length	941
Uniprot ID	P21333
Ensembl Protein ID	ENSP00000353467

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	710
S	Phosphorylation	714

Enzyme Information

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PPi Information

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Pathway Information

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Structure Information

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Domain Information

ID	Location	Description
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cd15612	53-85	PHD_OBE1_like
PRK07403	158-255	PRK07403
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Ontology Information

HPRD ID	626
Molecular Class	Unclassified
Molecular Function	Extracellular matrix structural constituent (GO:0005201)
Biological Process	Cell growth and/or maintenance (GO:0008151)

SNP Information

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
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CCDB GO
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Osteosarcoma Database GO
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ICGC	GO
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