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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
PTPN1	5770	protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1	20

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
23990346	2014	Cell line : - Source : - Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : -	Immunohistochemistry, real-time PCR and Western blotting.	Up-regulation	-	PTP1B�expression might play a critical role in the progression of CRC and may serve as a valuable prognostic biomarker for CRC.

Gene Details

Chromosome 20 - NC_000020.11 (50510321..50584762)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Protein tyrosine phosphatases / Class I Cys-based PTPs : Non-receptor
Description	The protein encoded by this gene is the founding member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family, which was isolated and identified based on its enzymatic activity and amino acid sequence. PTPs catalyze the hydrolysis of the phosphate monoesters specifically on tyrosine residues. Members of the PTP family share a highly conserved catalytic motif, which is essential for the catalytic activity. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP has been shown to act as a negative regulator of insulin signaling by dephosphorylating the phosphotryosine residues of insulin receptor kinase. This PTP was also reported to dephosphorylate epidermal growth factor receptor kinase, as well as JAK2 and TYK2 kinases, which implicated the role of this PTP in cell growth control, and cell response to interferon stimulation. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.
Chromosome	20
Location	20q13.1-q1
Start	50510321
End	50584762
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815578:50510321-50584762 Homo sapiens chromosome 20, GRCh38.p2 Primary Assembly CCTTCTGCTTCAGGGGCGGAGCCCCTGGCAGGCGTGATGCGTAGTTCCGGCTGCCGGTTGACATGAAGAA GCAGCAGCGGCTAGGGCGGCGGTAGCTGCAGGGGTCGGGGATTGCAGCGGGCCTCGGGGCTAAGAGCGCG ACGCGGCCTAGAGCGGCAGACGGCGCAGTGGGCCGAGAAGGAGGCGCAGCAGCCGCCCTGGCCCGTCATG GAGATGGAAAAGGAGTTCGAGCAGATCGACAAGTCCGGGAGCTGGGCGGCCATTTACCAGGTGCGGGAGC GCCCCGGAGCGTGGCGGGCCCTTCGCTTAGGCCGCTTGAACATCCCCTCAGACCTCCAGGCCCCAGACTC CCTCTGGGTCTTGCCCTCTGCCTCGCTCCTACTGCTTGAGGATTCGATGGGACAGCGACGCACTGCGTCC CCCCACCCTTTGTCCCCGGGGCGGGCGTGTTTCTCGCCGCAGCGTCGGAGCCCCCTTCGATCCCCCACCT CCCTTCTGTTCTCCAGCTCGGGTGATCTCTCAAGCCGGGGGACCGCCGGTCTGTGCTCTCAACGCGAATC CCTCGCACCCCGACCCCGCCCCCTGCCTGTCCACTCTTTGTCCCCTGGGGTGATTTAGCACCCCCACTAT TTCCTTTTCTGGAGTGGACCACCTCAGACTCTCTTCCTTTGTCTCCCTGGGGGAAAAGGTTACTCCCCCC GTCCCTCCTTCACATTTCCTTTCCCCTAGTCTCAGTGTGCGTCGAGTCCCAGAGATGACAGTCCCCTTTC CCCTTTCTGTTCATTCATTTATTGGATAGGAGTTGGCAAGCTTATTCTGTGCTAGGCACCGCTTAGGCAT 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CDS Information

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CCDS ID	CCDS13430.1

Protein Information

Protein ID	NP_002818.1
Protein Name	protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1
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Protein Sequence	>5770 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDN DYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQK EEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFL NFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKF RMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPH NGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAPYGIESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQA ASPAKGEPSLPEKDEDHALSYWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSNT Download Select all
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Ensembl Protein ID	ENSP00000232424

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
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S	Phosphorylation	243
S	Phosphorylation	242
S	Phosphorylation	50
S	Phosphorylation	242
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S	Phosphorylation	378
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S	Phosphorylation	352
S	Phosphorylation	378
S	Phosphorylation	386
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Y	Phosphorylation	152
Y	Phosphorylation	153
Y	Phosphorylation	66
S	Phosphorylation	50
Y	Phosphorylation	20;-
Y	Phosphorylation	20;-
S	Phosphorylation	295;-

Enzyme Information

EC	3.1.3.48
Name	protein-tyrosine-phosphatase phosphotyrosine phosphatase phosphoprotein phosphatase (phosphotyrosine) phosphotyrosine histone phosphatase protein phosphotyrosine phosphatase tyrosylprotein phosphatase phosphotyrosine protein phosphatase phosphotyrosylprotein phosphatase tyrosine O-phosphate phosphatase PPT-phosphatase PTPase [phosphotyrosine]protein phosphatase PTP-phosphatase
Class	Hydrolases; Acting on ester bonds; Phosphoric-monoester hydrolases
Sysname	protein-tyrosine-phosphate phosphohydrolase
Substrate	protein tyrosine phosphate [CPD:C01167]; H2O
Product	protein tyrosine [CPD:C00585]; phosphate
Reaction (IUBMB)

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
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1499	CTNNB1	286	NP_001895.1	in vivo	12377785
2099	ESR1	589	NP_000116.2	in vitro	7539106
2885	GRB2	150	NP_002077.1	in vivo	1 238 817 010 660 590
3480	IGF1R	932	NP_000866.1	in vivo	8999839
3643	INSR	975	NP_000199.2	in vitro;in vivo	88 269 751 223 745 500 000 000 000 000 000 000 000
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3717	JAK2	993	NP_004963.1	in vivo	11694501
4058	LTK	1052	NP_002335.2	in vitro	12237455
4792	NFKBIA	1235	NP_065390.1	in vivo	8940099
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Pathway Information

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Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

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COG5599	28-276	COG5599
PHA02738	39-274	PHA02738
PHA02746	7-274	PHA02746
PHA02747	38-269	PHA02747
PHA02740	40-282	PHA02740
COG2453	125-281	CDC14

Ontology Information

HPRD ID	9025
Molecular Class	Tyrosine phosphatase
Molecular Function	Chaperone activity (GO:0003754)
Biological Process	Protein metabolism (GO:0019538)

SNP Information

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Drug Information

Uniprot ID DrugBank ID Name Type
P18031 DB01133 Tiludronate SmallMoleculeDrug

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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