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Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
22968445	2012	Cell line : - Source : Department of Pathology of Wrocaw Medical University. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 8 Stage : -	Laser capture microdissection,FFPE-FASP,SAX fractionation,LC-MSMS,Label-free quantitation.	Up-regulation	-	A list of genes including this gene are differentially expressed analysed by LC-MS/MS technique. To compare the proteomes of colonic mucosa (normal or N) and colon cancer (cancer or C), we analyzed archival FFPE clinical samples originating from eight patients.

Gene Details

Chromosome: 10; NC_000010.10 (105727470..105787342)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	-
Chromosome	10
Location	10q24.33
Start	103967182
End	104029233
Strand	-
Gene Sequence	>gi|568815588:103967182-104029233 Homo sapiens chromosome 10, GRCh38.p2 Primary Assembly CTGGGGAGGGAGACAGGCGGCGGCGGCGGCGCCCCAGACCCGAGGGGACGCGCGGGCCTTGCGCCGCGGG AGCGGACGGCGGCGGAGGAGACCCTAGGCTCGCGGCCCGAGGCGGGAGGGCTCGGCTTCTCGACTGCCCG CCTCCGAGGCCGCCGGCCGCTTCTCTCTCCCAGAGTGGCCGCCGCCCCTGGAGACTCGCCGTGACACGGG CCTAAGCCGCCGCCGCGGGAGTCCTGACCGCTCGGACCCGTCGGATCAGGCCGGGTGGGAGCGAGCTTGC GGGCAGGTGCCGCTCCCGGAGGGTGGGCCGGAGGCGAGGCGCCCACCGCGCGGCTCGCGGGCCGGGCTCG GCGGAGGGGCCGCTCGCGCAGCACCCCCACCGCGGGCCGGAGCCCGGGTCGCCGCCCCGCCTTCTCCCGG GACCGCCCGGCCGGAGCTGCGGGGGCCGAGGGACGCCGCGCCCGCCGCCGCCAGCCGGGCTCGCGCGGGA GAGCAGGGAAGAGAAACTTTGCCTTTTATTGTTTTTAGTCCTTAAGTGCAAGGAACTCTGTGTTGGGAGG AAAAATGTCCTTCTTCAATTTCCGTAAGATCTTCAAGTTGGGGAGCGAGAAGAAGAAGAAGCAGTACGAA CACGTGAAGAGGGACCTGAACCCCGAAGACTTTTGGGAGATTATAGGAGAACTGGGCGACGGAGCCTTTG GGAAAGTGTACAAGGTAAGAGGGGGAAAACGGGAAGTTGTACTGCGAAGGTAAAACAGCCACTGGCCTGG AGTGGCGGGAGGACTTCTGCTCCCCTGGTCCTTATCCTGTCCTTCTTTTGACTGTTACGGTTCGATGCAA 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TATTTGAAGAGGGATTGGGAAGGAACGTCTTCATACCACTTTCTCCTTTGAAATTTTCAGTTTA TTGACTTTTAAAAAATGAATACCTCAGGCAGTAGACATTTTTTTTCTAGTATCATTTAATTGAT ACCCTGTGCGCTAAATAGTGTGTGGTGCCTGATTAATTTGGTCTGAATATTTGATTCTTTCTGT TCCTTTCAACTTGACATTCAGATTATTGACTCAAGGAGAGAGGCTCAGAGTGGAATGGTTGGCG CTGTGGGTAAGGTTGGATCTCCCTTAAAACTGCCTTTTGGATTCAGTGTTTGTGCTTGAGTTCG CTTTCAAATATGACCATAATCGTGTGGGTGCAAGACTGTACAGTGATACATATGTAGAGGTAAA GCATTCATTTTAATACTTAAAGTTATATAAATCTTTTCAAAAAGTGTTTTGTTATAAAATACGC TGTTTGTACCCATACCAGCCCACCTCTTCTGAGGCCCTGTATTCAAATAGATGATAGTGATCTA TCTTTCCTGCATGAAGTGTAGGTGGCGAGTGGGCGAGGGGCGCAGACTTCTTTGAAATCGAAGG GTACAGTCAAATCTACTGCTGATTTGGTTGTTTTGTTGCTGTGGCAGAATATGCCATGAAACAC ATACAGACTTCTCCGAACGTGCACCCTCATCAGCCACCTCCTCCCCTCTTTCCCTGAGTGCTGT GAACACAGCAGACCTGCACACTTCTGCAGATCCAGCTCCTACAGCTTGGGGCACTAGGCTGCCT TTCCTAGTCCTGTCAACAACCATACAGTGCGAATTGCTGAATTAGCTGCTATTCTATGTGGAGT CACATTAAGCTTTTTCTTATCTTTTTCTATGGGGAAGCTATAGGGTGGGTAAGGAAAAAATGTT GAATGCTTTTACTTTGCTGAAAATATTAGAACTCTCTTGTGACAGGATACAGCAAATTATAATT AAATATAAATTACCAGAACCAGAGCTACCTCTAAGTCATACTTCCTCAAGCACAAAGCTCTCAG GCATATGAGACCCACCTTAATGAAGGGTCTCTGATTTCTTGAGCATCAGCGAGTTTCAGAAGTG ACTATTTTTTTGTACTCTTCTAGTTTCCTTGTAACTATACACTTTTTCCCATTCCACACTGTGC TTAAATGACAAAGACTCTTCTGAGAAGCCAAATTCTGTCCAAGTATTAACTAGAGATATTGTTG ATTAAAGAAAATCTAGAACTGAAGTGAAAGAAGAGAGTTCCAGTTCTAATAGTCTTTTGATTAA CAATTCTTTTCTGAGAAATGATTTTTATAAGAAATGGGGTGATTCTTTAAATGCTTTTCTTAAG TTGAAGGCACAACAGTTAATGGCTGTATTGTTGCTATTCCGTTGCTGACATGTTTTTGATAAAG CTTTAACATTCCTGCTACTAATTTTGGCGGAGAGTGTTTGCCAGGTTTCAATGTGGGCTGCAGC TTTTTGTGCTCCTTCTCTGGTTTGCAGTGTAATGAGTTCATAAGCTAAATTTTCAGAAAGAATT TTGTTTAAGATTATGCCTCTTATCTACTTGAGAGCAACATGTCTTTTCAATCATGGGATTGACA CATGAAAAATAAAGTTATTTCTTAATCAA    Download   Select all
Length	6429

CDS Information

   

Location	join(565..714,23494..23658,25417..25465,25803..25952, 31718..31790,31938..32132,32686..32767,34263..34391, 34991..36346,38380..38510,38731..38854,40996..41175, 43635..43727,50979..51108,51603..51727,52553..52741, 53307..53432,54439..54552,58393..58539)
CDS Sequence	>lcl|XM_011540401.1_cds_XP_011538703.1_1 [gene=SLK] [protein=STE20-like serine/threonine-protein kinase isoform X1] [protein_id=XP_011538703.1] [location=565..2916] ATGTCCTTCTTCAATTTCCGTAAGATCTTCAAGTTGGGGAGCGAGAAGAAGAAGAAGCAGTACGAACACG TGAAGAGGGACCTGAACCCCGAAGACTTTTGGGAGATTATAGGAGAACTGGGCGACGGAGCCTTTGGGAA AGTGTACAAGGCCCAGAATAAAGAGACCAGTGTTTTAGCTGCTGCAAAAGTGATTGACACTAAATCTGAA GAAGAACTTGAAGATTACATGGTAGAGATTGACATATTAGCATCTTGTGATCACCCAAATATAGTCAAGC TTCTAGATGCCTTCTATTATGAGAACAATCTTTGGATCCTCATTGAATTTTGTGCAGGTGGAGCAGTAGA TGCTGTGATGCTTGAACTTGAGAGACCATTAACTGAGTCCCAAATACAAGTAGTTTGCAAGCAGACTTTA GATGCATTGAACTACTTACATGATAATAAGATCATCCACAGAGATCTGAAGGCTGGCAACATTCTCTTTA CCTTAGATGGAGATATCAAATTGGCGGATTTTGGAGTATCAGCTAAAAACACGAGGACAATTCAAAGAAG AGATTCCTTTATTGGTACACCATATTGGATGGCTCCTGAAGTAGTCATGTGTGAAACATCTAAGGACAGA CCCTATGACTACAAAGCTGATGTTTGGTCCCTGGGTATCACTTTAATAGAAATGGCTGAGATAGAACCAC CTCATCATGAATTAAATCCAATGCGAGTGCTGCTAAAAATAGCAAAATCTGAGCCACCTACATTAGCACA GCCATCCAGATGGTCTTCAAATTTTAAGGACTTTCTAAAGAAATGCTTAGAAAAGAATGTGGATGCCAGG TGGACTACATCTCAGCTGCTGCAGCATCCCTTTGTTACTGTTGATTCCAACAAACCCATCCGAGAATTGA TTGCAGAGGCGAAGGCTGAAGTAACAGAAGAAGTTGAAGATGGCAAAGAGGAAGATGAAGAGGAGGAAAC AGAAAATTCTCTGGAAACAAGAAGACAAAAGAAAACATTGAAGAAAACACGCAAATTTATTGTTGATGGT GTAGAAGTGAGTGTAACAACATCAAAGATAGTTACAGATAGTGATTCCAAAACTGAAGAATTGCGGTTTC TTAGACGTCAGGAACTTCGGGAATTAAGATTTCTTCAGAAAGAAGAGCAAAGAGCCCAACAACAGCTCAA TAGCAAACTACAGCAACAACGAGAACAAATTTTCCGGCGCTTTGAGCAGGAAATGATGAGTAAAAAGCGA CAATATGACCAGGAAATTGAGAATCTAGAAAAACAGCAGAAACAGACTATCGAACGCCTGGAACAAGAGC ACACAAATCGCTTGCGAGATGAAGCCAAACGCATCAAAGGAGAACAAGAGAAAGAGTTGTCCAAATTTCA GAATATGCTGAAGAACCGAAAGAAGGAGGTTATAAATGAAGTGGAGAAAGCACCCAAAGAGCTGAGAAAA GAGCTCATGAAACGCAGGAAAGAGGAGCTTGCACAAAGCCAGCATGCTCAGGAACAAGAGTTTGTTCAGA AACAACAGCAAGAATTAGATGGCTCTCTGAAAAAGATCATCCAGCAGCAGAAGGCAGAGTTAGCTAATAT TGAGAGAGAGTGCCTGAATAACAAGCAACAGCTCATGAGAGCTCGAGAAGCTGCAATTTGGGAGCTCGAA GAACGACACTTACAAGAAAAACACCAGCTGCTCAAACAGCAGCTTAAAGATCAGTATTTCATGCAAAGAC ATCAGCTACTTAAGCGCCACGAGAAGGAAACAGAGCAAATGCAGCGTTACAATCAAAGACTTATTGAGGA ATTGAAAAACAGACAGACTCAAGAAAGAGCAAGACTGCCCAAGATTCAGCGCAGTGAAGCCAAGACTCGA ATGGCCATGTTTAAGAAGAGTTTGAGAATTAACTCAACAGCCACACCAGATCAGGACCGTGATAAAATTA AACAGTTTGCTGCACAAGAAGAAAAGAGGCAGAAAAATGAGAGAATGGCTCAGCATCAGAAACATGAGAA TCAAATGCGAGATCTTCAGTTGCAGTGTGAAGCCAATGTCCGCGAACTGCATCAGCTGCAGAATGAAAAA TGCCACTTGTTGGTTGAGCATGAGACTCAGAAACTGAAGGAGTTAGATGAGGAACATAGCCAAGAATTAA AGGAGTGGAGAGAGAAATTGAGACCTAGGAAAAAGACACTGGAAGAAGAGTTTGCCAGGAAACTACAGGA ACAGGAAGTATTCTTTAAAATGACTGGGGAGTCTGAATGCCTTAACCCATCAACACAGAGCCGGATTTCC AAATTTTATCCTATTCCCAGCTTGCATTCCACCGGATCATAA    Download   Select all
CCDS ID	CCDS7553.1

Protein Information

      

Protein ID	NP_055535.2
Protein Name	STE20-like kinase (yeast)
Molecular Wt. (Da)	142564
Protein Sequence	>9748 MSFFNFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAKV IDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELERPLT ESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQRRDSFIG TPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPTLA QPSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPIRELIAEAKAEVTEEVEDGKE EDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSEKTERSNSEDKLNSKILNEK PTTDEPEKAVEDINEHITDAQLEAMTELHDRTAVIKENEREKRPKLENLPDTEDQETVDINSVS EGKENNIMITLETNIEHNLKSEEEKDQEKQQMFENKLIKSEEIKDTILQTVDLVSQETGEKEAN IQAVDSEVGLTKEDTQEKLGEDDKTQKDVISNTSDVIGTCEAADVAQKVDEDSAEDTQSNDGKE VVEVGQKLINKPMVGPEAGGTKEVPIKEIVEMNEIEEGKNKEQAINSSENIMDINEEPGTTEGE EITESSSTEEMEVRSVVADTDQKALGSEVQDASKVTTQIDKEKKEIPVSIKKEPEVTVVSQPTE PQPVLIPSININSDSGENKEEIGSLSKTETILPPESENPKENDNDSGTGSTADTSSIDLNLSIS SFLSKTKDSGSISLQETRRQKKTLKKTRKFIVDGVEVSVTTSKIVTDSDSKTEELRFLRRQELR ELRFLQKEEQRAQQQLNSKLQQQREQIFRRFEQEMMSKKRQYDQEIENLEKQQKQTIERLEQEH TNRLRDEAKRIKGEQEKELSKFQNMLKNRKKEVINEVEKAPKELRKELMKRRKEELAQSQHAQE QEFVQKQQQELDGSLKKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRAREAAIWELEERHLQEKHQLLK QQLKDQYFMQRHQLLKRHEKETEQMQRYNQRLIEELKNRQTQERARLPKIQRSEAKTRMAMFKK SLRINSTATPDQDRDKIKQFAAQEEKRQKNERMAQHQKHENQMRDLQLQCEANVRELHQLQNEK CHLLVEHETQKLKELDEEHSQELKEWREKLRPRKKTLEEEFARKLQEQEVFFKMTGESECLNPS TQSRISKFYPIPSLHSTGS    Download   Select all
Length	1235
Uniprot ID	P54756
Ensembl Protein ID	ENSP00000273854

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	348;-
S	Phosphorylation	340;-
S	Phosphorylation	354;-
S	Phosphorylation	347;-
S	Phosphorylation	348;-
S	Phosphorylation	344;-
S	Phosphorylation	341;-
S	Phosphorylation	189;-
T	Phosphorylation	193
Y	Phosphorylation	195
T	Phosphorylation	569
S	Phosphorylation	571
S	Phosphorylation	777
S	Phosphorylation	779
S	Phosphorylation	818
S	Phosphorylation	1235
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S	Phosphorylation	772
S	Phosphorylation	565
T	Phosphorylation	327
S	Phosphorylation	543
S	Phosphorylation	546
T	Phosphorylation	523
S	Phosphorylation	330
S	Phosphorylation	759
S	Phosphorylation	717
S	Phosphorylation	623
S	Phosphorylation	645
S	Phosphorylation	1232
S	Phosphorylation	1094
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S	Phosphorylation	816
S	Phosphorylation	370
S	Phosphorylation	655
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T	Phosphorylation	637
S	Phosphorylation	646
S	Phosphorylation	647
T	Phosphorylation	1095
T	Phosphorylation	183
S	Phosphorylation	750
T	Phosphorylation	752
S	Phosphorylation	754
T	Phosphorylation	139
T	Phosphorylation	181
T	Phosphorylation	527
T	Phosphorylation	676
T	Phosphorylation	785
S	Phosphorylation	1229
T	Phosphorylation	1233
S	Phosphorylation	2

Enzyme Information

   

EC	2.7.10.2
Name	non-specific protein-tyrosine kinase ABL ABL1 ABL2 ABLL ACK1 ACK2 AGMX1 ARG ATK ATP:protein-tyrosine O-phosphotransferase (ambiguous) BLK Bmk BMX BRK Bruton's tyrosine kinase Bsk BTK BTKL CAKb Cdgip CHK CSK CTK CYL cytoplasmic protein tyrosine kinase EMT ETK Fadk FAK FAK2 FER Fert1/2 FES FGR focal adhesion kinase FPS FRK FYN HCK HCTK HYL IMD1 ITK IYK JAK1 JAK2 JAK3 Janus kinase 1 Janus kinase 2 Janus kinase 3 JTK1 JTK9 L-JAK LCK LSK LYN MATK Ntk p60c-src protein tyrosine kinase PKB protein-tyrosine kinase (ambiguous) PSCTK PSCTK1 PSCTK2 PSCTK4 PSCTK5 PTK2 PTK2B PTK6 PYK2 RAFTK RAK Rlk Sik SLK SRC SRC2 SRK SRM SRMS STD SYK SYN Tck TEC TNK1 Tsk TXK TYK2 TYK3 YES1 YK2 ZAP70
Class	Transferases; Transferring phosphorus-containing groups; Protein-tyrosine kinases
Sysname	ATP:[protein]-L-tyrosine O-phosphotransferase (non-specific)
Substrate	ATP [CPD:C00002]; [protein]-L-tyrosine
Product	ADP [CPD:C00008]; [protein]-L-tyrosine phosphate
Reaction (IUBMB)

PPi Information

(Click to view network : Source STRING)      View   

                              

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
836	CASP3	2799	NP_004337.2	in vitro;in vivo	10611247
22883	CLSTN1	10837	NP_001009566.1	yeast 2-hybrid	12421765

Pathway Information

      

Pathway Name	Pathway ID
Oocyte meiosis	hsa04114

Structure Information

PDB ID	2J51
Resolution	2.1
Method	X-RAY DIFFRACTION
Chains	A
Molecule	STE20-LIKE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
cd06643	28-309	STKc_SLK
cl21453	28-309	PKc_like superfamily
cd06611	28-306	STKc_SLK_like
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cd06612	30-292	STKc_MST1_2
cd06613	34-292	STKc_MAP4K3_like
cd06608	29-292	STKc_myosinIII_N_like
cd06609	39-308	STKc_MST3_like
cd06614	32-293	STKc_PAK
cd06638	29-292	STKc_myosinIIIA_N
cd06606	34-292	STKc_MAPKKK
cd06639	29-292	STKc_myosinIIIB_N
cd06610	34-291	STKc_OSR1_SPAK
cd06627	39-292	STKc_Cdc7_like
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cd06647	29-292	STKc_PAK_I
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cd06641	29-298	STKc_MST3
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cd13999	40-288	STKc_MAP3K-like
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cd14008	40-292	STKc_LKB1_CaMKK
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cd05123	40-291	STKc_AGC
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cd06657	29-293	STKc_PAK4
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cd06629	38-292	STKc_Bck1_like
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cd05118	35-291	STKc_CMGC
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cl22431	1019-1160	PKK superfamily
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COG5281	872-1206	COG5281
COG1196	753-1122	Smc
COG4942	864-1105	EnvC
COG1196	779-972	Smc
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COG1269	811-1044	NtpI
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TIGR01069	859-991	mutS2
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COG4942	952-1201	EnvC
TIGR00618	819-1049	sbcc
TIGR02168	782-1030	SMC_prok_B
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TIGR00606	826-1197	rad50
TIGR03185	828-1067	DNA_S_dndD
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COG5271	350-574	MDN1
COG5281	997-1207	COG5281

Ontology Information

   

HPRD ID	3502
Molecular Class	Serine/threonine kinase
Molecular Function	Transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity (GO:0004714)
Biological Process	Cell communication (GO:0007154); Signal transduction (GO:0007165)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

                                 

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