CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
TMPO	7112	Thymopoietin	12	TP; LAP2; CMD1T; LEMD4; PRO0868

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20089989	2010	Cell line : - Source : VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : -	Biochemical isolation to nano-LC-MS/MS analysis	Unknown	-	-

Gene Details

Chromosome: 12; NC_000012.11 (98909351..98944157)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	The protein encoded by this gene resides in the nucleus and may play a role in the assembly of the nuclear lamina, and thus help maintain the structural organization of the nuclear envelope. It may function as a receptor for the attachment of lamin filaments to the inner nuclear membrane. Mutations in this gene are associated with dilated cardiomyopathy. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been noted for this gene. [provided by RefSeq, May 2010]
Chromosome	12
Location	12q22
Start	98515573
End	98550379
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815586:98515573-98550379 Homo sapiens chromosome 12, GRCh38.p2 Primary Assembly GTTCTTGGGGCGTGGGCGAAGCAGGCTGCTCGCCTCCTGCCTGTAGTGTGTGGGCTGGGGTTGGTGCGAG CTTCCAGCTTGGCCGCAGTTGGTTCGTAGTTCGGCTCTGGGGTCTTTTGTGTCCGGGTCTGGCTTGGCTT TGTGTCCGCGAGTTTTTGTTCCGCTCCGCAGCGCTCTTCCCGGGCAGGAGCCGTGAGGCTCGGAGGCGGC AGCGCGGTCCCCGGCCAGGAGCAAGCGCGCCGGCGTGAGCGGCGGCGGCAAAGGCTGTGGGGAGGGGGCT TCGCAGATCCCCGAGATGCCGGAGTTCCTGGAAGACCCCTCGGTCCTGACAAAAGACAAGTTGAAGAGTG AGTTGGTCGCCAACAATGTGACGCTGCCGGCCGGGGAGCAGCGCAAAGACGTGTACGTCCAGCTCTACCT GCAGCACCTCACGGCTCGCAACCGGCCGCCGCTCCCCGCCGGCACCAACAGCAAGGGGCCCCCGGACTTC TCCAGTGACGAAGAGCGCGAGCCCACCCCGGTCCTCGGCTCTGGGGCCGCCGCCGCGGGCCGGAGCCGAG CAGCCGTCGGCAGGGTAAGGACGCGGGGCCGGGGCTACAAAGGCGGGCGTTTGGCGGTTGCCGCGCGCGC TCGCCGCCGTTTGCAGCCCCTCCCTCCCGGGCGCCCCCTCGGGCCTCCCAGGTGCGGGGCTGTCCCTGCG CCCCCTCGCGTCGCCCCTTCCCCGCGGGGCTGCAGGCGCCGGAGCGGAGAGGCCAGAAGTTGGGGCCGCG GGGTTCGCGTTCTTTGACGTGTGGGTCTGGGAGGTGTGGAGTTGCGTTGGCGGCGGTTGTTTTGCACGCA 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Length	4186

CDS Information

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CDS Sequence	>lcl\|NM_001032283.2_cds_NP_001027454.1_1 [gene=TMPO] [protein=thymopoietin isoform beta] [protein_id=NP_001027454.1] [location=296..1660] ATGCCGGAGTTCCTGGAAGACCCCTCGGTCCTGACAAAAGACAAGTTGAAGAGTGAGTTGGTCGCCAACA ATGTGACGCTGCCGGCCGGGGAGCAGCGCAAAGACGTGTACGTCCAGCTCTACCTGCAGCACCTCACGGC TCGCAACCGGCCGCCGCTCCCCGCCGGCACCAACAGCAAGGGGCCCCCGGACTTCTCCAGTGACGAAGAG CGCGAGCCCACCCCGGTCCTCGGCTCTGGGGCCGCCGCCGCGGGCCGGAGCCGAGCAGCCGTCGGCAGGA AAGCCACAAAAAAAACTGATAAACCCAGACAAGAAGATAAAGATGATCTAGATGTAACAGAGCTCACTAA TGAAGATCTTTTGGATCAGCTTGTGAAATACGGAGTGAATCCTGGTCCTATTGTGGGAACAACCAGGAAG CTATATGAGAAAAAGCTTTTGAAACTGAGGGAACAAGGAACAGAATCAAGATCTTCTACTCCTCTGCCAA CAATTTCTTCTTCAGCAGAAAATACAAGGCAGAATGGAAGTAATGATTCTGACAGATACAGTGACAATGA AGAAGACTCTAAAATAGAGCTCAAGCTTGAGAAGAGAGAACCACTAAAGGGCAGAGCAAAGACTCCAGTA ACACTCAAGCAAAGAAGAGTTGAGCACAATCAGAGCTATTCTCAAGCTGGAATAACTGAGACTGAATGGA CAAGTGGATCTTCAAAAGGCGGACCTCTGCAGGCATTAACTAGGGAATCTACAAGAGGGTCAAGAAGAAC TCCAAGGAAAAGGGTGGAAACTTCAGAACATTTTCGTATAGATGGTCCAGTAATTTCAGAGAGTACTCCC ATAGCTGAAACTATAATGGCTTCAAGCAACGAATCCTTAGTTGTCAATAGGGTGACTGGAAATTTCAAGC ATGCATCTCCTATTCTGCCAATCACTGAATTCTCAGACATACCCAGAAGAGCACCAAAGAAACCATTGAC AAGAGCTGAAGTGGGAGAAAAAACAGAGGAAAGAAGAGTAGAAAGGGATATTCTTAAGGAAATGTTCCCC TATGAAGCATCTACACCAACAGGAATTAGTGCTAGTTGCCGCAGACCAATCAAAGGGGCTGCAGGCCGGC CATTAGAACTCAGTGATTTCAGGATGGAGGAGTCTTTTTCATCTAAATATGTTCCTAAGTATGTTCCCTT GGCAGATGTCAAGTCAGAAAAGACAAAAAAGGGACGCTCCATTCCCGTATGGATAAAAATTTTGCTGTTT GTTGTTGTGGCAGTTTTTTTGTTTTTGGTCTATCAAGCTATGGAAACCAACCAAGTAAATCCCTTCTCTA ATTTTCTTCATGTTGACCCTAGAAAATCCAACTGA Download Select all
CCDS ID	CCDS31879.1

Protein Information

Protein ID	NP_003267.1
Protein Name	Thymopoietin
Molecular Wt. (Da)	75361
Protein Sequence	>7112 MPEFLEDPSVLTKDKLKSELVANNVTLPAGEQRKDVYVQLYLQHLTARNRPPLPAGTNSKGPPD FSSDEEREPTPVLGSGAAAAGRSRAAVGRKATKKTDKPRQEDKDDLDVTELTNEDLLDQLVKYG VNPGPIVGTTRKLYEKKLLKLREQGTESRSSTPLPTISSSAENTRQNGSNDSDRYSDNEEGKKK EHKKVKSTRDIVPFSELGTTPSGGGFFQGISFPEISTRPPLGSTELQAAKKVHTSKGDLPREPL VATNLPGRGQLQKLASERNLFISCKSSHDRCLEKSSSSSSQPEHSAMLVSTAASPSLIKETTTG YYKDIVENICGREKSGIQPLCPERSHISDQSPLSSKRKALEESESSQLISPPLAQAIRDYVNSL LVQGGVGSLPGTSNSMPPLDVENIQKRIDQSKFQETEFLSPPRKVPRLSEKSVEERDSGSFVAF QNIPGSELMSSFAKTVVSHSLTTLGLEVAKQSQHDKIDASELSFPFHESILKVIEEEWQQVDRQ LPSLACKYPVSSREATQILSVPKVDDEILGFISEATPLGGIQAASTESCNQQLDLALCRAYEAA ASALQIATHTAFVAKAMQADISQAAQILSSDPSRTHQALGILSKTYDAASYICEAAFDEVKMAA HTMGNATVGRRYLWLKDCKINLASKNKLASTPFKGGTLFGGEVCKVIKKRGNKH Download Select all
Length	694
Uniprot ID	Q9UBC3
Ensembl Protein ID	ENSP00000201963

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

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S	Phosphorylation	66
S	Phosphorylation	66
S	Phosphorylation	66;-
S	Phosphorylation	66;-
S	Phosphorylation	66;-
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T	Phosphorylation	74;-
T	Phosphorylation	74;-
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S	Phosphorylation	158;-
S	Phosphorylation	158;-
T	Phosphorylation	160;-
T	Phosphorylation	160;-
T	Phosphorylation	160;-
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S	Phosphorylation	180;-
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Y	Phosphorylation	183;-
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Y	Phosphorylation	183;-
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T	Phosphorylation	154;-
S	Phosphorylation	156;-
T	Phosphorylation	154;-
S	Phosphorylation	156;-
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S	Phosphorylation	159;-
S	Phosphorylation	159;-
S	Phosphorylation	67;-
S	Phosphorylation	67;-
S	Phosphorylation	79;-
S	Phosphorylation	79;-
S	Phosphorylation	79;-
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T	Phosphorylation	164;-
T	Phosphorylation	164;-
S	Phosphorylation	184;-
T	Phosphorylation	57
T	Phosphorylation	57
T	Phosphorylation	57
S	Phosphorylation	166
S	Phosphorylation	166
S	Phosphorylation	166
S	Phosphorylation	167
S	Phosphorylation	167
S	Phosphorylation	167
S	Phosphorylation	168
S	Phosphorylation	168
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T	Phosphorylation	172
T	Phosphorylation	172
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S	Phosphorylation	177
T	Phosphorylation	208
T	Phosphorylation	211
T	Phosphorylation	208
T	Phosphorylation	211
Y	Phosphorylation	223
T	Phosphorylation	279
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S	Phosphorylation	354
S	Phosphorylation	354
S	Phosphorylation	362
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T	Phosphorylation	248
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S	Phosphorylation	442
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S	Phosphorylation	87
S	Phosphorylation	87
S	Phosphorylation	272
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T	Phosphorylation	137
T	Phosphorylation	137
T	Phosphorylation	96
T	Phosphorylation	99
T	Phosphorylation	96
T	Phosphorylation	99
T	Phosphorylation	96
T	Phosphorylation	99
K	Acetylation	207
K	Acetylation	207
K	Acetylation	656
S	Phosphorylation	59
S	Phosphorylation	59
S	Phosphorylation	59
S	Phosphorylation	177
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T	Phosphorylation	12
S	Phosphorylation	9
T	Phosphorylation	12
S	Phosphorylation	9
T	Phosphorylation	12
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S	Phosphorylation	458
S	Phosphorylation	294
S	Phosphorylation	295

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
4000	LMNA	1035	CAA27173.1	in vivo	1 098 443 812 475 960
4001	LMNB1	1036	NP_005564.1	in vitro;yeast 2-hybrid	9490046
5925	RB1	1574	NP_000312.2	in vivo	12475961
7874	USP7	3950	NP_003461.2	yeast 2-hybrid	16713569

Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

PDB ID	1GJJ
Resolution	-
Method	SOLUTION NMR
Chains	A
Molecule	LAP2
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
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cd12939	114-139	LEM_emerin

Ontology Information

HPRD ID	2036
Molecular Class	Peptide hormone
Molecular Function	Catalytic activity (GO:0003824)
Biological Process	Metabolism (GO:0008152); Energy pathways (GO:0006091)

SNP Information

View SNP Geneview Report

Drug Information

No matching records could be found.

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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