CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
FUBP1	8880	Far upstream element (FUSE) binding protein 1	1	This gene encodes a ssDNA binding protein that activates the far upstream element (FUSE) of c-myc and stimulates expression of c-myc in undifferentiated cells. Regulation of FUSE by FUBP occurs throug

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20089989	2010	Cell line : - Source : VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : -	Biochemical isolation to nano-LC-MS/MS analysis	Up-regulation	-	-
20641205	2009	Cell line : - Source : - Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	-	Up-regulation	-	-

Gene Details

Chromosome: 1; NC_000001.10 (78413591..78444777, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	-
Chromosome	1
Location	1p31.1
Start	77944055
End	77979205
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815597:c77979205-77944055 Homo sapiens chromosome 1, GRCh38.p2 Primary Assembly GTTCTTTCTCAGCCCTAACCCACACCAGCGCGTTGCCTCGGAAACATCGCGAGATTTTGTTCCTTCAGTC TCCGCCCCTTTACGGCACGATGGTCGCGCAAGAATGTAATAGAGCTTCGACGGCCGCCATTTTCTTTCTT TCTTAGCTGTTAGCTGAGAGGAAGTCTCTGAACAGGCGGCAGCGGCTCTTATAGTGCAACCATGGCAGAC TATTCAACAGTGCCTCCCCCCTCTTCTGGCTCAGCTGGTGGCGGTGGTGGCGGCGGTGGTGGTGGAGGAG TTAACGACGCTTTCAAAGATGCACTGCAGAGAGCCCGGCAGGTAAGTGTGGACCGCGCGGCGGAATCCCG AAAGCTCACGGTAATTGGCCGCTGACTGAGTAGGCCGCTACCCTTAAGCGCATGAGGAAGAGGAAAGAGG TGTTCTTCCGGGCTGAAATGTGAAGAGACACGTTTCCCCATGTTGGTAATAACGATTAGAGACCAGAACC CAGTTTTGTGTTCTTGGTGCCTAATCCACTTAGAACCCCGACGCGTGCTACGCAAAGAAGGCCTGAAGTC TTTCTCCCGCTTCTGCGGCACTCGCGTGTCTCCAGTGAGCTAGTTTAGATAAAGATCCTCTTCCAGGGGA TAAAGCGCAGTTAGTTTCACACAATTTAATGGAAGGTTCTGGTAATGAGTTTGGGAAAGAACTAGGGTCT GTCCTGGAGCCATAGCAAGGGAAGGGATTTATCATTAAAGTAGCCTTTACAGCTCATTTCCGTTCTCTCT CGCAATTAAAACCGCTTTCAGTACCATTCACCGTCACACCTCTACAAGGAAGGGACTTGAAAGCAGCCTT 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Length	35151
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Unigene ID	Hs.567380
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mRNA Information

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Length	3709

CDS Information

Location	join(202..321,9191..9281,11003..11041,11540..11579, 12108..12157,12251..12322,12455..12512,13975..14137, 14238..14336,14459..14560,14850..14952,15044..15144, 15491..15632,16276..16436,18711..18862,18943..19022, 22506..22634,23877..23951,29906..30051,32630..32676, 33564..33594)
CDS Sequence	>lcl\|XM_011542394.1_cds_XP_011540696.1_1 [gene=FUBP1] [protein=far upstream element-binding protein 1 isoform X4] [protein_id=XP_011540696.1] [location=152..2152] ATGGCAGACTATTCAACAGTGCCTCCCCCCTCTTCTGGCTCAGCTGGTGGCGGTGGTGGCGGCGGTGGTG GTGGAGGAGTTAACGACGCTTTCAAAGATGCACTGCAGAGAGCCCGGCAGATTGCAGCAAAAATTGGAGG TGATGCAGGGACATCACTGAATTCAAATGACTATGGTTATGGGGGACAAAAAAGACCTTTAGAAGATGGA GATCAACCAGATGCTAAGAAAGTTGCTCCTCAAAATGACTCTTTTGGAACACAGTTACCACCGATGCATC AGCAGCAAAGATCTGTAATGACAGAAGAATACAAAGTTCCAGATGGAATGGTTGGATTCATAATTGGCAG AGGAGGTGAACAGATCTCACGCATACAACAGGAATCTGGATGCAAAATACAGATAGCTCCTGACAGTGGT GGCCTTCCAGAAAGGTCCTGTATGTTAACTGGAACACCTGAATCTGTCCAGTCAGCAAAACGGTTACTGG ACCAGATTGTTGAAAAAGGAAGACCAGCTCCTGGCTTCCATCATGGCGATGGACCGGGAAATGCAGTTCA AGAAATCATGATTCCAGCTAGCAAGGCAGGATTAGTCATTGGAAAAGGGGGAGAAACTATTAAACAGCTT CAGGAACGGGCTGGAGTTAAAATGGTTATGATTCAAGACGGGCCGCAGAACACTGGTGCTGACAAACCTC TTAGGATTACAGGAGACCCATATAAAGTTCAACAAGCCAAGGAAATGGTGTTAGAGTTAATTCGTGATCA AGGCGGTTTCAGAGAAGTTCGGAATGAGTATGGGTCAAGAATAGGAGGAAATGAAGGGATAGATGTCCCC ATTCCAAGATTTGCTGTTGGCATTGTAATAGGAAGAAATGGAGAGATGATCAAAAAAATACAAAATGATG CTGGTGTTCGCATTCAGTTTAAGCCAGATGATGGGACAACACCCGAAAGGATAGCACAAATAACAGGACC TCCAGACCGATGTCAACATGCTGCAGAAATTATTACAGACCTTCTTCGAAGTGTTCAGGCTGGTAATCCT GGTGGACCTGGACCTGGTGGTCGAGGAAGAGGTAGAGGTCAAGGCAACTGGAACATGGGACCACCTGGTG GACTACAGGAATTTAATTTTATTGTGCCAACTGGGAAAACTGGATTAATAATAGGAAAAGGAGGTGAAAC CATAAAAAGCATAAGCCAGCAGTCTGGTGCAAGAATAGAACTTCAGAGAAATCCTCCACCAAATGCAGAT CCTAATATGAAGTTATTTACAATTCGTGGCACTCCACAACAGATAGACTATGCTCGGCAACTCATAGAAG AAAAGATTGGTGGCCCAGTAAATCCTTTAGGGCCACCTGTACCCCATGGGCCCCATGGTGTCCCAGGCCC CCATGGACCTCCTGGGCCTCCAGGGCCTGGAACTCCAATGGGACCATACAACCCTGCACCTTATAATCCT GGACCACCAGGCCCGGCTCCTCATGGTCCTCCAGCCCCATATGCTCCCCAGGGATGGGGAAATGCATATC CACACTGGCAGCAGCAGGCTCCTCCTGATCCAGCTAAGGCAGGAACGGATCCAAATTCAGCAGCTTGGGC TGCTTATTACGCTCACTATTATCAACAGCAAGCACAGCCACCACCAGCAGCCCCTGCAGGTGCACCAACT ACAACTCAAACTAATGGACAAGGAGATCAGCAGAATCCAGCCCCAGCTGGACAGGTTGATTATACCAAGG CTTGGGAAGAGTACTACAAGAAAATGGGTCAGGCAGTTCCTGCTCCGACTGGGGCTCCTCCAGGTGGTCA GCCAGATTATAGTGCAGCCTGGGCTGAGTATTATAGACAACAAGCAGCCTATTATGCCCAGACAAGTCCC CAGGGAATGCCACAGCATCCTCCAGCACCTCAGTGCCTTCCCAGACCTTCCACCTTAGGTTCTGCTGCAA AAAGCACCAGTGCTGAAGATGCTGCAAGCACCAAATCATAG Download Select all
CCDS ID	-

Protein Information

Protein ID	NP_001290362.1
Protein Name	Far upstream element (FUSE) binding protein 1
Molecular Wt. (Da)	69734
Protein Sequence	>8880 MADYSTVPPPSSGSAGGGGGGGGGGGVNDAFKDALQRARQIAAKIGGDAGTSLNSNDYGYGGQK RPLEDGDGSWTSPSSTTHWEGMPSPFKDQPDAKKVAPQNDSFGTQLPPMHQQQSRSVMTEEYKV PDGMVGFIIGRGGEQISRIQQESGCKIQIAPDSGGLPERSCMLTGTPESVQSAKRLLDQIVEKG RPAPGFHHGDGPGNAVQEIMIPASKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMVMIQDGPQNTGADKPL RITGDPYKVQQAKEMVLELIRDQGGFREVRNEYGSRIGGNEGIDVPIPRFAVGIVIGRNGEMIK KIQNDAGVRIQFKPDDGTTPERIAQITGPPDRCQHAAEIITDLLRSVQAGNPGGPGPGGRGRGR GQGNWNMGPPGGLQEFNFIVPTGKTGLIIGKGGETIKSISQQSGARIELQRNPPPNADPNMKLF TIRGTPQQIDYARQLIEEKIGGPVNPLGPPVPHGPHGVPGPHGPPGPPGPGTPMGPYNPAPYNP GPPGPAPHGPPAPYAPQGWGNAYPHWQQQAPPDPAKAGTDPNSAAWAAYYAHYYQQQAQPPPAA PAGAPTTTQTNGQGDQQNPAPAGQVDYTKAWEEYYKKMGQAVPAPTGAPPGGQPDYSAAWAEYY RQQAAYYAQTSPQGMPQHPPAPQGQ Download Select all
Length	665
Uniprot ID	P13639
Ensembl Protein ID	ENSP00000307940

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
Y	Phosphorylation	58;-
Y	Phosphorylation	58;-
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S	Phosphorylation	630;-
S	Phosphorylation	139
S	Phosphorylation	140
T	Phosphorylation	152
T	Phosphorylation	153
S	Phosphorylation	52
S	Phosphorylation	52
S	Phosphorylation	55
S	Phosphorylation	55
K	Acetylation	590
K	Acetylation	591
Y	Phosphorylation	626
S	Phosphorylation	98
S	Phosphorylation	99
Y	Phosphorylation	4
Y	Phosphorylation	4
T	Phosphorylation	206
T	Phosphorylation	207
S	Phosphorylation	84
T	Phosphorylation	87
S	Phosphorylation	84
T	Phosphorylation	228
T	Phosphorylation	229
Y	Phosphorylation	625

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
902	CCNH	9059	NP_001230.1	in vitro	11239393
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10989	IMMT	2658	NP_006830.2	in vitro	11239393

Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
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cl00098	102-164	KH-I superfamily
cd00105	278-339	KH-I
cl00098	278-339	KH-I superfamily
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cl00098	187-252	KH-I superfamily
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cl00098	381-444	KH-I superfamily
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pfam07650	261-311	KH_2
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cd02409	378-414	KH-II
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Ontology Information

HPRD ID	579
Molecular Class	Transcription regulatory protein
Molecular Function	Transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity (GO:0004714)
Biological Process	Cell communication (GO:0007154); Signal transduction (GO:0007165)

SNP Information

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Drug Information

No matching records could be found.

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

ArrayExpress	GO
ICGC	GO
Cancer3D	GO
COSMIC	GO
NCG	GO
TSGene	GO
Tumor Gene Family of Databases	GO
CCDB	GO
G2SBC	GO
Osteosarcoma Database	GO
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Mechanism	Up-regulation
Biomarker	-
Drug Target	-
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism

CoReCG

Search results:

General Information

Evidence Information

Gene Details

mRNA Information

CDS Information

Protein Information

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Enzyme Information

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