CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
AMFR	267	autocrine motility factor receptor, E3 ubiquitin protein ligase	16	RNF45, gp78

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
25852009	2015	Cell line : - Source : Sample Type : CRC tumor No. of Sample : 118 Stage : -	real time RT-PCR,Univariate and multivariate analysis, Spearman's correlation	Up-regulation	-	AMFR may serve as a molecular prognosticator for colon cancer and rectal cancer.
8082090	1994	Cell line : - Source : - Sample Type : CRC tumor No. of Sample : 127 colon cancer, 131 rectal cancer, 47 colonic and 25 rectal corresponding lymph node metastases Stage : -	Immunohistochemistry, Multivariate analysis	Unknown	-	-

Gene Details

NC_000016.9 (56395364..56459450, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	RING-type (C3HC4) zinc fingers
Description	This locus encodes a glycosylated transmembrane receptor. Its ligand, autocrine motility factor, is a tumor motility-stimulating protein secreted by tumor cells. The encoded receptor is also a member of the E3 ubiquitin ligase family of proteins. It catalyzes ubiquitination and endoplasmic reticulum-associated degradation of specific proteins. [provided by RefSeq, Feb 2012]
Chromosome	16
Location	16q21
Start	56395364
End	56459450
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815582:c56425538-56361452 Homo sapiens chromosome 16, GRCh38.p2 Primary Assembly CTCTTCCGCGCCGGCAGGGGCAGCAGCGGGAGCAGCGCGGGGCGGAGCGGCGCCAGCAGCCAGGAGCGGC CCGGCCCGGCCCGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGACGCCAGAGCCCGTGGGCGCCG TTCGCGAGGCCGCCGCAGAGGCCCGGCCGCAGCGCAGGGAAGCCTGGGGGCCAGAGGTCGCCGCTGCCGC CATGCCGCTGCTCTTCCTCGAGCGCTTCCCCTGGCCCAGCCTCCGCACCTACACGGGCCTCAGCGGCCTG GCCCTGCTGGGCACCATCATCAGCGCCTACCGCGCGCTCAGCCAGCCCGAGGCCGGCCCCGGCGAGCCGG ACCAGCTAACGGCCTCGCTGCAGCCTGAGCCGCCGGCGCCCGCCCGGCCGAGCGCCGGGGGACCCCGGGC CCGCGATGTGGCCCAGTACCTGCTCTCAGACAGCCTCTTCGTGTGGGTGAGCGAGGCGGCCGGGCCCGCG GGGCAGGGGCGGGGTCCGCTGCGTCACCCTTTATCCGCGGGGGCGTGGTGGGCCTAGGGGCCCCTCCGCC AGGGACCCCCGAGGGCGAGCGCCTGGGGGGCGCGGCCTTGCTCGCGGGAGCGCTGCTGAGGGAGAGTGGT GAGGCGCGGGGAGGGGGAGGGGGCCGCGGGCGGGAGGAACATCGCGTGGGGTTGCGAGGAGGAGGCCCCG AGGGGCAGGCCAGCGTTGAGGGCTCCGGGAAGGGGGTCGGGGAGGCGGCGGGTGATGGTCTGCGCTGGGG CGCGGACGGGGCCTGGGGCAGGGGAAGGGGTTAAGGGGCAGTGGGGAGGAACGGGCTGGGTTTTCTGAGG 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mRNA Sequence	>gi\|378744169\|ref\|NM_001144.5\| Homo sapiens autocrine motility factor receptor, E3 ubiquitin protein ligase (AMFR), mRNA CTCTTCCGCGCCGGCAGGGGCAGCAGCGGGAGCAGCGCGGGGCGGAGCGGCGCCAGCAGCCAGGAGCGGC CCGGCCCGGCCCGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGACGCCAGAGCCCGTGGGCGCCG TTCGCGAGGCCGCCGCAGAGGCCCGGCCGCAGCGCAGGGAAGCCTGGGGGCCAGAGGTCGCCGCTGCCGC CATGCCGCTGCTCTTCCTCGAGCGCTTCCCCTGGCCCAGCCTCCGCACCTACACGGGCCTCAGCGGCCTG GCCCTGCTGGGCACCATCATCAGCGCCTACCGCGCGCTCAGCCAGCCCGAGGCCGGCCCCGGCGAGCCGG ACCAGCTAACGGCCTCGCTGCAGCCTGAGCCGCCGGCGCCCGCCCGGCCGAGCGCCGGGGGACCCCGGGC CCGCGATGTGGCCCAGTACCTGCTCTCAGACAGCCTCTTCGTGTGGGTTCTAGTAAATACCGCTTGCTGT GTTTTGATGTTGGTGGCTAAGCTCATCCAGTGTATTGTGTTTGGCCCTCTTCGAGTGAGTGAGAGACAGC ATCTCAAAGACAAATTTTGGAATTTTATTTTCTACAAGTTCATTTTCATCTTTGGTGTGCTGAATGTCCA GACAGTGGAAGAGGTGGTCATGTGGTGCCTCTGGTTTGCCGGACTTGTCTTTCTGCACCTGATGGTTCAG CTCTGCAAGGATCGATTTGAATATCTTTCCTTCTCGCCCACCACGCCGATGAGCAGCCACGGTCGAGTCC TGTCCCTGTTGGTTGCCATGCTGCTTTCCTGCTGTGGACTGGCGGCCGTCTGCTCCATCACCGGCTACAC CCACGGAATGCACACCTTGGCTTTCATGGCTGCAGAGTCTCTTCTTGTGACAGTGAGGACTGCTCATGTG ATTTTACGATACGTAATTCACCTCTGGGACCTCAACCACGAAGGGACGTGGGAAGGAAAGGGGACGTATG TCTATTACACAGACTTTGTCATGGAGCTCACTCTCCTGTCCCTGGACCTCATGCACCATATTCACATGTT GTTATTTGGCAACATCTGGTTATCCATGGCCAGCCTGGTCATCTTTATGCAGCTGCGTTACCTGTTTCAT GAGGTGCAACGTCGAATTCGTCGGCACAAGAACTATCTACGTGTGGTTGGAAACATGGAGGCCAGGTTTG CAGTTGCAACTCCAGAGGAGCTGGCTGTCAACAATGACGACTGTGCCATCTGTTGGGACTCCATGCAGGC TGCGCGGAAACTGCCCTGTGGACATCTTTTCCACAACTCCTGTCTTCGTTCCTGGCTAGAACAAGACACC TCCTGTCCAACATGCAGAATGTCTCTTAATATTGCCGACAATAATCGTGTCAGGGAAGAACATCAAGGAG AGAACTTGGATGAGAATTTGGTTCCTGTAGCAGCAGCCGAAGGGAGACCTCGCTTAAACCAACACAATCA CTTCTTCCATTTCGATGGGTCTCGGATTGCGAGCTGGCTGCCGAGTTTTTCGGTTGAAGTGATGCACACC ACCAACATTCTTGGCATTACGCAGGCCAGCAACTCCCAGCTCAATGCAATGGCTCATCAGATTCAAGAGA TGTTTCCCCAGGTTCCATACCATCTGGTACTGCAGGACCTCCAGCTGACACGCTCAGTTGAAATAACAAC AGACAATATTTTAGAAGGACGGATTCAAGTACCTTTTCCTACACAGCGGTCAGATAGCATCAGACCTGCA TTGAACAGTCCTGTGGAAAGGCCAAGCAGTGACCAGGAAGAGGGAGAAACTTCTGCTCAGACCGAGCGTG TGCCACTGGACCTCAGTCCTCGCCTGGAGGAGACGCTGGACTTCGGCGAGGTGGAAGTGGAGCCCAGTGA GGTGGAAGACTTCGAGGCTCGTGGGAGCCGCTTCTCCAAGTCTGCTGATGAGAGACAGCGCATGCTGGTG CAGCGTAAGGACGAACTCCTCCAGCAAGCTCGCAAACGTTTCTTGAACAAAAGTTCTGAAGATGATGCGG CCTCAGAGAGCTTCCTCCCCTCGGAAGGTGCGTCCTCTGACCCCGTGACCCTGCGTCGAAGGATGCTGGC TGCCGCCGCGGAACGGAGGCTTCAGAAGCAGCAGACCTCCTAGCGCTCCCTTGCCTTCCTCAGCTGCCTC CTGCGCCCTGTGCCCGACTGACTGGAGGAGGCCTGTCCCAATTCTGCCCGCTCCATGGAAAAGCGGGCTT GACTGCATTGCCGCTGTATAAAGCATGTGGTCTTATAGTGTTTGGACAGCTGATAAATTTAATCCTTCTT TGTAATACTTTCTATGTGACATTTCTCTTCCCCTTAGAAACACTGCAAATTTTAACTGTAGGTATGATCT CTTCTGGTGTTGACTGGACTGCTTGGGGTGGGGGACGATCAGGAGGAAGTGAGCAGTCGCCTGCCTGCAG CAGGCAGCTTCTACTCCTGCCTCATGCGTACGTCCCACAAATGCAGGTGTCCTGAGCACCACACCCAGTG GGAAGAGTGTGGGGGAGGCGCACAGTGTGAGCCCGCCCCCACGTCGTGGGGTAACATCTGTTATCAAACT GCTGTCGTTGTTGTGGAAGCATGTAGACTGTGCCAGAGGCCAGACCCACGGGCTCATGCACCCCTGAGCC AGCAGGGCATCTTGGAAAAGGAACTCTTGGTTCGATACCTGGAGCAGAGGAGGGGAAAGTCCAGGGCTAT AGGGTGTGATGAAGTCACCCCTTTCTGTCCCACTACATCTGGGACTGACTTTCCGAGCCTCCAGTCCAAA GCCGGCTTGATTTCCGTGAACTCTGGTGCTCCTGCATCTCATGAGTGTGCCCCATGGGTCCCCTCCCCTC TCAGCATTTCCTTGTCCCGTCTGGACCTGGGGAGTGGTTAGGCAGCAAGCTTTGGTTTATGGTTTTCATT CATTGGTGAAGTAAATTAGGCAGTGCTAAAGCCTGTGGGTTTGGTCCTTGAACAAGATGTGGGCCTTGCA AGATGGGAGAGTAAACCTTGAAGGGCTTTATTAAAGAAATAAAAAAGAACTTTTGTATCTTTTATCCTGG GAGCACTGCGTTTTCCTAGCTGTGTTATTCCTGGTTTAATTCAGCAGAGAAGGTAAGGTGTGAACCTACC TGCCTTGGAGAGGGCCCAGGTCCCAAATCTCTTCAAATTCTTCACATGTTTAACTTTAAGGATTTGAACC ATGAAGTCATAGGTTACAGACCTCAGTTTTATGCCCCATTGGATTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTTTACTCTTTGAAAGCTTTGTTTTGTGGTAGTCCTTTTGGGAAGAATCCAGTATTATCCACAATT ATTGGCAAAGTTTAAATGTATTTTACATAACGGAAAGTTTTTAGAATGTTGAAAAGTAATTGAAAAAGGT GATAGGTAAATTTTTAGGCAAAGATAATTTATTTCAATAAATCTTTCAAAAGCCTTACCTTGAAATGCTG TTAGTAAATTTCTGTGATTTTTTTTTTTAATTTGTTTTGCTGAGAGCATAGCTATTTGTTTTTATTGTAA AACAATAATAATAATAAAAAGCAAACTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length	3631

CDS Information

Location	212..2143
CDS Sequence	>lcl\|NM_001144.5_cds_NP_001135.3_1 [gene=AMFR] [protein=E3 ubiquitin-protein ligase AMFR] [protein_id=NP_001135.3] [location=212..2143] ATGCCGCTGCTCTTCCTCGAGCGCTTCCCCTGGCCCAGCCTCCGCACCTACACGGGCCTCAGCGGCCTGG CCCTGCTGGGCACCATCATCAGCGCCTACCGCGCGCTCAGCCAGCCCGAGGCCGGCCCCGGCGAGCCGGA CCAGCTAACGGCCTCGCTGCAGCCTGAGCCGCCGGCGCCCGCCCGGCCGAGCGCCGGGGGACCCCGGGCC CGCGATGTGGCCCAGTACCTGCTCTCAGACAGCCTCTTCGTGTGGGTTCTAGTAAATACCGCTTGCTGTG TTTTGATGTTGGTGGCTAAGCTCATCCAGTGTATTGTGTTTGGCCCTCTTCGAGTGAGTGAGAGACAGCA TCTCAAAGACAAATTTTGGAATTTTATTTTCTACAAGTTCATTTTCATCTTTGGTGTGCTGAATGTCCAG ACAGTGGAAGAGGTGGTCATGTGGTGCCTCTGGTTTGCCGGACTTGTCTTTCTGCACCTGATGGTTCAGC TCTGCAAGGATCGATTTGAATATCTTTCCTTCTCGCCCACCACGCCGATGAGCAGCCACGGTCGAGTCCT GTCCCTGTTGGTTGCCATGCTGCTTTCCTGCTGTGGACTGGCGGCCGTCTGCTCCATCACCGGCTACACC CACGGAATGCACACCTTGGCTTTCATGGCTGCAGAGTCTCTTCTTGTGACAGTGAGGACTGCTCATGTGA TTTTACGATACGTAATTCACCTCTGGGACCTCAACCACGAAGGGACGTGGGAAGGAAAGGGGACGTATGT CTATTACACAGACTTTGTCATGGAGCTCACTCTCCTGTCCCTGGACCTCATGCACCATATTCACATGTTG TTATTTGGCAACATCTGGTTATCCATGGCCAGCCTGGTCATCTTTATGCAGCTGCGTTACCTGTTTCATG AGGTGCAACGTCGAATTCGTCGGCACAAGAACTATCTACGTGTGGTTGGAAACATGGAGGCCAGGTTTGC AGTTGCAACTCCAGAGGAGCTGGCTGTCAACAATGACGACTGTGCCATCTGTTGGGACTCCATGCAGGCT GCGCGGAAACTGCCCTGTGGACATCTTTTCCACAACTCCTGTCTTCGTTCCTGGCTAGAACAAGACACCT CCTGTCCAACATGCAGAATGTCTCTTAATATTGCCGACAATAATCGTGTCAGGGAAGAACATCAAGGAGA GAACTTGGATGAGAATTTGGTTCCTGTAGCAGCAGCCGAAGGGAGACCTCGCTTAAACCAACACAATCAC TTCTTCCATTTCGATGGGTCTCGGATTGCGAGCTGGCTGCCGAGTTTTTCGGTTGAAGTGATGCACACCA CCAACATTCTTGGCATTACGCAGGCCAGCAACTCCCAGCTCAATGCAATGGCTCATCAGATTCAAGAGAT GTTTCCCCAGGTTCCATACCATCTGGTACTGCAGGACCTCCAGCTGACACGCTCAGTTGAAATAACAACA GACAATATTTTAGAAGGACGGATTCAAGTACCTTTTCCTACACAGCGGTCAGATAGCATCAGACCTGCAT TGAACAGTCCTGTGGAAAGGCCAAGCAGTGACCAGGAAGAGGGAGAAACTTCTGCTCAGACCGAGCGTGT GCCACTGGACCTCAGTCCTCGCCTGGAGGAGACGCTGGACTTCGGCGAGGTGGAAGTGGAGCCCAGTGAG GTGGAAGACTTCGAGGCTCGTGGGAGCCGCTTCTCCAAGTCTGCTGATGAGAGACAGCGCATGCTGGTGC AGCGTAAGGACGAACTCCTCCAGCAAGCTCGCAAACGTTTCTTGAACAAAAGTTCTGAAGATGATGCGGC CTCAGAGAGCTTCCTCCCCTCGGAAGGTGCGTCCTCTGACCCCGTGACCCTGCGTCGAAGGATGCTGGCT GCCGCCGCGGAACGGAGGCTTCAGAAGCAGCAGACCTCCTAG Download Select all
CCDS ID	CCDS10758.1

Protein Information

Protein ID	NP_001135.3
Protein Name	autocrine motility factor receptor, E3 ubiquitin protein ligase
Molecular Wt. (Da)	72865
Protein Sequence	>lcl\|NM_001144.5_prot_NP_001135.3_1 [gene=AMFR] [protein=E3 ubiquitin-protein ligase AMFR] [protein_id=NP_001135.3] [location=212..2143] MPLLFLERFPWPSLRTYTGLSGLALLGTIISAYRALSQPEAGPGEPDQLTASLQPEPPAPARPSAGGPRA RDVAQYLLSDSLFVWVLVNTACCVLMLVAKLIQCIVFGPLRVSERQHLKDKFWNFIFYKFIFIFGVLNVQ TVEEVVMWCLWFAGLVFLHLMVQLCKDRFEYLSFSPTTPMSSHGRVLSLLVAMLLSCCGLAAVCSITGYT HGMHTLAFMAAESLLVTVRTAHVILRYVIHLWDLNHEGTWEGKGTYVYYTDFVMELTLLSLDLMHHIHML LFGNIWLSMASLVIFMQLRYLFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEARFAVATPEELAVNNDDCAICWDSMQA ARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADNNRVREEHQGENLDENLVPVAAAEGRPRLNQHNH FFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGITQASNSQLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQLTRSVEITT DNILEGRIQVPFPTQRSDSIRPALNSPVERPSSDQEEGETSAQTERVPLDLSPRLEETLDFGEVEVEPSE VEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQRKDELLQQARKRFLNKSSEDDAASESFLPSEGASSDPVTLRRRMLA AAAERRLQKQQTS Download Select all
Length	643
Uniprot ID	P33991
Ensembl Protein ID	ENSP00000262105

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	509
S	Phosphorylation	522
S	Phosphorylation	516
S	Phosphorylation	523
S	Phosphorylation	542
S	Phosphorylation	601

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
7322	UBE2D2	4268	NP_003330.1	in vitro;in vivo	11724934
7327	UBE2G2	4387	NP_003334.2	in vitro;in vivo	1 172 493 417 310 140
7415	VCP	3013	NP_009057.1	in vitro;in vivo;yeast 2-hybrid	1 533 159 816 275 660

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Protein processing in endoplasmic reticulum	hsa04141

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd14421	458-498	CUE_AMFR
cl21463	458-498	UBA_like_SF superfamily
cd00162	340-382	RING
cl17238	340-382	RING superfamily
pfam13639	339-379	zf-RING_2
cd14376	458-494	CUE_AUP1_AMFR_like
cd14420	460-499	CUE_AUP1
smart00184	341-378	RING
pfam13923	341-378	zf-C3HC4_2
smart00546	456-497	CUE
cd14424	459-494	CUE_Cue1p_like
pfam00097	341-378	zf-C3HC4
pfam12861	339-386	zf-Apc11
pfam02845	458-497	CUE
cd14422	457-494	CUE_RIN3_plant
pfam14634	341-379	zf-RING_5
COG5194	335-386	APC11
pfam13920	337-381	zf-C3HC4_3
smart00744	340-379	RINGv
pfam15227	341-378	zf-C3HC4_4
COG5243	86-382	HRD1
pfam12678	327-379	zf-rbx1
COG5540	340-382	COG5540
COG5574	311-379	PEX10
TIGR00599	341-381	rad18
COG5432	339-379	RAD18
COG5219	339-382	COG5219

Ontology Information

HPRD ID	4075
Molecular Class	Ubiquitin proteasome system protein
Molecular Function	DNA binding (GO:0003677)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
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CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
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