CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
BIRC2	329	baculoviral IAP repeat containing 2	11	cIAP1, hiap-2, MIHB, RNF48, c-IAP1

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
14708638	2003	Cell line : HT 29 (mutated p53), HCT 116 (wild-type p53), SW 480, and SW 620 (mutated p53) Source : ATCC Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	western blotting, immunocytochemistry	Up-regulation	-	-

Gene Details

NC_000011.9 (102217913..102249401)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Baculoviral IAP repeat containing, "RING-type (C3HC4) zinc fingers"
Description	The protein encoded by this gene is a member of a family of proteins that inhibits apoptosis by binding to tumor necrosis factor receptor-associated factors TRAF1 and TRAF2, probably by interfering with activation of ICE-like proteases. This encoded protein inhibits apoptosis induced by serum deprivation and menadione, a potent inducer of free radicals. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]
Chromosome	11
Location	11q22
Start	102217913
End	102249401
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815587:102347182-102378670 Homo sapiens chromosome 11, GRCh38.p2 Primary Assembly AACGCTGGTCCTCGGCCGGGCGCGCTGACGTCATCGTGCGTCAGAGTGAGCCCGGATGGGGCGGCGGGCT TCGGGAGCGCCCGGGCTGATCCGAGCCGAGCGGGCCGTATCTCCTTGTCGGCGCCGCTGATTCCCGGCTC TGCGGAGGCCTCTAGGCAGCCGCGCAGCTTCCGTGTTTGCTGCGCCCGCACTGCGGTGAGTGCTGCTCCT TCCGGGCTCGGGCGGCGTGGGGCGGGTGGGGACGCGAGGGCCCGCGGGGGCCCACTTCCCTGATGTGGCG GCGAACGAGGAAGGACGGGGCCTGAGGCCCTTCGGCCAAGGGTCGAGGGTCGCCGGGGGCTCTCTGCTTT CTACTCTCGCCAAGGTTTTATTGGATTCGGAAGCCCCAACTTCGAGACTTGCAGTCAAAGCGATTTTTAA AATGACTTGTTTTCAAGCCTCTGGCCGCCGCCCACTCTTCTGGCCCTTGGACTTTGACCAAGATGTTTTC TCGCAGTTTTTGCAAGGTTTTAAACTTAGCCCTCGGCGTTCTTTTAATGTAATACATTGAAACGAAGATA TTTCGGTGGCGGCGATATTTCATATTTCATAGTTGCCACTGCGCTCTGTCATTCCAGTAGTCGTCTGTTG TGTATTGTGAGAAGCAACTCTGGGAAATTATTGGGTAAATCCCATAGTTTCTATTCTTTTCCCTTCCATC CTATCCCCTGCCCAGCTGCAATTTGCGTAAAGAGAATGCAGCAGTGCGGTGCACGTAGATAAAAATCTTT CATTTAAAGATAGGATATAAGACCGGGTGTAATTAAAGCAATCATGCCAGTGGTCGTAGTGCCGGAGCCA 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mRNA Sequence	>gi\|390608635\|ref\|NM_001166.4\| Homo sapiens baculoviral IAP repeat containing 2 (BIRC2), transcript variant 1, mRNA AACGCTGGTCCTCGGCCGGGCGCGCTGACGTCATCGTGCGTCAGAGTGAGCCCGGATGGGGCGGCGGGCT TCGGGAGCGCCCGGGCTGATCCGAGCCGAGCGGGCCGTATCTCCTTGTCGGCGCCGCTGATTCCCGGCTC TGCGGAGGCCTCTAGGCAGCCGCGCAGCTTCCGTGTTTGCTGCGCCCGCACTGCGATTTACAACCCTGAA GAATCTCCCTATCCCTATTTTGTCCCCCTGCAGTAATAAATCCCATTATGGAGATCTCGAAACTTTATAA AGGGATATAGTTTGAATTCTATGGAGTGTAATTTTGTGTATGAATTATATTTTTAAAACATTGAAGAGTT TTCAGAAAGAAGGCTAGTAGAGTTGATTACTGATACTTTATGCTAAGCAGTACTTTTTTGGTAGTACAAT ATTTTGTTAGGCGTTTCTGATAACACTAGAAAGGACAAGTTTTATCTTGTGATAAATTGATTAATGTTTA CAACATGACTGATAATTATAGCTGAATAGTCCTTAAATGATGAACAGGTTATTTAGTTTTTAAATGCAGT GTAAAAAGTGTGCTGTGGAAATTTTATGGCTAACTAAGTTTATGGAGAAAATACCTTCAGTTGATCAAGA ATAATAGTGGTATACAAAGTTAGGAAGAAAGTCAACATGATGCTGCAGGAAATGGAAACAAATACAAATG ATATTTAACAAAGATAGAGTTTACAGTTTTTGAACTTTAAGCCAAATTCATTTGACATCAAGCACTATAG CAGGCACAGGTTCAACAAAGCTTGTGGGTATTGACTTCCCCCAAAAGTTGTCAGCTGAAGTAATTTAGCC CACTTAAGTAAATACTATGATGATAAGCTGTGTGAACTTAGCTTTTAAATAGTGTGACCATATGAAGGTT TTAATTACTTTTGTTTATTGGAATAAAATGAGATTTTTTGGGTTGTCATGTTAAAGTGCTTATAGGGAAA GAAGCCTGCATATAATTTTTTACCTTGTGGCATAATCAGTAATTGGTCTGTTATTCAGGCTTCATAGCTT GTAACCAAATATAAATAAAAGGCATAATTTAGGTATTCTATAGTTGCTTAGAATTTTGTTAATATAAATC TCTGTGAAAAATCAAGGAGTTTTAATATTTTCAGAAGTGCATCCACCTTTCAGGGCTTTAAGTTAGTATT ACTCAAGATTATGAACAAATAGCACTTAGGTTACCTGAAAGAGTTACTACAACCCCAAAGAGTTGTGTTC TAAGTAGTATCTTGGTAATTCAGAGAGATACTCATCCTACCTGAATATAAACTGAGATAAATCCAGTAAA GAAAGTGTAGTAAATTCTACATAAGAGTCTATCATTGATTTCTTTTTGTGGTAAAAATCTTAGTTCATGT GAAGAAATTTCATGTGAATGTTTTAGCTATCAAACAGTACTGTCACCTACTCATGCACAAAACTGCCTCC CAAAGACTTTTCCCAGGTCCCTCGTATCAAAACATTAAGAGTATAATGGAAGATAGCACGATCTTGTCAG ATTGGACAAACAGCAACAAACAAAAAATGAAGTATGACTTTTCCTGTGAACTCTACAGAATGTCTACATA TTCAACTTTCCCCGCCGGGGTGCCTGTCTCAGAAAGGAGTCTTGCTCGTGCTGGTTTTTATTATACTGGT GTGAATGACAAGGTCAAATGCTTCTGTTGTGGCCTGATGCTGGATAACTGGAAACTAGGAGACAGTCCTA TTCAAAAGCATAAACAGCTATATCCTAGCTGTAGCTTTATTCAGAATCTGGTTTCAGCTAGTCTGGGATC CACCTCTAAGAATACGTCTCCAATGAGAAACAGTTTTGCACATTCATTATCTCCCACCTTGGAACATAGT AGCTTGTTCAGTGGTTCTTACTCCAGCCTTTCTCCAAACCCTCTTAATTCTAGAGCAGTTGAAGACATCT CTTCATCGAGGACTAACCCCTACAGTTATGCAATGAGTACTGAAGAAGCCAGATTTCTTACCTACCATAT GTGGCCATTAACTTTTTTGTCACCATCAGAATTGGCAAGAGCTGGTTTTTATTATATAGGACCTGGAGAT AGGGTAGCCTGCTTTGCCTGTGGTGGGAAGCTCAGTAACTGGGAACCAAAGGATGATGCTATGTCAGAAC ACCGGAGGCATTTTCCCAACTGTCCATTTTTGGAAAATTCTCTAGAAACTCTGAGGTTTAGCATTTCAAA TCTGAGCATGCAGACACATGCAGCTCGAATGAGAACATTTATGTACTGGCCATCTAGTGTTCCAGTTCAG CCTGAGCAGCTTGCAAGTGCTGGTTTTTATTATGTGGGTCGCAATGATGATGTCAAATGCTTTTGTTGTG ATGGTGGCTTGAGGTGTTGGGAATCTGGAGATGATCCATGGGTAGAACATGCCAAGTGGTTTCCAAGGTG TGAGTTCTTGATACGAATGAAAGGCCAAGAGTTTGTTGATGAGATTCAAGGTAGATATCCTCATCTTCTT GAACAGCTGTTGTCAACTTCAGATACCACTGGAGAAGAAAATGCTGACCCACCAATTATTCATTTTGGAC CTGGAGAAAGTTCTTCAGAAGATGCTGTCATGATGAATACACCTGTGGTTAAATCTGCCTTGGAAATGGG CTTTAATAGAGACCTGGTGAAACAAACAGTTCAAAGTAAAATCCTGACAACTGGAGAGAACTATAAAACA GTTAATGATATTGTGTCAGCACTTCTTAATGCTGAAGATGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAGGAAAAACAAG CTGAAGAAATGGCATCAGATGATTTGTCATTAATTCGGAAGAACAGAATGGCTCTCTTTCAACAATTGAC ATGTGTGCTTCCTATCCTGGATAATCTTTTAAAGGCCAATGTAATTAATAAACAGGAACATGATATTATT AAACAAAAAACACAGATACCTTTACAAGCGAGAGAACTGATTGATACCATTTTGGTTAAAGGAAATGCTG CGGCCAACATCTTCAAAAACTGTCTAAAAGAAATTGACTCTACATTGTATAAGAACTTATTTGTGGATAA GAATATGAAGTATATTCCAACAGAAGATGTTTCAGGTCTGTCACTGGAAGAACAATTGAGGAGGTTGCAA GAAGAACGAACTTGTAAAGTGTGTATGGACAAAGAAGTTTCTGTTGTATTTATTCCTTGTGGTCATCTGG TAGTATGCCAGGAATGTGCCCCTTCTCTAAGAAAATGCCCTATTTGCAGGGGTATAATCAAGGGTACTGT TCGTACATTTCTCTCTTAAAGAAAAATAGTCTATATTTTAACCTGCATAAAAAGGTCTTTAAAATATTGT TGAACACTTGAAGCCATCTAAAGTAAAAAGGGAATTATGAGTTTTTCAATTAGTAACATTCATGTTCTAG TCTGCTTTGGTACTAATAATCTTGTTTCTGAAAAGATGGTATCATATATTTAATCTTAATCTGTTTATTT ACAAGGGAAGATTTATGTTTGGTGAACTATATTAGTATGTATGTGTACCTAAGGGAGTAGTGTCACTGCT TGTTATGCATCATTTCAGGAGTTACTGGATTTGTTGTTCTTTCAGAAAGCTTTGAATACTAAATTATAGT GTAGAAAAGAACTGGAAACCAGGAACTCTGGAGTTCATCAGAGTTATGGTGCCGAATTGTCTTTGGTGCT TTTCACTTGTGTTTTAAAATAAGGATTTTTCTCTTATTTCTCCCCCTAGTTTGTGAGAAACATCTCAATA AAGTGCTTTAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length	3813

CDS Information

Location	1453..3309
CDS Sequence	Download Select all
CCDS ID	CCDS58169.1

Protein Information

Protein ID	NP_001157.1
Protein Name	baculoviral IAP repeat containing 2
Molecular Wt. (Da)	69769
Protein Sequence	>lcl\|NM_001166.4_prot_NP_001157.1_1 [gene=BIRC2] [protein=baculoviral IAP repeat-containing protein 2 isoform 1] [protein_id=NP_001157.1] [location=1453..3309] MHKTASQRLFPGPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARA GFYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPMRNSFAHSLS PTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWPLTFLSPSELARAGFY YIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLRFSISNLSMQTHAARMRTFMYWP SSVPVQPEQLASAGFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQG RYPHLLEQLLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTT GENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQAEEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPILDNLLKANVINK QEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNLFVDKNMKYIPTEDVSGLSLEE QLRRLQEERTCKVCMDKEVSVVFIPCGHLVVCQECAPSLRKCPICRGIIKGTVRTFLS Download Select all
Length	618
Uniprot ID	O15151
Ensembl Protein ID	ENSP00000356150

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
S	Phosphorylation	140
S	Phosphorylation	157
S	Phosphorylation	147

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
836	CASP3	2799	NP_004337.2	in vitro	938 457 111 084 335
842	CASP9	3756	NP_001220.2	in vitro;in vivo	954 523 511 084 335
2619	GAS1	747	NP_002039.2	in vivo	11906213
2935	GSPT1	753	NP_002085.2	in vitro	12865429
4055	LTBR	2988	NP_002333.1	in vivo	12571250
7185	TRAF1	3418	NP_005649.1	in vitro	119 075 839 384 571
51465	UBE2J1	15599	NP_057105.2	in vitro	15861135

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Apoptosis	hsa04210
Focal adhesion	hsa04510
Hippo signaling pathway	hsa04390
NF-kappa B signaling pathway	hsa04064
NOD-like receptor signaling pathway	hsa04621
Pathways in cancer	hsa05200
Small cell lung cancer	hsa05222
TNF signaling pathway	hsa04668
Toxoplasmosis	hsa05145
Ubiquitin mediated proteolysis	hsa04120

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd08329	453-544	CARD_BIRC2_BIRC3
cl14633	453-544	DD superfamily
cd00022	270-336	BIR
cl00035	270-336	BIR superfamily
cd00022	185-252	BIR
cl00035	185-252	BIR superfamily
cd00022	49-115	BIR
cl00035	49-115	BIR superfamily
cd14394	391-437	UBA_BIRC2_3
cl21463	391-437	UBA_like_SF superfamily
cd00162	570-609	RING
cl17238	570-609	RING superfamily
smart00238	268-336	BIR
smart00238	183-252	BIR
pfam00653	272-337	BIR
smart00238	45-115	BIR
pfam00653	187-251	BIR
pfam00619	458-542	CARD
pfam00653	49-114	BIR
smart00114	453-541	CARD
pfam13920	567-612	zf-C3HC4_3
cd01671	461-539	CARD
cd14321	394-437	UBA_IAPs
cd08325	478-539	CARD_CASP1-like
cd14395	390-437	UBA_BIRC4_8
cd14396	394-437	UBA_XtBIRC7_like
pfam13923	571-605	zf-C3HC4_2
cd08330	461-530	CARD_ASC_NALP1
smart00184	571-605	RING
cd08323	459-528	CARD_APAF1
pfam14634	571-606	zf-RING_5
pfam13639	569-606	zf-RING_2
cd08786	461-530	CARD_RIP2_CARD3
PHA02929	486-606	PHA02929

Ontology Information

HPRD ID	2050
Molecular Class	Adapter molecule
Molecular Function	DNA binding (GO:0003677)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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