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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
CUL4B	8450	cullin 4B	X

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
23649548	2013	Cell line : - Source : - Sample Type : - No. of Sample : 203 CRC case Stage : -	Tissue microarray and immunohistochemistry	Up-regulation	-	CUL4B might promote the progression of colon cancer and can be served as a novel independent prognostic marker for the prediction of recurrence in colon cancer. Immunohistochemistry on a tissue microarray containing 203 cases of colon cancer was performed to analyze the association between CUL4B expression and clinicopathological features.

Gene Details

Chromosome X - NC_000023.11 (120524589..120575829, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family
Description	This gene is a member of the cullin family. The encoded protein forms a complex that functions as an E3 ubiquitin ligase and catalyzes the polyubiquitination of specific protein substrates in the cell. The protein interacts with a ring finger protein, and is required for the proteolysis of several regulators of DNA replication including chromatin licensing and DNA replication factor 1 and cyclin E. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.
Chromosome	X
Location	Xq23
Start	120524589
End	120575829
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815575:c120575829-120524589 Homo sapiens chromosome X, GRCh38.p2 Primary Assembly ACTACCCAATTGTGAAGACACAATCCCTCCCCAGCAGTTCAGTTTAGAAACTGCCAGTCTTGGTATAGAA CAACCTAGGCTTATCTGTTTAAGTCCCATAGGTAGTATTATTAGAGAATAACCCAGGCTTTGGGAACTGT ATAACTCTGAGATCGTTTGAAATTTTCGTTTTGTTTTTCTTTTGGCTCCAACCAGGCCTCTGTTGTTAGA CTAATGGGGTTTCCCCTGCAGAGATTGGTCAGCCCTGCAGTCTATCATCCCGGAAGGTGTTAAATACACA TGAAAGCCAGCCTCGGCGGGCAGAACCTAGCCCGCCGAAAGGGCGGGCATTGCTAAAGTGTTTTCAAAAG GTCTTCCCAATCCTCTGCTTTAGACAGCTCGGACCTTAGATAGAAGAACACAACGGATCCTCCAGTGACT GACGGTGAGCTAAAATGCCCTTTTGAGATTTCGGAATGTGGGGAGGATCTTGTTTAGGAACTTATTGAAG GTGGACCTGGTTATGTACCTGGTTATGGGTCACAAGACCTAAGCAAAGCCACATTTTTAGGCAATTTTAA GTTATTCTCAATGTTGTGCTAGGTTTCGTTATTCCCAAATATTTATAAGAGGTATGTTAAAAGTTACAGC CTTTATTCACCTGTGATGCGGATAACTTAGGGAAAAGCTCGTTAGAGTCATAGTTATTTGTGGTGAAGAT CCTACCCAGCAAAGTGGTGATCACAAGATGGCCTTCAACAACCATAGCACTGCAGCTTAAAGAAGAGGCA GGAACAGAAGAAAATTTGTGACTGATTCAGATCATAAGTGAGATAGTACTTTGAAGAACCTCCAGAAATA 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Length	5198

CDS Information

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CCDS ID	CCDS35379.1

Protein Information

Protein ID	NP_001073341.1
Protein Name	cullin 4B
Molecular Wt. (Da)	102168
Protein Sequence	>8450 MFPTGFSSPSPSAAAAAQEVRSATDGNTSTTPPTSAKKRKLNSSSSSSSNSSNEREDFDSTSSS SSTPPLQPRDSASPSTSSFCLGVSVAASSHVPIQKKLRFEDTLEFVGFDAKMAEESSSSSSSSS PTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPE NYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQ FREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIIS DQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQ KLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLD ENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHII DICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIF RFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDI MIQFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQ WQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLA CGKARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQI DAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA Download Select all
Length	895
Uniprot ID	Q14005
Ensembl Protein ID	ENSP00000302935

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
T	Phosphorylation	49
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S	Phosphorylation	29
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S	Phosphorylation	128
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S	Phosphorylation	142
S	Phosphorylation	123
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S	Phosphorylation	143
S	Phosphorylation	144
S	Phosphorylation	125
S	Phosphorylation	126
S	Phosphorylation	145
S	Phosphorylation	127
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T	Phosphorylation	130
T	Phosphorylation	85
T	Phosphorylation	67
S	Phosphorylation	7
S	Phosphorylation	8
S	Phosphorylation	10
S	Phosphorylation	12

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
367	AR	2437	NP_000035.2	in vivo	17392787
1642	DDB1	10952	NP_001914.3	in vivo	18593899
2099	ESR1	589	NP_000116.2	in vivo	17392787

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Nucleotide excision repair	hsa03420
Ubiquitin mediated proteolysis	hsa04120

Structure Information

PDB ID	2DO7
Resolution
Method	SOLUTION NMR
Chains	A
Molecule	Cullin-4B
Model	View

Domain Information

ID	Location	Description
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cl10551	596-736	CULLIN superfamily
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cl11186	842-907	Cullin_Nedd8 superfamily
smart00884	842-907	Cullin_Nedd8
pfam00888	217-815	Cullin
COG5647	191-913	COG5647

Ontology Information

HPRD ID	2976
Molecular Class	Ubiquitin proteasome system protein
Molecular Function	Cytokine activity (GO:0005125)
Biological Process	Immune response (GO:0006955)

SNP Information

View SNP Geneview Report

Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

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