CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
DSG3	1830	Desmoglein 3 (pemphigus vulgaris antigen)	18	PVA; CDHF6

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
22930170	2012	Cell line : KM 12C, KM 12SM, HT 29 Source : ATCC Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	Microarray analysis,Real time RT-PCR and Flow cytometry	Up-regulation	-	Gene differentially expressed and analysed bye by Microarray.

Gene Details

Chromosome: 18; NC_000018.9 (29027732..29058665)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Cadherins / Major cadherins
Description	Desmosomes are cell-cell junctions between epithelial, myocardial, and certain other cell types. Desmoglein 3 is a calcium-binding transmembrane glycoprotein component of desmosomes in vertebrate epithelial cells. Currently, three desmoglein subfamily members have been identified and all are members of the cadherin cell adhesion molecule superfamily. These desmoglein gene family members are located in a cluster on chromosome 18. This protein has been identified as the autoantigen of the autoimmune skin blistering disease pemphigus vulgaris. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	18
Location	18q12.1
Start	31447769
End	31478702
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815580:31447769-31478702 Homo sapiens chromosome 18, GRCh38.p2 Primary Assembly AAAGCAGCAGAGACGCTGCAGAGGGCTTTTCTTAGACATCAACTGCAGACGGCTGGCAGGATAGAAGCAG CGGCTCACTTGGACTTTTTCACCAGGGAAATCAGAGACAATGATGGGGCTCTTCCCCAGAACTACAGGGG CTCTGGCCATCTTCGTGGTAAGTCCTGGATTTTCCTAATAATCACAAACTTCCCTGCTTCCTCCCTTGTT AAAGAATATTATATTTGATTGCACAATCTTTATTATAAATTCTAAAAGGAGTGCAGTGGAAATCAACACT TTGAAATGAAATCGTGAAGATTACCAATTTCCTTCTTTTGTTGTTTTTTATGTTGTATTTTACATAGAAA AATAAACCAGAAAGAAATGAGTTTTAAAAACCATTTAGAATTTTTTTTAGTTAATGAATTAAGTAATCTT AATCACAGGTTATATTTTCCACAACATTTTCACTTTCTTTAAAGTTATGCTTTTACTAGTTTTTCTAACC CACAAACAAGAACACAGGAGCCACTTCTATTTTCCAAGATTACATGTCTCTTAGCATATAGCTAAGAACT CTACACGCCTGGGCTTGATACCTGACACGCTTTTAAAAGTAAAAAATCGCAGAATTAAAATCAAAGCAGT GTTTGACTCTAGAGAAGTTGGGAGGATTATTAAGTAAGTATTTATGTTTAGCTATTATGTGCCAAAAGAA AATGTCAGCCTTTGGGGATGGGGGGAAAGACATACAACATTTTAAAGCCATTTTTTTCAGAAAAGTAATA CTTCTGTTGATTGAGAAAGTCGTACATAGTATTATCTAAAAGAGAAACGGAATGTTACAGACTGTTTAAA 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CCCTCTGCAGCATGGTAACTATTTAGTAACGGAGACTTACTCGGCTTCTGGTTCCCTCGTGCAA CCTTCCACTGCAGGCTTTGATCCACTTCTCACACAAAATGTGATAGTGACAGAAAGGGTGATCT GTCCCATTTCCAGTGTTCCTGGCAACCTAGCTGGCCCAACGCAGCTACGAGGGTCACATACTAT GCTCTGTACAGAGGATCCTTGCTCCCGTCTAATATGACCAGAATGAGCTGGAATACCACACTGA CCAAATCTGGATCTTTGGACTAAAGTATTCAAAATAGCATAGCAAAGCTCACTGTATTGGGCTA ATAATTTGGCACTTATTAGCTTCTCTCATAAACTGATCACGATTATAAATTAAATGTTTGGGTT CATACCCCAAAAGCAATATGTTGTCACTCCTAATTCTCAAGTACTATTCAAATTGTAGTAAATC TTAAAGTTTTTCAAAACCCTAAAATCATATTCGCCAGGAAATTTTCCTAAACATTCTTAAGCTT CTATTTTTCCCCTGCCAAAGGAAGGTGTTTATCATTTTAAAATGCAATGTGATTTAGTGGATTA AGCAGGAGCGCTGGTTCTTGTCTCCATTGCCTTTTCTTATATCATTGATAATGATGTAAGAATC ACAAGGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTG GATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACAAGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA ATACAAAAAATTAGCCGGGCGCAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG CAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCAGTC CGCAGTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCAC AAGGTATTTGCTAAAGCATTTTGAGCTGCTTGGAAAAAGGGAAGTAGTTGCAGTAGAGTTTCTT CCATCTTCTTGGTGCTGGGAAGCCATATATGTGTCTTTTACTCAAGCTAAGGGGTATAAGCTTA TGTGTTGAATTTGCTACATCTATATTTCACATATTCTCACAATAAGAGAATTTTGAAATAGAAA TATCATAGAACATTTAAGAAAGTTTAGTATAAATAATATTTTGTGTGTTTTAATCCCTTTGAAG GGATCTATCCAAAGAAAATATTTTACACTGAGCTCCTTCCTACACGTCTCAGTAACAGATCCTG TGTTAGTCTTTGAAAATAGCTCATTTTTTAAATGTCAGTGAGTAGATGTAGCATACATATGATG TATAATGACGTGTATTATGTTAACAATGTCTGCAGATTTTGTAGGAATACAAAACATGGCCTTT TTTATAAGCAAAACGGGCCAATGACTAGAATAACACATAGGGCAATCTGTGAATATGTATTATA AGCAGCATTCCAGAAAAGTAGTTGGTGAAATAATTTTCAAGTCAAAAAGGGATATGGAAAGGGA ATTATGAGTAACCTCTATTTTTTAAGCCTTGCTTTTAAATTAAACAGCTACAGCCATTTAAGCC TTGAGGATAATAAAGCTTGAGAGTAATAATGTTAGGTTAGCAAAGGTTTAGATGTATCACTTCA TGCATGCTACCATGATAGTAATGCAGCTCTTCGAGTCATTTCTGGTCATTCAAGATATTCACCC TTTTGCCCATAGAAAGCACCCTACCTCACCTGCTTACTGACATTGTCTTAGCTGATCACAAGAT CATTATCAGCCTCCATTATTCCTTACTGTATATAAAATACAGAGTTTTATATTTTCCTTTCTTC GTTTTTCACCATATTCAAAACCTAAATTTGTTTTTGCAGATGGAATGCAAAGTAATCAAGTGTT TGTGCTTTCACCTAGAAGGGTGTGGTCCTGAAGGAAAGAGGTCCCCTAAATATCCCCCACCCTG GTGCTCCTCCCTCTCCCTGGTACCCTGACTACCAGGAAGTCAGGTGCTAGAGCAGCTGGAGAAG TGCAGGCAGCCTGTGCTTCCACAGATGGGGGTGCTGCTGCAACAAGGCTTTCAATGTGCCCATC TTAGGTGGGAGAAGCTAGATCCTGTGCAGCAGCCTGGTAAGTCCTGAGGAGGTTCCATTGCTCT TCCTGCTGCTGTCCTTTGCTTCTCAACGGTGGCTCGCTCTACAGTCTAGAGCACATGCAGCTAA CTTGTGCCTCTGCTTATGCATGAGGGTTAAATTAACAACCATAACCTTCATTTGAAGTTCAAAG GTGTATTCAGGATCCTCAAAGCATTTTAACCTTGCCGCTTAAAACCCAATTTACCGTGAAATGG GAATTTTGCTGCATTGTTAAACTGTAGTGGAAACCATGCTATAGTAATAAAGGTTATATAAGAG AGAAATTGAAATTAAATGTGTTTTTAAATTTCAAAAAAAAATCAATCTTTAGGATGACTTAAAA ATTGATTTGCCATGTAAAATGTATCTGCATTTTTTACACAAAACTTGTTTTAAGCATAAAATTT TAAAACTGTACTACTTGATGTATTATACATTTTGAACCATATGTATTAAACCATAAACAGTATA ATGTTGTTATAATAAAACAGGCAATAAATTTATAAATAAAAGCTGAAAAAAAAAAAA Download Select all
Length	5561

CDS Information

Location	join(110..157,8672..8707,9225..9356,10677..10832, 11265..11409,12077..12243,13065..13193,13459..13644, 16343..16614,17550..17689,18762..18986,21321..21581, 24516..24655,24957..25020,26353..26636,27878..28492)
CDS Sequence	>gi\|119964717:110-3109 Homo sapiens desmoglein 3 (DSG3), mRNA ATGATGGGGCTCTTCCCCAGAACTACAGGGGCTCTGGCCATCTTCGTGGTGGTCATATTGGTTCATGGAG AATTGCGAATAGAGACTAAAGGTCAATATGATGAAGAAGAGATGACTATGCAACAAGCTAAAAGAAGGCA AAAACGTGAATGGGTGAAATTTGCCAAACCCTGCAGAGAAGGAGAAGATAACTCAAAAAGAAACCCAATT GCCAAGATTACTTCAGATTACCAAGCAACCCAGAAAATCACCTACCGAATCTCTGGAGTGGGAATCGATC AGCCGCCTTTTGGAATCTTTGTTGTTGACAAAAACACTGGAGATATTAACATAACAGCTATAGTCGACCG GGAGGAAACTCCAAGCTTCCTGATCACATGTCGGGCTCTAAATGCCCAAGGACTAGATGTAGAGAAACCA CTTATACTAACGGTTAAAATTTTGGATATTAATGATAATCCTCCAGTATTTTCACAACAAATTTTCATGG GTGAAATTGAAGAAAATAGTGCCTCAAACTCACTGGTGATGATACTAAATGCCACAGATGCAGATGAACC AAACCACTTGAATTCTAAAATTGCCTTCAAAATTGTCTCTCAGGAACCAGCAGGCACACCCATGTTCCTC CTAAGCAGAAACACTGGGGAAGTCCGTACTTTGACCAATTCTCTTGACCGAGAGCAAGCTAGCAGCTATC GTCTGGTTGTGAGTGGTGCAGACAAAGATGGAGAAGGACTATCAACTCAATGTGAATGTAATATTAAAGT GAAAGATGTCAACGATAACTTCCCAATGTTTAGAGACTCTCAGTATTCAGCACGTATTGAAGAAAATATT TTAAGTTCTGAATTACTTCGATTTCAAGTAACAGATTTGGATGAAGAGTACACAGATAATTGGCTTGCAG TATATTTCTTTACCTCTGGGAATGAAGGAAATTGGTTTGAAATACAAACTGATCCTAGAACTAATGAAGG CATCCTGAAAGTGGTGAAGGCTCTAGATTATGAACAACTACAAAGCGTGAAACTTAGTATTGCTGTCAAA AACAAAGCTGAATTTCACCAATCAGTTATCTCTCGATACCGAGTTCAGTCAACCCCAGTCACAATTCAGG TAATAAATGTAAGAGAAGGAATTGCATTCCGTCCTGCTTCCAAGACATTTACTGTGCAAAAAGGCATAAG TAGCAAAAAATTGGTGGATTATATCCTGGGAACATATCAAGCCATCGATGAGGACACTAACAAAGCTGCC TCAAATGTCAAATATGTCATGGGACGTAACGATGGTGGATACCTAATGATTGATTCAAAAACTGCTGAAA TCAAATTTGTCAAAAATATGAACCGAGATTCTACTTTCATAGTTAACAAAACAATCACAGCTGAGGTTCT GGCCATAGATGAATACACGGGTAAAACTTCTACAGGCACGGTATATGTTAGAGTACCCGATTTCAATGAC AATTGTCCAACAGCTGTCCTCGAAAAAGATGCAGTTTGCAGTTCTTCACCTTCCGTGGTTGTCTCCGCTA GAACACTGAATAATAGATACACTGGCCCCTATACATTTGCACTGGAAGATCAACCTGTAAAGTTGCCTGC CGTATGGAGTATCACAACCCTCAATGCTACCTCGGCCCTCCTCAGAGCCCAGGAACAGATACCTCCTGGA GTATACCACATCTCCCTGGTACTTACAGACAGTCAGAACAATCGGTGTGAGATGCCACGCAGCTTGACAC TGGAAGTCTGTCAGTGTGACAACAGGGGCATCTGTGGAACTTCTTACCCAACCACAAGCCCTGGGACCAG GTATGGCAGGCCGCACTCAGGGAGGCTGGGGCCTGCCGCCATCGGCCTGCTGCTCCTTGGTCTCCTGCTG CTGCTGTTGGCCCCCCTTCTGCTGTTGACCTGTGACTGTGGGGCAGGTTCTACTGGGGGAGTGACAGGTG GTTTTATCCCAGTTCCTGATGGCTCAGAAGGAACAATTCATCAGTGGGGAATTGAAGGAGCCCATCCTGA AGACAAGGAAATCACAAATATTTGTGTGCCTCCTGTAACAGCCAATGGAGCCGATTTCATGGAAAGTTCT GAAGTTTGTACAAATACGTATGCCAGAGGCACAGCGGTGGAAGGCACTTCAGGAATGGAAATGACCACTA AGCTTGGAGCAGCCACTGAATCTGGAGGTGCTGCAGGCTTTGCAACAGGGACAGTGTCAGGAGCTGCTTC AGGATTCGGAGCAGCCACTGGAGTTGGCATCTGTTCCTCAGGGCAGTCTGGAACCATGAGAACAAGGCAT TCCACTGGAGGAACCAATAAGGACTACGCTGATGGGGCGATAAGCATGAATTTTCTGGACTCCTACTTTT CTCAGAAAGCATTTGCCTGTGCGGAGGAAGACGATGGCCAGGAAGCAAATGACTGCTTGTTGATCTATGA TAATGAAGGCGCAGATGCCACTGGTTCTCCTGTGGGCTCCGTGGGTTGTTGCAGTTTTATTGCTGATGAC CTGGATGACAGCTTCTTGGACTCACTTGGACCCAAATTTAAAAAACTTGCAGAGATAAGCCTTGGTGTTG ATGGTGAAGGCAAAGAAGTTCAGCCACCCTCTAAAGACAGCGGTTATGGGATTGAATCCTGTGGCCATCC CATAGAAGTCCAGCAGACAGGATTTGTTAAGTGCCAGACTTTGTCAGGAAGTCAAGGAGCTTCTGCTTTG TCCACCTCTGGGTCTGTCCAGCCAGCTGTTTCCATCCCTGACCCTCTGCAGCATGGTAACTATTTAGTAA CGGAGACTTACTCGGCTTCTGGTTCCCTCGTGCAACCTTCCACTGCAGGCTTTGATCCACTTCTCACACA AAATGTGATAGTGACAGAAAGGGTGATCTGTCCCATTTCCAGTGTTCCTGGCAACCTAGCTGGCCCAACG CAGCTACGAGGGTCACATACTATGCTCTGTACAGAGGATCCTTGCTCCCGTCTAATATGA Download Select all
CCDS ID	CCDS11898.1

Protein Information

Protein ID	NP_001935.2
Protein Name	Desmoglein 3 (pemphigus vulgaris antigen)
Molecular Wt. (Da)	101844
Protein Sequence	>1830 MMGLFPRTTGALAIFVVVILVHGELRIETKGQYDEEEMTMQQAKRRQKREWVKFAKPCREGEDN SKRNPIAKITSDYQATQKITYRISGVGIDQPPFGIFVVDKNTGDINITAIVDREETPSFLITCR ALNAQGLDVEKPLILTVKILDINDNPPVFSQQIFMGEIEENSASNSLVMILNATDADEPNHLNS KIAFKIVSQEPAGTPMFLLSRNTGEVRTLTNSLDREQASSYRLVVSGADKDGEGLSTQCECNIK VKDVNDNFPMFRDSQYSARIEENILSSELLRFQVTDLDEEYTDNWLAVYFFTSGNEGNWFEIQT DPRTNEGILKVVKALDYEQLQSVKLSIAVKNKAEFHQSVISRYRVQSTPVTIQVINVREGIAFR PASKTFTVQKGISSKKLVDYILGTYQAIDEDTNKAASNVKYVMGRNDGGYLMIDSKTAEIKFVK NMNRDSTFIVNKTITAEVLAIDEYTGKTSTGTVYVRVPDFNDNCPTAVLEKDAVCSSSPSVVVS ARTLNNRYTGPYTFALEDQPVKLPAVWSITTLNATSALLRAQEQIPPGVYHISLVLTDSQNNRC EMPRSLTLEVCQCDNRGICGTSYPTTSPGTRYGRPHSGRLGPAAIGLLLLGLLLLLLAPLLLLT CDCGAGSTGGVTGGFIPVPDGSEGTIHQWGIEGAHPEDKEITNICVPPVTANGADFMESSEVCT NTYARGTAVEGTSGMEMTTKLGAATESGGAAGFATGTVSGAASGFGAATGVGICSSGQSGTMRT RHSTGGTNKDYADGAISMNFLDSYFSQKAFACAEEDDGQEANDCLLIYDNEGADATGSPVGSVG CCSFIADDLDDSFLDSLGPKFKKLAEISLGVDGEGKEVQPPSKDSGYGIESCGHPIEVQQTGFV KCQTLSGSQGASALSTSGSVQPAVSIPDPLQHGNYLVTETYSASGSLVQPSTAGFDPLLTQNVI VTERVICPISSVPGNLAGPTQLRGSHTMLCTEDPCSRLI Download Select all
Length	999
Uniprot ID	Q99933
Ensembl Protein ID	ENSP00000369026

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
D	Proteolytic Cleavage	781
R	Proteolytic Cleavage	49
N	Glycosylation	545
S	Phosphorylation	387

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
11187	PKP3	5711	NP_009114.1	in vivo;yeast 2-hybrid	12707304

Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
cd11304	165-263	Cadherin_repeat
cl15786	165-263	CA_like superfamily
cd11304	271-377	Cadherin_repeat
cl15786	271-377	CA_like superfamily
cd11304	62-153	Cadherin_repeat
cl15786	62-153	CA_like superfamily
cd11304	402-491	Cadherin_repeat
cl15786	402-491	CA_like superfamily
smart00112	180-265	CA
pfam00028	164-257	Cadherin
pfam00028	272-375	Cadherin
smart00112	82-155	CA
smart00112	289-377	CA
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smart00112	410-493	CA
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Ontology Information

HPRD ID	3292
Molecular Class	Adhesion molecule
Molecular Function	Transcription factor activity (GO:0003700)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

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ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

ArrayExpress	GO
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Tumor Gene Family of Databases	GO
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