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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
EFNB2	1948	Ephrin-B2	13	HTKL; EPLG5; Htk-L; LERK5

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
16596216	2006	Cell line : - Source : - Sample Type : - No. of Sample : - Stage : -	-	Up-regulation	-	EFNB2 mRNA in human ES cells, neural tissues and colon cancer were expressed.

Gene Details

Chromosome: 13; NC_000013.10 (107142079..107187388, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Ephrins
Description	This gene encodes a member of the ephrin (EPH) family. The ephrins and EPH-related receptors comprise the largest subfamily of receptor protein-tyrosine kinases and have been implicated in mediating developmental events, especially in the nervous system and in erythropoiesis. Based on their structures and sequence relationships, ephrins are divided into the ephrin-A (EFNA) class, which are anchored to the membrane by a glycosylphosphatidylinositol linkage, and the ephrin-B (EFNB) class, which are transmembrane proteins. This gene encodes an EFNB class ephrin which binds to the EPHB4 and EPHA3 receptors. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	13
Location	13q33
Start	106489731
End	106535040
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815585:c106535040-106489731 Homo sapiens chromosome 13, GRCh38.p2 Primary Assembly AGGATTGGGGGTCCCAGCCTGCGTCCCGTCAGTCCCTTCTTGGCCCGGAGTGCGCGGAGCTGGGAGTGGC TTCGCCATGGCTGTGAGAAGGGACTCCGTGTGGAAGTACTGCTGGGGTGTTTTGATGGTTTTATGCAGAA CTGCGATTTCCAAATCGATAGTTTTAGAGCCTATCTATTGGAATTCCTCGAACTCCAAGTAAGTGGCGTC CGCGATCCCCCTATGTCCCCGCCCCGGGGTCCGCCGCGCCGTCCGGGCGGGAGGAGGGGTCAGTCCGCGG GGCCTCGGAGCCTGTTTCTGGAACCTCGGTTCCCCGTCCCCCACCCCCAACCCCCGCCCCATTTCACTAG GTGGAGACTCCTCGCTCGGCTTTCCAACCCGAGCCCCGCTGGAACGGACGGTCTCTCCGCCTTTCCTCCC CCGAACGCTCCCAGGCGCTAAAAGCTACTATCGGCTCGGGTGTCAAGTCCGGGAAGGTGTCCGATGGCGA TACCTGACCCTCTCCTGTTTTCGAGGACGAAGGACATGGCCACAATCTAGGCTGGCCGGCACGCGGGGAC TGGTGGGCTCTGGAGAGAGGCGGAGATGCTGCATTCGCGGGGAGCGCGGGCGGCGTGGTCCGGGGCCCGC GGGCGGGCGACCGGGGTGGCAGGACGCTGGCAGCGAAGCGCGTTCTGGAGAGGGGAGCCTGGAGTCGCTA CGCTGCCCGCAGAGCCCTGGAGCCGGGGCGCCTTGGCACCGCGCCGCCAGCCCGAGGGTGCGCGGGGAGC TCGCCTGCTTCGCAGGAGAACTCGGGCGTCGAGCCCTTTCCTCCGCGCCGGGGAGACGGGCCTTAGGCTT 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Protein Name	Ephrin-B2
Molecular Wt. (Da)	33782
Protein Sequence	>1948 MAVRRDSVWKYCWGVLMVLCRTAISKSIVLEPIYWNSSNSKFLPGQGLVLYPQIGDKLDIICPK VDSKTVGQYEYYKVYMVDKDQADRCTIKKENTPLLNCAKPDQDIKFTIKFQEFSPNLWGLEFQK NKDYYIISTSNGSLEGLDNQEGGVCQTRAMKILMKVGQDASSAGSTRNKDPTRRPELEAGTNGR SSTTSPFVKPNPGSSTDGNSAGHSGNNILGSEVALFAGIASGCIIFIVIIITLVVLLLKYRRRH RKHSPQHTTTLSLSTLATPKRSGNNNGSEPSDIIIPLRTADSVFCPHYEKVSGDYGHPVYIVQE MPPQSPANIYYKV Download Select all
Length	333
Uniprot ID	Q07812
Ensembl Protein ID	ENSP00000293288

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
Y	Phosphorylation	304
Y	Phosphorylation	330
S	Phosphorylation	325

Enzyme Information

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PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
1742	DLG4	4199	NP_001356.1	yeast 2-hybrid	15458844
2042	EPHA3	1555	NP_005224.2	in vitro;in vivo	8559144
2050	EPHB4	2481	NP_004435.3	in vivo	120 517 769 718 367
5175	PECAM1	1425	NP_000433.3	in vivo	16357318
5663	PSEN1	87	NP_000012.1	in vitro;in vivo	16511561
5998	RGS3	3720	NP_652759.3	yeast 2-hybrid	15458844
6714	SRC	1819	NP_005408.1	in vitro	8878483
9456	HOMER1	9211	NP_004263.1	in vitro;in vivo	15745950
9463	PICK1	16176	NP_036539.1	yeast 2-hybrid	15458844
23024	PDZRN3	15115	NP_055824.1	yeast 2-hybrid	15458844
23426	GRIP1	19086	NP_066973.2	in vitro	9883737

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Axon guidance	hsa04360

Structure Information

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Domain Information

ID	Location	Description
cd10426	29-165	Ephrin-B_Ectodomain
cl19115	29-165	Cupredoxin superfamily
pfam00812	30-165	Ephrin
cd02675	30-165	Ephrin_ectodomain
cd10425	32-138	Ephrin-A_Ectodomain

Ontology Information

HPRD ID	2498
Molecular Class	Membrane bound ligand
Molecular Function	Receptor signaling complex scaffold activity (GO:0030159)
Biological Process	Apoptosis (GO:0006915)

SNP Information

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Drug Information

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External Links

ArrayExpress GO
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Cancer3D GO
COSMIC GO
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CCDB GO
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Osteosarcoma Database GO
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