CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
IPO7	10527	Importin 7	11	Imp7; RANBP7

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
10799331	2000	Cell line : - Source : Royal London Hospital. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 75 Stage : -	real time RT-PCR	Up-regulation	-	Elevated levels of RanBP7 mRNA in colorectal carcinoma are associated with increased proliferation and are similar to the transcription pattern of the proto-oncogene c-myc. RanBP7 mRNA levels were elevated in 47/75 colorectal tumours.
22968445	2012	Cell line : - Source : Department of Pathology of Wrocaw Medical University. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : 8 Stage : -	Laser capture microdissection,FFPE-FASP,SAX fractionation,LC-MSMS,Label-free quantitation.	Up-regulation	6	-

Gene Details

Chromosome: 11; NC_000011.9 (9406169..9469674)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	Importins
Description	The importin-alpha/beta complex and the GTPase Ran mediate nuclear import of proteins with a classical nuclear localization signal. The protein encoded by this gene is a member of a class of approximately 20 potential Ran targets that share a sequence motif related to the Ran-binding site of importin-beta. Similar to importin-beta, this protein prevents the activation of Ran's GTPase by RanGAP1 and inhibits nucleotide exchange on RanGTP, and also binds directly to nuclear pore complexes where it competes for binding sites with importin-beta and transportin. This protein has a Ran-dependent transport cycle and it can cross the nuclear envelope rapidly and in both directions. At least four importin beta-like transport receptors, namely importin beta itself, transportin, RanBP5 and RanBP7, directly bind and import ribosomal proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	11
Location	11p15.4
Start	9384622
End	9448127
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815587:9384622-9448127 Homo sapiens chromosome 11, GRCh38.p2 Primary Assembly GTTCTATCCGGGGCCTTGGCGCTTCTCTTTCCTTTCGCGCCGGTTGCCGCTGCGGAGCGCGGCGGGTCCA TGTGCGCAGTGAGTGGCGCTATTCCTGGCCCAGTAGCACCCGAGCCCCGGGTTTGACCGAGTCCGCGCTG CGATGGACCCCAACACCATTATCGAGGCCCTGCGGGGCACTATGGACCCAGCCCTGCGTGAGGCCGCGGA GCGCCAGCTCAATGAAGTAAGGACGCCCGGCTAGCGGTGGCGGCGGGCAGGCGGGTGGGCAGAAGTGGCA GGCCGAGCCCCCGGGGCCTGGCCGGAGGCGCGGACGACGTCGTTGAGGGTCCCAGCAGGAGGGTGGGGCG GACATCTGACGGCGACTTCCACGCCGGGGCGCCTCGGTGTGGTGTGGTGGTGGTGGCTGCAGCCAAGGCT GCCTTTGCTTCGGATCCTGAGCTGGGCCTCTGGCTGCGGTCTAGGCATGAGGAGCCGGCTGAGGCGGGGC GGGCGTGACGGGTTGGACACATGGCTGGCTCGGGTGGCTGGCCGACCTCTGGCTCATTCCCAGCTGGTTC CTCACGTCCAGGAGGGGGCGAAACTTACTGGGAGGTTTTTCAGATGTTTCTGAGACCAGTCTCGCCGTCG CAGGGTTTGGAAGGGCTCCTGGGAATGCCGGCTGGTCCTTTGGGGGCTGCGCCTGTCATCCTTGTCACTT TGCTGGGCTGATCAGTGGCCTGCCTCGGGCACAACTTCCTCCTCTCTGGCTGAGTTGCTAGGGAAGGCTT TCAAAGGCAAGCCCGCGCCTCCTTGGCAGGATAGGAGTAGTGCGGGACACTCACAGAGTCTGATCCCTGC 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ATAAAAATCTGTAAATGAATTAGCACTTTCATATTGAAACAAGCCTGCTAGCCTATGTATAAAA TAGCAAAATGTTTGCTGTTTATAAAAAGATGTAATGGGGTGGGGGGCAGGGGTAATTTCAAGTT ATTAATTTAAAAATGAACTAGCAATTTTGTACCTGGTGACTTTGTGGTGCACTCACCTCTGATA GTGACTTGAATTCGGTATGTAAAAAGGGGTTAGTGGTATTTCATTGCTGCTAAAAATGACAACT CCCTCTGTGTCCTGTTTTTCTTAAAGCTGTCAGTGTACAAGTGGGTATTTGAATACCAGACCTT ACTGTAAAAAATAAAAAAGGTGGTATCTAGAGCATGTAAATTGGATATAAAGTTCTGCTCTTAA AGAGTTGATCTAAGAGTATGGCTAAACATCTATATATGCAATCTATTAAAAGAACTTAATTCGG CTATTATGTCTTGATTTGATTGCAGTTTTTTCCTAATTATAACAAATTTTTCCTCATTGGCCTG TTTTTAATCCTGTGCCTAGAAGGAGTACAAAATGCACACTTTACAAAATTGATATTTAACACTT ACCCACTCCCCTTTCCCCATCTCTTCTACCGCTCTTGTTGATCGTGGTATCTGATCTTGACTAG ATAGGCTGAAGGCACATGGTTCCCTCCAAAAACCACTATTGATACCACTACAAAAACAAGCCAG CAAAAAGATACTGTAGAGAGGTTGGCTTGCTTCCCTCTCTTCCTAACTGCATGTTGAAAAATAA GCCGTTATTGATCTTAAACATCGGTCAGATGAGTCATACATTGGGTTATTTTTTATATACATGT ATACACAAAATATTTCAAATTGAAAGCAACATCTTAATGGATTCAAAACTATTACAAGCTGTTG TCTAAAACAGGTGAGAAAAAAATTTATAACTGTAAAAACAAATGCACATATTGATATTTAAAAT 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Length	6209

CDS Information

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CCDS ID	CCDS31425.1

Protein Information

Protein ID	NP_006382.1
Protein Name	Importin 7
Molecular Wt. (Da)	119386
Protein Sequence	>10527 MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQAGVIYLKNMI TQYWPDRETAPGDISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIKHDYPSRWTA IVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLPVLKDRFIQLLSDQ SDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDVPNETLQVEEDDRPELP WWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGVQQVLLKVLYQYKEKQYMAPR VLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFE DFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEPNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKI YKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVLHYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMP VKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIRPVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPI AVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEGSDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVI GTVLQQHVLEFYEEIFSLAHSLTCQQVSPQMWQLLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVD TDTLLSDTKYLEMIYSMCKKVLTGVAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALER LTREVKTSELRTMCLQVAIAALYYNPHLLLNTLENLRFPNNVEPVTNHFITQWLNDVDCFLGLH DRKMCVLGLCALIDMEQIPQVLNQVSGQILPAFILLFNGLKRAYACHAEHENDSDDDDEAEDDD ETEELGSDEDDIDEDGQEYLEILAKQAGEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTIIDDEDNPVDEYQ IFKAIFQTIQNRNPVWYQALTHGLNEEQRKQLQDIATLADQRRAAHESKMIEKHGGYKFSAPVV PSSFNFGGPAPGMN Download Select all
Length	1038
Uniprot ID	P18074
Ensembl Protein ID	ENSP00000375809

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
Y	Phosphorylation	311;-
T	Phosphorylation	898;-
S	Phosphorylation	903;-
Y	Phosphorylation	876;-
S	Phosphorylation	886;-
Y	Phosphorylation	915;-
S	Phosphorylation	438
T	Phosphorylation	43

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
3005	H1F0	819	NP_005309.1	in vitro	10228156
3837	KPNB1	4114	NP_002256.2	in vitro	102 281 569 214 382
5901	RAN	3109	NP_006316.1	in vitro	9214382
6125	RPL5	4699	NP_000960.2	in vitro	9687515
6201	RPS7	4712	NP_001002.1	in vitro	9687515
6728	SRP19	1644	NP_003126.1	in vitro	11682607

Pathway Information

No matching records could be found.

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
pfam03810	22-101	IBN_N
cl04271	22-101	IBN_N superfamily
smart00913	22-101	IBN_N
pfam08506	203-440	Cse1
cl20359	203-440	Cse1 superfamily
COG5656	15-997	SXM1
COG5657	13-683	CSE1

Ontology Information

HPRD ID	596
Molecular Class	Transport/cargo protein
Molecular Function	DNA repair protein (GO:0003685)
Biological Process	DNA repair (GO:0006281)

SNP Information

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Drug Information

No matching records could be found.

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

ArrayExpress	GO
ICGC	GO
Cancer3D	GO
COSMIC	GO
NCG	GO
TSGene	GO
Tumor Gene Family of Databases	GO
CCDB	GO
G2SBC	GO
Osteosarcoma Database	GO
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