CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
PRKAA1	5562	Protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit	5	AMPK; AMPKa1

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20622004	2010	Cell line : - Source : Case control studies conducted in Utah, the Northern California Kaiser Permanente Medical Care Program (KPMCP) and the Twin Cities Metropolitan area of Minnesota. Sample Type : Population based case control study No. of Sample : 871 male and 685 female colon cancer cases and 1047 male and 909 female controls Stage : -	-	Polymorhpism	-	PRKAA1 and PRKAG2 tagSNPs were associated with colon cancer.

Gene Details

Chromosome: 5; NC_000005.9 (40759481..40798297, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	The protein encoded by this gene belongs to the ser/thr protein kinase family. It is the catalytic subunit of the 5'-prime-AMP-activated protein kinase (AMPK). AMPK is a cellular energy sensor conserved in all eukaryotic cells. The kinase activity of AMPK is activated by the stimuli that increase the cellular AMP/ATP ratio. AMPK regulates the activities of a number of key metabolic enzymes through phosphorylation. It protects cells from stresses that cause ATP depletion by switching off ATP-consuming biosynthetic pathways. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	5
Location	5p12
Start	40759379
End	40798195
Strand	-
Gene Sequence	>gi\|568815593:c40798195-40759379 Homo sapiens chromosome 5, GRCh38.p2 Primary Assembly AGCGCCATGCGCAGACTCAGTTCCTGGAGAAAGATGGCGACAGCCGAGAAGCAGAAACACGACGGGCGGG TGAAGATCGGCCACTACATTCTGGGTGACACGCTGGGGGTCGGCACCTTCGGCAAAGTGAAGGGTGAGAA CCCCGCGGGACTAGGCTTGGCCCCAGCTGAGGAGCCGCACGACTTCCGCTTTCCGCACCTCTTCATCCTC CCCCGCCCGCTGCGTCCCTTCTTTCCAGGGCTGGGCAGCCCCTGTCCCGGATCCTGCGGGAGCTCTCCCC AGCCGCCGCGGGGCTGCGGCGCGGCCAGCACAGGCCGGGTGGGGGTGGGGGTGGGGTAGGGGCCAGTCGC CATGGCGACGGCGCCGCGGCCTGAGGGGCTGGTAGGTACGAGGGGCTGGGATGCGAAGGTGCAAACTTTC CCAGGTGGGGCAGGCGGGCGGCGCGGCGCGCTCTGGGTGCTGGGAGGGGGCGCCGGGCGCGATCCCCGGG GAGGCGGCATCTTGTGCGCCCGGGTTGTGCTCCCTTGGCTCAGGGCCAGCCCATCGCTTCCTTGGCGGTC CTTGGCGTTGTCGGTATTTCCGTCCTCTGTAGGAGGCTGTCGATTTACCGGCCCCTGCTGTTTCCCGAGT GCGAAATGTGTTTCCGCAGAAGTAAGGTTTCTTTGTGGGTAGCCGACATCATTTTTTTTAAAGACCATGT CGTCGGAAAGGATCACTGGTTTCCTTCGGAGCAGTTAATGAGTATAAACTGGTTCAGTATTTGCGATGCA TGGTTTACGTTCTGAATGAGACTGTGCCTTTAGTGTTTCCGAATTAACAGGAGTTTCTCCGTGCGAAACT 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CDS Information

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CDS Sequence	>gi\|94557300:7-1686 Homo sapiens protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit (PRKAA1), transcript variant 1, mRNA ATGCGCAGACTCAGTTCCTGGAGAAAGATGGCGACAGCCGAGAAGCAGAAACACGACGGGCGGGTGAAGA TCGGCCACTACATTCTGGGTGACACGCTGGGGGTCGGCACCTTCGGCAAAGTGAAGGTTGGCAAACATGA ATTGACTGGGCATAAAGTAGCTGTGAAGATACTCAATCGACAGAAGATTCGGAGCCTTGATGTGGTAGGA AAAATCCGCAGAGAAATTCAGAACCTCAAGCTTTTCAGGCATCCTCATATAATTAAACTGTACCAGGTCA TCAGTACACCATCTGATATTTTCATGGTGATGGAATATGTCTCAGGAGGAGAGCTATTTGATTATATCTG TAAGAATGGAAGGCTGGATGAAAAAGAAAGTCGGCGTCTGTTCCAACAGATCCTTTCTGGTGTGGATTAT TGTCACAGGCATATGGTGGTCCATAGAGATTTGAAACCTGAAAATGTCCTGCTTGATGCACACATGAATG CAAAGATAGCTGATTTTGGTCTTTCAAACATGATGTCAGATGGTGAATTTTTAAGAACAAGTTGTGGCTC ACCCAACTATGCTGCACCAGAAGTAATTTCAGGAAGATTGTATGCAGGCCCAGAGGTAGATATATGGAGC AGTGGGGTTATTCTCTATGCTTTATTATGTGGAACCCTTCCATTTGATGATGACCATGTGCCAACTCTTT TTAAGAAGATATGTGATGGGATCTTCTATACCCCTCAATATTTAAATCCTTCTGTGATTAGCCTTTTGAA ACATATGCTGCAGGTGGATCCCATGAAGAGGGCCACAATCAAAGATATCAGGGAACATGAATGGTTTAAA CAGGACCTTCCAAAATATCTCTTTCCTGAGGATCCATCATATAGTTCAACCATGATTGATGATGAAGCCT TAAAAGAAGTATGTGAAAAGTTTGAGTGCTCAGAAGAGGAAGTTCTCAGCTGTCTTTACAACAGAAATCA CCAGGATCCTTTGGCAGTTGCCTACCATCTCATAATAGATAACAGGAGAATAATGAATGAAGCCAAAGAT TTCTATTTGGCGACAAGCCCACCTGATTCTTTTCTTGATGATCATCACCTGACTCGGCCCCATCCTGAAA GAGTACCATTCTTGGTTGCTGAAACACCAAGGGCACGCCATACCCTTGATGAATTAAATCCACAGAAATC CAAACACCAAGGTGTAAGGAAAGCAAAATGGCATTTAGGAATTAGAAGTCAAAGTCGACCAAATGATATT ATGGCAGAAGTATGTAGAGCAATCAAACAATTGGATTATGAATGGAAGGTTGTAAACCCATATTATTTGC GTGTACGAAGGAAGAATCCTGTGACAAGCACTTACTCCAAAATGAGTCTACAGTTATACCAAGTGGATAG TAGAACTTATCTACTGGATTTCCGTAGTATTGATGATGAAATTACAGAAGCCAAATCAGGGACTGCTACT CCACAGAGATCGGGATCAGTTAGCAACTATCGATCTTGCCAAAGGAGTGATTCAGATGCTGAGGCTCAAG GAAAATCCTCAGAAGTTTCTCTTACCTCATCTGTGACCTCACTTGACTCTTCTCCTGTTGACCTAACTCC AAGACCTGGAAGTCACACAATAGAATTTTTTGAGATGTGTGCAAATCTAATTAAAATTCTTGCACAATAA Download Select all
CCDS ID	CCDS3932.2

Protein Information

Protein ID	NP_006242.5
Protein Name	Protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit
Molecular Wt. (Da)	63878
Protein Sequence	>5562 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNRQKIR SLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNGRLDEKESR RLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAA PEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKICDGIFYTPQYLNPSVISLL KHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTMIDDEALKEVCEKFECSEEEVLS CLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATSPPDSFLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPR ARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSRPNDIMAEVCRAIKQLDYEWKVVNPYYLRVRRK NPVTSTYSKMSLQLYQVDSRTYLLDFRSIDDEITEAKSGTATPQRSGSVSNYRSCQRSDSDAEA QGKSSEVSLTSSVTSLDSSPVDLTPRPGSHTIEFFEMCANLIKILAQ Download Select all
Length	559
Uniprot ID	P46109
Ensembl Protein ID	ENSP00000346300

Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
T	Phosphorylation	198
T	Phosphorylation	183
Y	Phosphorylation	442;-
Y	Phosphorylation	457;-
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S	Phosphorylation	356
S	Phosphorylation	371
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T	Phosphorylation	497
S	Phosphorylation	486
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S	Phosphorylation	501
T	Phosphorylation	505
T	Phosphorylation	488
T	Phosphorylation	503
S	Phosphorylation	496
S	Phosphorylation	511
S	Phosphorylation	506
S	Phosphorylation	521
S	Phosphorylation	476
S	Phosphorylation	491
S	Phosphorylation	508
S	Phosphorylation	523
S	Phosphorylation	523
S	Phosphorylation	538
S	Phosphorylation	530
S	Phosphorylation	545
S	Phosphorylation	527
S	Phosphorylation	542
K	Acetylation	80
K	Acetylation	80
K	Acetylation	40
K	Acetylation	40

Enzyme Information

EC	2.7.11.31
Name	[hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)] kinase AMPK AMP-activated protein kinase HMG-CoA reductase kinase beta-hydroxy-beta-methylglutaryl-CoA reductase kinase [hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH2)] kinase 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase kinase 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase kinase hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase kinase hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase kinase (phosphorylating) hydroxymethylglutaryl-CoA reductase kinase reductase kinase STK29
Class	Transferases; Transferring phosphorus-containing groups; Protein-serine/threonine kinases
Sysname	ATP:[hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)] phosphotransferase
Substrate	ATP [CPD:C00002]; [hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)]
Product	ADP [CPD:C00008]; [hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)] phosphate
Reaction (IUBMB)

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
31	ACACA	1938	NP_942131.1	in vitro	7 907 095 290 013 810 000 000
1080	CFTR	3883	NP_000483.3	in vitro;in vivo	10862786
2475	MTOR	3134	NP_004949.1	in vitro	14970221
2898	GRIK2	692	NP_068775.1	in vivo	80 948 928 163 463
5208	PFKFB2	1383	NP_006203.2	in vitro	128 534 671 322 130
5894	RAF1	1265	NP_002871.1	in vitro;in vivo	1 197 195 797 106 070 000 000
29904	EEF2K	7369	NP_037434.1	in vitro;in vivo	11 500 364 147 095 500 000 000 000 000 000

Pathway Information

Pathway Name	Pathway ID
Adipocytokine signaling pathway	hsa04920
AMPK signaling pathway	hsa04152
Circadian rhythm	hsa04710
FoxO signaling pathway	hsa04068
Glucagon signaling pathway	hsa04922
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Insulin resistance	hsa04931
Insulin signaling pathway	hsa04910
Longevity regulating pathway - mammal	hsa04211
Longevity regulating pathway - multiple species	hsa04213
mTOR signaling pathway	hsa04150
Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD)	hsa04932
Oxytocin signaling pathway	hsa04921
PI3K-Akt signaling pathway	hsa04151
Regulation of autophagy	hsa04140

Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

ID	Location	Description
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Ontology Information

HPRD ID	7226
Molecular Class	Serine/threonine kinase
Molecular Function	Transcription regulator activity (GO:0030528)
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism (GO:0019219)

SNP Information

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Drug Information

Uniprot ID DrugBank ID Name Type
Q13131 DB00131 Adenosine monophosphate SmallMoleculeDrug
Q13131 DB00171 Adenosine triphosphate SmallMoleculeDrug
Q13131 DB00914 Phenformin SmallMoleculeDrug
Q13131 DB00945 Acetylsalicylic acid SmallMoleculeDrug

External Links

ArrayExpress GO
ICGC GO
Cancer3D GO
COSMIC GO
NCG GO
TSGene GO
Tumor Gene Family of Databases GO
CCDB GO
G2SBC GO
Osteosarcoma Database GO
RCDB GO

Uniprot ID	DrugBank ID	Name	Type
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