CoReCG

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General Information

Gene_Symbol	Gene_ID	Gene_Name	Chromosome	Alias
TPR	7175	Translocated promoter region (to activated MET oncogene)	1	-

Evidence
Gene
mRNA
CDS
Protein
PTM
Enzyme
PPi
Pathway
Structural
Domain
Ontology
SNP
Drug
External Links

Evidence Information

Pubmed ID	Year	Sample Information	Techniques	Mechanism	Fold Change	Remark
20089989	2010	Cell line : - Source : VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. Sample Type : CRC tumor and normal tissue No. of Sample : - Stage : -	Biochemical isolation to nano-LC-MS/MS analysis	Up-regulation	-	This genes are differenitially expressed between colorectal adenoma and Colorectal cancer tissue. CRC tissue was collected at the VU University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands.

Gene Details

Chromosome: 1; NC_000001.10 (186280784..186344457, complement)
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Gene Type	protein coding
Gene Family	-
Description	This gene encodes a large coiled-coil protein that forms intranuclear filaments attached to the inner surface of nuclear pore complexes (NPCs). The protein directly interacts with several components of the NPC. It is required for the nuclear export of mRNAs and some proteins. Oncogenic fusions of the 5' end of this gene with several different kinase genes occur in some neoplasias. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Chromosome	1
Location	1q25
Start	186311652
End	186375848
Strand	+
Gene Sequence	>gi\|568815597:c186375848-186311652 Homo sapiens chromosome 1, GRCh38.p2 Primary Assembly CTGAATTCATCAGAAAGCGACCTACTTCCCACACCTCACTTCCCACTCCAAAGCCAGGGACTTGGGAGTC AGGTGGCGCAGATTGATGACGTAAAAGCCCCCCCTCCCTTCCCCGCAGAGCCTCAGCCAAAGCGACTGCG GTCGCCACCCCGCCCCCTTCTGGGCGCCATAGAGAGCGTGGCGGTATCCCGGAGCCTGCCGTCCGGCCCT ACCGGGACCGATGCCCTCTAGTGGCTCAGTGTCCAGAAGCCGCCAACGAGGACGATCCATGGCATCCCGG GGCTTTGACGGTAAGGTCACCAGCTCTTCAGGGAGGGCCAAGGGGTGACGAGTACGTATGTGGCGCCACC GTGCGGACAGCGGTTACGGGGCCGAGATAGGAGAGCCAGGGGAGCGGGGAGAAAAACGGAAGCTGAGAGG GCGGTGCAGCATTGGGCTCCCGGAAAAGAATGAGAAAAACACTACATTTCCCAGAGCCCTACAAGGCCTG AAGTGGGTGGAGCTGGAAGCCGGAAAATTGGGTGCGCAAGAGGATCAGGGATAGCCTCTGAGCTCGGGTT CCCAGGGTTCGTAGCTTCCAACGGCTGCGCGCGCACTTCGGTCGCGGGCGGTGAGGTGCTGTTGCTGAAA CGCTGCCGCTGAGGGTGGACTCGATTTCCCAGGGTCCCGCCGCGGGAGTCTCCGGCGGGCGGGCGCGCGC GAGCCACCGAGCGAGGTGATAGAGGCGGCGGCCCAGGCGTCTGGGTCCTGCTGGTCTTCGCCTTTCTTCT CCGCTTCTACCCCGTCGGCCGCTGCCACTGGGGTCCCTGGCCCCACCGACATGGCGGCGGTGTTGCAGCA 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CDS Information

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CCDS ID	CCDS1369.1

Protein Information

Protein ID	NP_003283.2
Protein Name	Translocated promoter region (to activated MET oncogene)
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Protein Sequence	>7175 MAAVLQQVLERTELNKLPKSVQNKLEKFLADQQSEIDGLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSHS QERLVNETRECQSLRLELEKLNNQLKALTEKNKELEIAQDRNIAIQSQFTRTKEELEAEKRDLI RTNERLSQELEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVSVKYREKRLEQEKELLHS QNTWLNTELKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVSRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVED LLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVEELHKLLKEAGEA NKAIQDHLLEVEQSKDQMEKEMLEKIGRLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAA VAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKLENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQ KAVASLSVKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKQSSVLERDNRRMEIQVKDLSQQIRVLLMELEEARG NHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLVALRELGETREREEQETTSSKI TELQLKLESALTELEQLRKSRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGVAIPLHASSLDDVSLAS TPKRPSTSQTVSTPAPVPVIESTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKAENEKIQNEQLEKLQEQV TDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLHERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLR GANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETE TKQRLSSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTETNLHLNTKELLKN AQKEIATLKQHLSNMEVQVASQSSQRTGKGQPSNKEDVDDLVSQLRQTEEQVNDLKERLKTSTS NVEQYQAMVTSLEESLNKEKQVTEEVRKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRR AIESMEQQLSELKKTLSSVQNEVQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELML HAADVEALQAAKEQVSKMASVRQHLEETTQKAESQLLECKASWEERERMLKDEVSKCVCRCEDL EKQNRLLHDQIEKLSDKVVASVKEGVQGPLNVSLSEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEV AQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNAEREKVQVTAKTMAQHEELMKKTETMNVVMETNKMLR EEKERLEQDLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKKLLEEDVKRWKARNQHLVS QQKDPDTEEYRKLLSEKEVHTKRIQQLTEEIGRLKAEIARSNASLTNNQNLIQSLKEDLNKVRT EKETIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQYEELKAQQDKVMETSAQSSGDHQEQHVS VQEMQELKETLNQAETKSKSLESQVENLQKTLSEKETEARNLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDRT TQEEQLRQQITEKEEKTRKAIVAAKSKIAHLAGVKDQLTKENEELKQRNGALDQQKDELDVRIT ALKSQYEGRISRLERELREHQERHLEQRDEPQEPSNKVPEQQRQITLKTTPASGERGIASTSDP PTANIKPTPVVSTPSKVTAAAMAGNKSTPRASIRPMVTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEA MQSEGPVEHVPVFGSTSGSVRSTSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPANQE LSSNIVEVVQSSPVERPSTSTAVFGTVSATPSSSLPKRTREEEEDSTIEASDQVSDDTVEMPLP KKLKSVTPVGTEEEVMAEESTDGEVETQVYNQDSQDSIGEGVTQGDYTPMEDSEETSQSLQIDL GPLQSDQQTTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDDEEEDDDENDGEHEDYEEDEEDDDDDEDDTGMGDE GEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGGEGNHRAADSQNSGEGNTGAAESS FSQEVSREQQPSSASERQAPRAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQMTRRQSVGRG LQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTS SSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQS VPMVTTSTGTLSTTNETATGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTS QDPPSSSSVDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGVSHAMGGRGGINRGNIN Download Select all
Length	2363
Uniprot ID	P40879
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Post-translational Modification Information (Source : HPRD)

Residue	Type	site
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S	Phosphorylation	530;-
S	Phosphorylation	523;-
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S	Phosphorylation	523;-
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S	Phosphorylation	529;-
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S	Phosphorylation	379
S	Phosphorylation	379
S	Phosphorylation	648
S	Phosphorylation	648
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S	Phosphorylation	652
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T	Phosphorylation	653
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S	Phosphorylation	1462
S	Phosphorylation	1459
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T	Phosphorylation	1666
T	Phosphorylation	1666
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S	Phosphorylation	1691
S	Phosphorylation	1676
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T	Phosphorylation	1677
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S	Phosphorylation	1838
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T	Phosphorylation	1839
S	Phosphorylation	2048
S	Phosphorylation	2048
S	Phosphorylation	522
S	Phosphorylation	522
S	Phosphorylation	646
S	Phosphorylation	646
S	Phosphorylation	2047
S	Phosphorylation	2047
S	Phosphorylation	1804
S	Phosphorylation	1804
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S	Phosphorylation	1725
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K	Acetylation	723
K	Acetylation	723
K	Acetylation	713
K	Acetylation	713
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K	Acetylation	428
K	Acetylation	748
K	Acetylation	748
K	Acetylation	457
K	Acetylation	457
K	Acetylation	252
K	Acetylation	252
K	Acetylation	345
K	Acetylation	345
K	Acetylation	312
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S	Phosphorylation	2054
S	Phosphorylation	2054
S	Phosphorylation	1847
S	Phosphorylation	1847
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S	Phosphorylation	2178
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S	Phosphorylation	135
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T	Phosphorylation	1390
S	Phosphorylation	1398
S	Phosphorylation	1385
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T	Phosphorylation	1458
T	Phosphorylation	1458
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T	Phosphorylation	1692
T	Phosphorylation	647
T	Phosphorylation	663
T	Phosphorylation	647
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T	Phosphorylation	740
T	Phosphorylation	740

Enzyme Information

No matching records could be found.

PPi Information

(Click to view network : Source STRING) View

Interactant Gene ID (Source: HPRD)	Gene Symbol	HPRD ID	Ref Seq ID	Technique	References
3428	IFI16	969	NP_005522.2	in vivo;yeast 2-hybrid	12513910
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Pathway Information

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Structure Information

No matching records could be found.

Domain Information

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PRK02224	970-1551	PRK02224
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PRK00409	57-179	PRK00409
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Ontology Information

HPRD ID	2604
Molecular Class	Unclassified
Molecular Function	Cell adhesion molecule activity (GO:0005194)
Biological Process	Cell growth and/or maintenance (GO:0008151)

SNP Information

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Drug Information

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Mechanism	Up-regulation
Biomarker	-
Drug Target	-
Biological Process	Regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism